作者:刘海涛; 吕秋艳; 赵香菊; 王晨旭 期刊:《首都公共卫生》 2019年第06期
目的应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对一起食源性疾病事件检出的肠炎沙门氏菌菌株进行溯源检测,明确该起事件肠炎沙门氏菌菌株的同源性。方法参照GB4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》国标方法,对采集标本进行致病菌分离、鉴定,并应用PFGE检测技术对检出的肠炎沙门氏菌进行分子分型检测,使用BioNumerics软件进行聚类分析。结果该起食源性疾病事件共检出3株肠炎沙门氏菌,3株肠炎沙门氏菌血清学实验结果一...
作者:王鹏; 马红梅; 李颖; 王新田; 张彦春; 张赫 期刊:《首都公共卫生》 2019年第06期
目的对一起多因素引起腹痛、腹泻聚集事件调查中采集的样本进行致病菌检验,利用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)从分子水平对该起事件的病原学进行回顾性分析。方法依据相关标准对采集的样品进行病原菌分离、鉴定,选用SmaⅠ酶切事件中分离的可疑致病菌株,对菌株进行聚类分析。结果从44件可疑样品中检出蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus,Bc)17株,对可疑食品中分离的10株蜡样芽胞杆菌进行PFGE分子分型检测,其中7株为相同带型。结论 PFGE图谱佐...
作者:周涛; 倪文玲; 倪刚; 徐晋莹; 吴春梅; 李青; 谈星延 期刊:《食品安全质量检测学报》 2019年第22期
目的了解红河州2011~2018年食品中沙门氏菌血清型分布及分子分型特征,初步建立沙门氏菌脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型的数据库。方法使用全自动微生物鉴定系统对收集的49株沙门氏菌进行鉴定,依据沙门氏菌White-Kauffmann-LeMinor抗原表用沙门氏菌属诊断血清确定血清型,参照国家食源性疾病分子溯源网络(TraNet)的沙门氏菌P F G E分子分型法进行基因分型,用Bi〇mimeriCS(7.6)软件聚类分析。结果49株沙...
作者:李康; 黄洋; 徐潇; 陈琼; 王春娥; 石继春; 陈翠萍; 叶强 期刊:《微生物学免疫学进展》 2019年第06期
目的明确19群肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)国家标准菌株的分子特征,为完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据。方法在传统肺炎链球菌菌种检定方法的基础上,应用16S rRNA基因分析、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence type,MLST)和脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型等多种分子生物学质控方法,对来源于中国医学细菌保藏管理...
作者:肖波; 陶顺; 徐洪琳; 李淋; 陈曦 期刊:《职业卫生与病伤》 2019年第05期
目的对发生在自贡市某县的一起食物中毒事件进行病原分离鉴定及同源性分析。方法按照GB4789.4-2016和WS271-2007进行病原菌的分离鉴定。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对分离到的鼠伤寒沙门氏菌进行分子分型。结果在1份粪便样本,1份患者肛拭子样本和6份食物样本中检出鼠伤寒沙门氏菌;分离到的8株鼠伤寒沙门氏菌经脉冲场凝胶电泳得到同一种带型,图谱相似度为100%。结论结合流行病学调查资料、临床诊断,确认此次食物中毒由同一克隆鼠...
作者:张睿; 陈建才; 赵雪琴 期刊:《中国卫生检验》 2019年第22期
目的了解杭州市某区星级酒店集中空调系统军团菌优势菌群和优势基因特征。初步建立军团菌PFGE分型数据库,为该地区军团菌分子流行病学调查提供重要依据。方法采用传统的血清分型结合PFGE聚类分析的方法,应用BioNumerics 6.0软件进行聚类分析。结果75株军团菌,血清分型结果嗜肺军团菌6种、非嗜肺军团菌3种,其中88%为嗜肺军团菌(66/75),以LPl型为主。来源为冷却水占85.33%(64/75),冷凝水仅占14.67%(11/75)。经聚类分析分为39种PFGE型...
作者:严寒秋; 李夫; 吕冰; 黄瑛; 张新; 贾蕾; 周海健; 曲梅; 王全意 期刊:《疾病监测》 2019年第09期
目的了解2018年北京市O1群霍乱弧菌表型及分子分型特征。方法 2018年收集北京市霍乱患者和外环境分离的29株霍乱弧菌,应用常规鉴定方法进行血清分型,荧光定量PCR检测霍乱弧菌ctxAB基因,应用96孔微量肉汤稀释法进行药物敏感试验(11类21种试验药物),应用NotⅠ及ShifⅠ酶切进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 29株O1群霍乱弧菌中小川型非产毒株、稻叶型非产毒株和小川型产毒株构成比分别为62.07%(18/29)、24.14%(7/29)和13.79%(4...
