科研信息化技术与应用杂志 CSCD期刊
Frontiers of Data&Computing
杂志简介：《科研信息化技术与应用》杂志经新闻出版总署批准，自2008年创刊，国内刊号为10-1649/TP，是一本综合性较强的计算机期刊。该刊是一份双月刊，致力于发表计算机领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：技术与应用、管理决策与智能应用专刊、专刊:下一代互联网络技术与应用(下)、专题：区块链技术与应用、区块链技术与应用专刊、专题：高性...
杂志简介：《科研信息化技术与应用》杂志经新闻出版总署批准，自2008年创刊，国内刊号为10-1649/TP，是一本综合性较强的计算机期刊。该刊是一份双月刊，致力于发表计算机领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：技术与应用、管理决策与智能应用专刊、专刊:下一代互联网络技术与应用(下)、专题：区块链技术与应用、区块链技术与应用专刊、专题：高性...
作者：黎雷生; 田荣 刊期：2013年第05期
petaPar粒子模拟程序面向千万亿次级计算，在统一框架下实现两种广受关注的粒子模拟算法：光滑粒子流体动力学（SmoothedParticleHydrodynamics，SPH）和物质点法（MaterialPointMethod，MPM）。代码支持多种材料模型、强度模型和失效模型，适合模拟大变形、高应变率和流固耦合问题。支持纯MPI和MPI＋X混合两种并行模型。系统具有可容错性，支持...
作者：全亚民; 刘大勇; 邹良剑 刊期：2013年第05期
本文建立了基于模式搜索法的非线性边界约束条件下多参数函数的优化算法。通过综合模式搜索法、最速下降法和转轴法解决了在高维空间中的优化算法和非线性边界约束的算法问题。同时使用广义拉格朗日乘子法解决了非线性等式约束条件的计算方法。通过在四轨道隶玻色子模型计算中的应用，验证了该计算方法的有效性。由于该方法综合了多种经典优化算...
作者：刘夏真; 马文鹏; 张鉴; 陆忠华 刊期：2013年第05期
结构网格具有网格生成速度快、质量高、数据结构相对简单、较适用于流体表面应力集中的运算等优点。在大规模CFD（Computational FluidDynamics）并行计算中，需要将网格区域划分为多块网格，而多块网格之间的数据通信会制约并行计算能力的提高，因此对结构网格的负载平衡优化是提高并行计算能力的重点。本文提出了一个采用多层次k-way多约束条...
作者：彭丰斌; 张慧玲; 魏彦杰; 冯圣中; 殷志祥 刊期：2013年第05期
蛋白质折叠研究对于揭示蛋白结构和功能关系，进而了解相关疾病的致病机理意义重大。蛋白质折叠已被证明是NP一完全问题。本文针对蛋白质折叠研究中的能量最小化问题，提出了一种新的并行群体模拟退火算法（ParallelGroupSimulatedAnnealing，PGSA）及其改进型算法（PGSA_l／K）。该算法使用了降温因子加速收敛精度，并采用MPI消息传递并行编程...
作者：刘玉环; 王小宁; 肖海力; 迟学斌; 张阔 刊期：2013年第05期
在科学计算云服务环境中，出于安全和管理的角度考虑，客户端与计算节点间的数据传输需要经过多个中间服务器进行中转。为此，我们基于SFTP（SecureFileTransferProtoc01）协议设计并实现了一个数据中转传输系统MCP，使用文件传输模式进行不落地式中转，实现经多个中间节点的数据中转传输，保证了数据访问的合法性和传输的安全性，数据传输进度...
作者：李中武; 谭伟伟; 周磊 刊期：2013年第05期
针对民机增升构型失速特性的数值模拟，我们基于贪婪负载平衡算法的剖分工具对多块结构网格进行区域分割，在某新型超级计算机系统上完成求解软件的移植、优化和测试，采用2亿量级的计算网格开展大规模并行计算研究，测试完成了万核级负载平衡的网格区域分割，实现了增升构型失速特性的4096核数并行计算，并行效率达到50％以上，提高了工程应用...
作者：孟金涛; 苑建蕊; 魏彦杰; 冯圣中 刊期：2013年第05期
随着新一代测序技术的发展，一些新的全基因组组装算法应运而生，特别是针对第三代高通量测序仪产生的海量短序列的组装软件被不断开发出来，这些组装软件渐渐走向市场。但是，由于这些组装软件的适用性和其性能的差别，选择一款性能优良的组装工具或者开发并行高吞吐的组装工具成为了当前面临的一大难题。本文选取基于DeBruijn图算法开发的4款D...
作者：崔丹丹; 张耀南; 赵国辉 刊期：2013年第05期
遥感传感器和计算机技术的发展，每天都会汇集大量新的地理空间数据。地球科学许多应用要求数据实时或接近实时地处理，发展高性能计算是进行海量数据处理的必然趋势。本文以TM影像制备黑河流域归一化指数产品为例，基于高性能集群，实现了植被指数快速提取的并行计算方法，并采用对等并行编程模式，通过C语言调用MPI（MessagePassingInterface...
作者：叶钦巴图; 胡晓东; 张鉴; 陆忠华; 李新亮 刊期：2013年第05期
我们将目前计算流体力学中比较流行的高精度WENO（wei曲tedEssentiallyNon-Oscillatory）格式引入到大规模并行计算求解中，使用隐式WEN03阶格式和WEN05阶格式对ONERA-M6翼型和DLR-F6机身／机翼以及DLR-F6机身／机翼／发动仓／吊架模型进行了模拟测试。并行规模从64核到1024核。通过数值计算结果和实验结果的对比分析，得出WENO格式在大规模并行...
作者：郑小宏; 兰杰; 郝华; 曾雉 刊期：2013年第05期
分子器件中的第一性原理输运计算比普通的密度泛函计算要慢很多，其最根本原因在于密度矩阵计算方法的不同。本文将GPU加速应用于第一性原理的输运计算，重点实现相关矩阵运算的加速。测试结果表明，在单次迭代中，对于较大的体系，相对于调用MKL库，密度矩阵的运算速度在单个TeslaM2090可以提高一个数量级以上，在TeslaK20m上则可以提高20倍以...
作者：赵芸卿 刊期：2013年第05期
本文以中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心（以下简称超级计算中心）客户服务工作为研究对象，运用K-means算法对客户进行细分，进而对每类客户群提出相应的差异化服务策略。实施差异化服务策略可以更好地分配资源、提供更有效的客户服务。
作者：张平; 赵增芳; 徐军; 李国民 刊期：2013年第05期
绿色技术的应用是数据中心建设过程中不可忽视的基本原则，本文就中国科学院超级计算青岛分中心部署的水冷系统和自然风冷系统做了较为全面的介绍，两套系统在机房运维过程中节约了大量的能源，取得了较好的应用效果。
作者：刘利萍; 陆忠华 刊期：2013年第05期
2013年8月16日，在安徽黄山举办的第三届中国科学院超级计算应用大会（SCA2013）上，中国科学院超级计算中心了2012年度中国科学院超级计算发展指数（CASSCDI）山，该指数的评价指标数据基于自主开发的“CASSCDI数据收集系统”Web在线收集，院超级计算环境用户群体中共计122个课题组提交了超级计算应用成果。
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