作者:蒋向辉; 舒安镕; 潘锦媚; 刘湘韩; 郑丽芝; 赵程晟 期刊:《怀化学院学报》 2019年第11期
以20种高等植物SOD基因编码区序列(CDS)为参考,进行基因流特性与亲缘关系分析.通过下载20个物种SOD基因的完整CDS序列,并分析其单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性、平均核苷酸差异数目及单一多态位点和简约多态位点等信息,建立系统进化树;分析其氨基酸结构域并预测跨膜结构域;再分析SOD基因所编码蛋白质的氨基酸数量、组成及部分理化性质.研究结果表明:SOD基因在种内及种间遗传分化较明显.由系统进化树可知,各物种种间的遗传进...
作者:刘丽霞; 张丽; 欧阳霞辉; 乔自林; 付保强 期刊:《核农学报》 2019年第11期
为探讨荷斯坦牛DRA基因的多态性及序列特征,本研究采用基因组DNA混合池扩增并直接测序的方法对荷斯坦牛DRA基因编码区进行多态性分析,同时利用生物信息学方法预测DRA基因的理化特性及其编码蛋白的高级结构。结果表明,荷斯坦牛DRA基因编码区上有4个碱基突变,包含1个错义突变和3个同义突变。DRA基因共编码253个氨基酸,编码产物是一种稳定的不可溶蛋白,具有15个潜在的磷酸化位点,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和...
作者:胡露露; 赵子雅; 王瑞宁; 王亚琪; 刘铮铸; 巩元芳; 李祥龙; 彭永东 期刊:《畜牧与兽医》 2019年第08期
为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7...
作者:敖金霞; 李辉; 王启贵; 王宇祥; 唐志权 期刊:《农业生物技术学报》 2004年第05期
根据鸡的生长激素基因(GH)序列设计引物对鹅总RNA进行RT-PCR反应,将扩增片段进行克隆和测序。结果获得了包括从ATG开头到TGA结尾的651bp的鹅GH基因编码区序列。鹅与鸡的GH基因的编码区高度保守,同源性达92%,演译成氨基酸后同源性达96%;与人和鼠GH基因编码区序列同源性分别为63.81%和74.31%,演绎成氨基酸后同源性分别为52.51%和72.81%。同时用RT-PCR和Northern-blot对鹅12种组织表达差异分析表明鹅GH基因只在垂体和...
作者:侯宁; 王剑; 李文龙; 张继帅; 杨晓 期刊:《生物技术通讯》 2005年第03期
我们曾经报道了分别在心脏(α-MHC-Cre)和软骨细胞(Col2A1-Cre)特异性表达Cre重组酶转基因小鼠的成功研制.为了对这2种转基因小鼠进行特异性的基因型鉴定,设计了2对特异性PCR引物,其中一条引物分别位于α-肌球蛋白重链基因(α-MHC)启动子和Ⅱ型胶原(Col2A1)启动子上.以6种不同组织特异性Cre重组酶转基因小鼠基因组DNA为模板,利用设计的特异性引物以及位于Cre编码区的通用引物进行PCR反应.结果显示,2对特异性引物可以分别将心肌细胞特...
作者:夏邦世; 沈忠海; 马红松; 朱金明 期刊:《中华检验医学》 2004年第09期
乙型肝炎病毒(HBV)基因组表面抗原(HBsAg)编码区(S区)由S、前S1和前S2基因组成,分别编码S、前S1和前S2三种主要蛋白,从而共同构成HBV外壳蛋白[1].作为一项新的HBV血清学检测指标,乙型肝炎病毒前S1抗原(HBV preS1-Ag)的检测已被普遍应用于乙型肝炎的实验室诊断和疗效观察.我们对310份慢性乙型肝炎患者血清进行了HBV preS1-Ag、HBV-M、HBV-DNA及丙氨酸氨基转移酶(ALT)、门冬氨酸氨基转移酶(AST)联合检测,进而分析探讨这些指标之间的...