作者:王磊; 陈琼城; 胡璐璐; 邱亚群; 林一曼; 江敏; 姜伊祥; 石晓路; 扈庆华; 李迎慧 期刊:《疾病监测》 2019年第10期
目的通过比较多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,探索更优的致泻性大肠埃希菌(DEC)的快速溯源方法。方法本研究采用筛选的可变数目串联重复序列(VNTR)位点,对DEC菌株进行MLVA分型,并将该方法与金标准PFGE进行比较评估。结果PFGE分型方法将58株DEC分为43种带型,其中3种带型成簇,多样性指数(DI)值为0.965。MLVA分型方法将58株菌分为42种带型,4种型别成簇,DI值为0.955。此外,2种方法对2起暴发菌株...
作者:周凤岩; 凤淳雅; 郭世杰; 陶娜 期刊:《中国生物制品学》 2019年第09期
目的运用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术,分析吉林地区2014~2018年食源性疾病患者粪便样本中分离的肠炎沙门菌(Salmonella enteritidis)的同源性及分子流行病学特征,为鉴定溯源及防控预警提供数据支持。方法对吉林地区2014~2018年食源性疾病患者1 000份粪便样本中分离的肠炎沙门菌进行鉴定,确定血清型及PFGE分子分型,采用Bio Numerics version 6. 6软件对PFGE图谱进行数据分析,绘制聚类树状图。结果分...
作者:吴毅凌; 郭晓芹; 葛忆琳; 刘军; 姜永根; 杨丽华 期刊:《江苏预防医学》 2019年第04期
目的了解某哨点医院住院患者与诊疗环境标本鲍曼不动杆菌(AB)分子流行病学特征,为防控院内感染提供科学依据。方法采集2016年第3季度到2017年第2季度某哨点医院住院患者样本206份和诊疗环境样本228份,开展鲍曼不动杆菌生化鉴定、分离培养,通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行相似性分析。结果共分离鲍曼不动杆菌56株,其中源自患者14株、环境42株,检出率分别为6.8%、18.4%。诊疗相关用品、患者直接接触物品和公共用品分离率较高,分别...
作者:唐锋; 宋启发; 熊燕; 陈智; 陈中举; 王芳; 方爱英; 罗万军 期刊:《中华医院感染学》 2019年第20期
目的分析武汉和宁波医疗机构分离的我国常见血清型沙门菌的脉冲场凝胶电泳指纹图谱及耐药谱,了解两市间沙门菌株流行病学特征及溯源关联。方法收集2014-2016年武汉和宁波医疗机构检出的114株我国最常见血清型(鼠伤寒、肠炎和德尔俾)沙门菌株,开展PFGE分型和微量稀释法检测耐药谱及聚类分析。结果在两市地方株聚类分析中,鼠伤寒分13型(相似度51.70%~100.00%),肠炎分7型(相似度76.50%~100.00%),德尔俾分21型(相似度52.40%~100.00%)。...
作者:张强; 阎彦霏; 罗勤贵; 刘晨星; 杨洋; 曹晨阳; 李凤琴; 杨保伟 期刊:《中国食品卫生》 2019年第05期
作者:徐丽萍; 张育禾; 张朝阳 期刊:《预防医学》 2011年第03期
2008年7月16日19时左右,宁波市海曙区某宾馆发生一起食物中毒,接报后我们立即派员赴现场进行流行病学调查和采样检测。根据流行病学调查、临床表现和实验室鉴定结果,依照食品分离菌株的同源性,本文用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型,从分子水平溯源菌株问的相关性,有助于本起食物中毒的确定与判断,现将结果报告如下。
作者:王晓燕; 占利; 叶菊莲; 罗芸; 吴爱萍; 李琳 期刊:《预防医学》 2014年第05期
目的探讨3起同地连续发生的肠炎沙门菌食物中毒分离株之间的分子流行病学关系。方法参照GB 4789.4—2010和WS/T 13—1996的方法进行病原分离培养,对检出菌株进行表型鉴定;采用WHO推荐的改良K-B法对检出菌株进行抗生素敏感试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌株进行分子分型和流行病学特征分析。结果 144份粪便及肛拭样本中检出23株肠炎沙门菌,其中3株从冷菜厨师肛拭中检出;54份留样食物中检出4株肠炎沙门菌(均为冷菜...
