杂志简介:《科研信息化技术与应用》杂志经新闻出版总署批准,自2008年创刊,国内刊号为10-1649/TP,是一本综合性较强的计算机期刊。该刊是一份双月刊,致力于发表计算机领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目:技术与应用、管理决策与智能应用专刊、专刊:下一代互联网络技术与应用(下)、专题:区块链技术与应用、区块链技术与应用专刊、专题:高性...
作者:张天文; 李新亮; 张鉴; 陆忠华 刊期:2015年第05期
在众核处理器应用中,主要难点在于异构并行应用模式和负载均衡的策略,对于计算流体力学,需要针对相关应用设计相应的方案。我们针对湍流直接数值模拟中串行程序含有部分并行度较高的子程序或函数的特点,设计了一种新的并行计算模式,给出了一种异构平台优化方案,并在中科院超级计算系统"元"上进行了测试和分析,对领域内的典型算例进行了性能测...
作者:沈瑜; 李会民; 刘晓辉 刊期:2015年第05期
ABACUS是中国科学技术大学中国科学院量子信息重点实验室自主研发的新型基于密度泛函和数值原子轨道基组的第一性原理计算软件包,在该软件中需要使用格点积分来计算局域势和电子密度,这两部分的计算是程序运行中主要耗时的部分。我们采用了内存池和高性能数学库对这两部分进行了优化,最终使得程序对内存带宽和CPU高级矢量扩展的利用率有了大幅提...
作者:康祖彬; 张鉴; 迟学斌 刊期:2015年第05期
我们将一种快速稳定的紧致指数时间差分法应用于求解Cahn-Hilliard方程,并采用多步逼近法和龙格库塔方法有效地解决了方程中的非线性项带来的稳定问题。通过与经典的半隐式欧拉方法对比,分别对不同体自由能模型和不同扩散迁移率下的相场方程求解进行收敛性测试,验证了算法的正确性和高效性。最后我们用提出的方法对Flory-Huggins模型的粗化率进...
作者:黄盛林; 王恩海; 何燕玲; 王伟 刊期:2015年第05期
准确的流量分类是解决网络拥塞、网络安全监管、流量计费等研究的基础。为了解决在线混合流量(加密与非加密)一次性快速分类问题,本文结合传统特征提取和载荷特征提取的优点,提出五元组加载荷ASCII出现频次的特征提取,并以此提出一种在线流量快速分类方法。实验表明,在相同算法下,使用本文的特征提取比使用载荷特征提取,整体分类准确率提高了...
作者:邬萍; 孟晨; 王龙 刊期:2015年第05期
WENO(weighted essentially non-oscillatory)是计算流体力学中广泛采用的一种高阶数值格式。由于算法本身和异构计算编程的复杂性,需要开展异构计算代码自动生成的研究,以加速更多的应用。本文基于Physis这一领域编程语言框架,针对三维五阶WENO计算的天文应用,实现了其异构代码的自动生成。在超级计算机"元"上的测试结果表明,自动生成的异...
作者:任清福; 孙清岚; 马俊才 刊期:2015年第05期
在当前的微生物领域,基于16S rR NA基因序列的分析仍然是一个重要方法,其不仅用于研究微生物多样性,而且也用于探索原核生物分类与鉴定。在本研究中,我们构建了一个参考数据集,该参考数据集包含所有原核微生物中属于被有效发表的种名的标准菌株的16S rR NA基因序列和对这些种名的系统分类。基于此参考数据集,我们开发了一个微生物快速分类工具,...
作者:柴芳姣; 刘利萍; 迟学斌 刊期:2015年第05期
我们运用数据库技术构建了一套基于Web的超级计算用户服务管理系统,这一系统结合中科院超级计算中心用户服务的实际需求及特点,克服以前只有人工服务模式的缺点,实现了适合中科院超级计算中心业务模式的用户自服务。该系统是一个综合性智能化的超级计算用户服务管理系统,为超级计算用户提供了方便、高效、易用的平台,同时也便于管理者有效地管理...
作者:刘琳羽; 南凯 刊期:2015年第05期
平台即服务(Paa S)作为云计算的三种服务模型之一,为应用程序提供运行环境,并将应用的部署和依赖关系管理起来,极大的方便了应用开发者。Docker基于LXC的轻量虚拟化特点,启动速度快且占用资源少,为PaaS的构建提供了良好的支持。本文分析了Docker的特点,设计了一种基于Docker的开发者服务平台,为开发者提供代码托管、编译和运行环境等服务。实...
作者:杨哲睿; 高娜; 刘梁 刊期:2015年第05期
现代天文学发展迅速,天文数据呈现指数级增长。GPU高性能通用计算架构为完成海量天文数据科学计算和处理提供了有效的途径。紫金山天文台在高速安全的IPv6网络环境的基础上,建设部署了总计算峰值达到350TFlops,总存储量达到288TB的大规模天文数据分析及多维信息可视化平台。该超算集群由1个管理节点、25个计算节点和5个存储节点构成,使用界面友...
作者:刘利萍; 陆忠华 刊期:2015年第05期
2015年10月10日,在广州举办的第五届中国科学院超级计算应用大会(SCA2015)上,中国科学院超级计算中心了2014年度中国科学院超级计算发展指数(CAS SCDI),该指数的评价指标数据基于自主开发的"CAS SCDI数据收集系统"Web在线收集,院超级计算环境用户群体中共计133个课题组提交了超级计算应用成果。