作者:冯凯; 周钢桥; 翟芸; 朱佩芳; 王正国; 贺福初; 蒋建新 期刊:《中华医学遗传学》 2004年第04期
目的检测中国人白细胞介素-1 Ⅰ型受体基因(interleukin-1 receptor type Ⅰ,IL-1)调控区和编码区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并初步探讨其可能对中国人IL-1R1的功能影响.方法采用直接测序的方法检测基因的5'区、编码区、部分内含子区和3'区,以确定中国人群中 IL-1R1基因SNP的位置和类型,用生物信息学方法对编码区SNP的功能进行了预测.结果在9643 bp的测序长度中,共发现了16个SNP,包括5'区4个,内含子...
作者:付丽红; 姚玉霞; 丛斌; 李淑瑾 期刊:《中华医学遗传学》 2004年第05期
目的了解河北汉族群体线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA) HV1、HV2区重叠片段及编码区8430-8673nt的序列多态性.方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性结合测序方法对100名河北汉族个体进行单倍型分布调查.结果在河北汉族100名健康无关个体中,共分出91种单倍型.遗传变异度为0.9985,耦合概率为0.0115.测序结果与Anderson序列比较,共检测出65个变异位点,44个与MITOMAP收录的基因突变相同,9个与所收录的不同,12个未见收录.结论线粒...
作者:Bouwman; L.H.; Roos; A.; Terpstra; O.T.; 陈瑜 期刊:《世界核心医学期刊文摘·妇产科学分册》 2005年第11期
近期,美国经济创新组织(Economic Innovation Group)了一项报告,统计了美国上千个邮政编码区在2007-2011年“经济衰退期”和2012-2016年“经济复苏期”两个时期收入,职业、教育水平等指标,最后综合为困境社区指数(DCI:Distressed Communities Index).
英国皇家邮政最近启用计算机联网打印的电子邮票系统。英国Norvc Philatelics集邮网站(www.norvic-phitatelics.co.uk)专文对这一系统进行了介绍。笔者获得该网站授权译介此文,略有增删。英国皇家邮政于2004年1月15日启用称为“聪明邮
作者:黄蕤; 余海放; 匡安仁 期刊:《华西医学》 2004年第04期
目的:获取、构建并鉴定携带人钠/碘同向转运体(NIS)基因的pGEMTeasy质粒载体.方法:利用逆转录和聚合酶链反应(RT-PCR)获取Graves甲亢病人甲状腺NIS基因可编码区片段,与pGEMTeasy质粒载体连接、经转化、蓝白斑筛选、酶切鉴定,获得pGEMTeasy-NIS重组质粒,进行序列测定鉴定.结果:所构建的pGEMTeasy-NIS重组质粒中NIS与文献报告序列99%同源性.结论:成功构建pGEMTeasy-NIS重组质粒.
作者:王鹏; 侯德彧; 施力光; 吴科榜 期刊:《黑龙江畜牧兽医》 2018年第19期
为了研究儋州鸡FSHβ基因单核苷酸多态性(SNP),试验采用PCR产物直接测序法,对60份儋州鸡DNA样本的FSHβ基因进行PCR扩展和双向测序,对测序结果组装后使用DNAMAN软件进行比对,人工核对后筛查SNP位点。结果表明:PCR扩增均能得到与预期相符的清晰条带;测序结果与GenBank中登录的原鸡FSHβ序列比对显示,为儋州鸡FSHβ基因的片段;SNP位点筛查显示,儋州鸡FSHβ基因中含有25个SNP位点,即C-130T、A-332C、T-439C、G-591A、C-956A、G-1 233A、...
作者:王菊萍; 王莹; 霍艳英; 郭蔼光; 张开泰 期刊:《内蒙古农业大学学报·自然科学版》 2004年第04期
本文旨在探讨小干涉RNA(siRNA)对靶基因Smad7 mRNA表达的阻断作用.用体外转录方法制备Smad7基因的小干涉RNAs(siRNAs),脂质体介导瞬时转染BERP35T-2肺癌细胞系,Northem blot杂交检测靶基因mRNA 的表达丰度.根据Smad7编码区序列在体外成功地制备了针对两个不同靶序列的siRNAs,Northem blot杂交显示,在转染siRNA和BERP35T-2细胞中,不管是内源性的还是外源性的Smad7 mRNA的表达丰度均明显下降,Smad7基因编码区中542bp~563bp及701bp~...
