首页 期刊 中国现代医药 成人急性B淋巴细胞白血病微小RNA和转录因子的生物信息学分析 【正文】

成人急性B淋巴细胞白血病微小RNA和转录因子的生物信息学分析

作者:蒋莉; 蔡安季; 文锦丽; 李宁; 戴勇 广东医科大学附属深圳南山人民医院检验科; 广东深圳518052; 暨南大学第二临床医学院深圳市人民医院临床医学研究中心; 广东医科大学附属医院血液科
急性b淋巴细胞白血病   微小rna   转录因子   生物信息学  

摘要:目的 构建成人急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的miRNA-转录因子调控网络,发现新的核心调控因子。方法 综合运用miRNA测序、转录因子芯片结合生物信息学分析的系统生物学方法构建B-ALL的miRNA-转录因子调控网络,从中鉴定出调控模块和核心调控因子并对网络节点进行GO和Pathway分析。结果 在miRNA-转录因子调控网络中鉴定出535个调控模块(包括526个前馈环和9个反馈环)以及47个核心调控因子(包括28个核心miRNA和19个核心转录因子)。GO分析表明,网络节点主要参与了基因表达的正性调控、大分子代谢过程的正性调控、造血或淋巴样器官发育等10个生物学过程。Pathway分析表明,网络节点主要富集在癌症信号通路、癌症转录失调信号通路以及慢性髓性白血病信号通路等25个信号通路。结论 多种核心调控因子可能在B-ALL发病机制中起一定作用。

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