首页 期刊 生物技术通讯 中华鳖gp130基因全长cDNA克隆及生物信息学分析 【正文】

中华鳖gp130基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

作者:宋如昕; 王兰; 张左兵 山西大学生命科学学院; 山西太原030006
中华鳖  

摘要:目的:从中华鳖脾脏、肝脏、肠道构建的SMART cDNA文库中克隆中华鳖gp130基因cDNA全长。方法:采用RACE法克隆中华鳖gp130基因全长cDNA,并对其进行生物信息学分析。结论:中华鳖gp130基因cDNA全长3806 bp,对应基因组全长73 252 bp,包含16个内含子及17个外显子。中华鳖gp130与鸟类、哺乳类相比均有保守的共线性关系。该基因编码由927个氨基酸残基构成的序列,二级结构主要包括α螺旋、延伸链、无规则卷曲、β转角,三级结构包含配体结合、跨膜结构域、纤维链接蛋白结构域等。系统进化分析显示与鸟类首先聚类,其次是哺乳类,最后是两栖类与鱼类。同时以人GP130蛋白为模型构建了中华鳖GP130蛋白的3D结构模型,一致性为58.32%。结论:获得了中华鳖gp130基因全长并做了生物信息学分析,为深入研究GP130及相关信号通路提供了基础。

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