作者:陈磊; 倪文浩; 李雯雯; 李欣毅; 李文蓉 期刊:《西北农业学报》 2018年第07期
旨在克隆绵羊TGFβ2(Transforming growth factor-β2)基因CDS,解析其序列及编码蛋白的生物学特性,为绵羊生产利用提供理论基础。采用PCR技术克隆获得TGFβ2基因的CDS,并进行生物信息学分析。结果表明:绵羊TGFβ2基因的CDS长度为1 329bp,编码442个氨基酸;其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2由于CDS部分缺失分别编码331和414个氨基酸。绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2编码蛋白的理论等电点分别为8.74、7.60和8.82,均存在...
作者:杜红坚; 程焱 期刊:《中华神经科》 2004年第04期
载脂蛋白E(ApoE)基因与阿尔茨海默病(Alzheimerdisease,AD)关系密切.在ApoE基因的启动子区存在着多个位点的多态性,由于这些位点距ApoE基因编码区非常近,因而其多态性可能与AD的发病有关.为此我们对启动子区-491A/T,-427T/C两位点多态性与AD的关系进行了研究.
作者:蔡姝冰; 贾伟平; 方启晨; 邵新; 张蓉; 项坤三 期刊:《中华内分泌代谢》 2004年第04期
目的对中国肥胖人群进行黑皮素4受体(MC4R)基因全长(包括编码区及侧翼区)进行筛查,以了解中国人该基因突变的情况.方法选取BMI≥30 kg/m2的无亲缘关系的上海地区中国人256例,用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对MC4R基因全长进行筛查,对异常片段进行测序.用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对320名健康对照者进行相应位点的突变检测.结果肥胖患者中发现MC4R一种错义突变,第261位氨基酸发生Phe261Ser改变,即...
作者:吕文发; 赵静; 单雪松; 王恒; 吴伟 期刊:《畜牧兽医学报》 2005年第06期
根据GenBank中鸡卵泡抑制素α亚基序列设计引物,对该序列按大肠杆菌嗜好密码子进行优化,在设计的引物两端分别加上限制性内切酶SacⅠ和XhoⅡ的识别位点序列.利用RT-PCR技术从溆浦鹅卵泡的颗粒细胞总RNA中扩增出抑制素α亚基成熟区序列,经PCR扩增出354 bp片段,该片段与pMD18-T载体连接,转化JM109感受态细胞,所得阳性克隆进行双酶切鉴定和PCR鉴定,并进行了测序分析,得到的克隆序列与设计的序列基本一致.表明成功地获得了抑制素α亚基编...
作者:白霞; 周金林; 程天印; 周勇志; 刘毅 期刊:《畜牧兽医学报》 2005年第01期
从微小牛蜱克隆到1个新的铁蛋白编码基因,cDNA全长642bp,编码区为123-639bp,编码172个氨基酸残基,该蛋白预测的分子量为19.9ku,等电点为4.24.经过分析,其预测氨基酸序列与已报道的变异革蜱、非洲钝缘蜱和蓖子硬蜱铁蛋白同源性分别为93.60%、88.37%和83.72%.且核苷酸序列在mRNA 5'未翻译区(5'UTR)的茎环结构存在铁应答元件(IRE),其氨基酸序列上带有典型的亚铁氧化酶中心结构的保守序列.RT-PCR分析表明,该基因在微小牛蜱卵、幼蜱、半...
作者:蒋红玲; 陈巨莲; 倪汉祥; 程登发 期刊:《植物保护学报》 2005年第01期
根据所有已知G蛋白亚基的保守区设计简并性寡核苷酸引物,通过3'-和5'-RACE方法结合RT-PCR技术,从麦长管蚜中分离全长cDNA序列,并用半定量RT-PCR的方法研究基因在不同组织的转录水平.克隆的β亚基序全长1336bp,编码340个aa,推测的分子量为37.27kDa,等电点为5.56.GenBank BLAST结果表明,β亚基与冈比亚蚊Anopheles gambiae的氨基酸序列同源性最高,为93%,与果蝇Drosophila melanogaster β的同源性为90%,与线虫Caenorhabditis elegans 的...