作者:罗薇; 黄翠颖; 王洋; 孙大泉; 刘桂凤; 张健; 王凡; 刘博闻; 潘志明; 耿士忠; 焦新安 期刊:《中国家禽》 2019年第02期
试验旨在调查国内某规模化种鸡场沙门菌流行状况,为种鸡场沙门菌净化提供基础资料。1 744份样品被采集进行沙门菌分离、血清型鉴定、耐药性分析及脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法亚分型。结果显示:168株沙门菌被分离鉴定,分离率为9.63%,其中肠炎沙门菌有157株,为优势血清型(93.45%);抗生素耐药性试验表明,多重耐药现象较为严重,耐药种类在三种以上的肠炎沙门菌株有130株(77.38%);随机选取28株肠炎沙门菌进行PFGE亚分型显示,这些菌株属于...
作者:程均福; 朱群力; 张少敏; 吕静; 侯学霞; 刘公平; 刘力 期刊:《公共卫生与预防医学》 2012年第06期
目的检测分析志贺氏细菌基因型,追踪传染源,为科学控制志贺氏细菌类重点肠道传染病提供科学依据。方法用脉冲场凝胶电泳方法检测志贺氏菌基因,用软件分析电泳图谱。结果检测8株为宋内志贺氏菌,检测8株宋内志贺氏菌DNA基因有3个基因型,2地区宋内志贺氏DNA基因型相近;检测29株福氏志贺氏菌来源鄂西南、鄂西北、江汉平原部分志贺氏菌DNA基因型相近,基因型分布相对复杂。武汉市的福氏志贺氏菌DNA基因分属于2个基因型和F1a和F4c...
脉冲场凝胶电泳(pulse-field gelelectrophoresis,PFGE),又称脉冲式交变电场电泳,该技术是将电泳电场方向交替性改变,并优化脉冲时间和其他条件,可以分辨凝胶中35~10 000 kb的DNA分子。该方法应用于分子流行病学中,通过观察电泳条带的差异,为确定菌株之间的亲缘关系提供了可靠的技术手段。该技术在致病菌溯源(细菌性传染性疾病溯源、细菌性食源性疾病溯源)、医院内感染流行监测等方面都有广泛的应用。
作者:童郁; 周铁丽; 费静娴; 侯佳惠 期刊:《中国现代医生》 2011年第18期
目的研究温州医学院附属第一医院临床分离铜绿假单胞菌超广谱β-内酰胺酶(EsBL8)产生情况、基因分布及流行特性,为临床合理使用抗菌药物、控制耐药性的传播提供理论依据。方法选取2005—2009年每年6-9月临床连续分离非重复铜绿假单胞菌共169株。PCR方法检测超广谱β-内酰胺酶基因(TEM、SHV、VEB、PER、GES、TLA、IBC、CTX—M-1、CTX—M-2、CTX—M-8、CTX—M-9、OXAⅠ、OXAⅡ、OXAⅢ、OXAⅣ和OXAⅤ)。采用脉冲场凝胶电泳技术(PF...
作者:张风华; 李小燕; 王宝枝; 张晓英 期刊:《中国医药导报》 2015年第17期
目的:探讨院内普通外科分离的铜绿假单胞菌的基因同源性及Ⅲ型分泌系统(TTSS)的毒力基因的临床意义。方法采用纸片扩散法(KB法)及微量肉汤稀释法检测2009年12月~2014年9月广州医科大学附属第四医院普通外科临床分离的102株铜绿假单胞菌对常用的13种抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC)。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌进行基因分型及毒力基因筛查,同时采用PCR调查毒力基因exo U、exo S在耐碳青霉烯类...
作者:曾静雯; 刘慧芳; 沈琴芳; 郑新添; 余旭平; 吴彤; 李永明; 周碧君; 王开功 期刊:《中国兽药》 2006年第04期
多杀性巴氏杆菌是一种常见病原菌,其血清型众多(16种血清型),在毒力及流行病学等方面的生物学特性差异很大。分子生物学鉴定和特性分析方法能直接揭示其基因型上的差异,具有高灵敏度和可靠性。本文综述了多杀性巴氏杆菌的PCR、菌落杂交和16S rRNA基因测序等鉴定方法以及限制性酶切分析、核糖体分型、脉冲场凝胶电泳、PCR指纹等特性分析方法。