作者:王慧娜; 王鹤; 韩彦卿; 田娜娜; 程富英; 张义茹; 韩渊怀 期刊:《分子植物育种》 2020年第01期
谷子白发病是谷子生产上的重要病害,可严重影响谷子的产量和品质。WRKY转录因子广泛参与植物的抗病,生长发育等多种生理过程。为了探究谷子WRKY转录因子对白发病菌胁迫的响应,进而发掘谷子特有的抗病基因并为以后的抗病研究提供参考,本研究以感病品种‘晋谷21’为试材,基于前期对转录组测序的基础上,筛选出8个与谷子白发病相关的WRKY转录因子基因,然后通过生物信息学技术,对这8个WRKY转录因子基因特征,基因序列及所在染色体位置,基...
作者:王双; 杨瑞; 白薇 期刊:《华北农学报》 2019年第06期
为研究水稻WRKY蛋白在应对各种生物以及非生物胁迫中发挥的作用,探明OsWRKY76是否参与调控水稻系统获得抗性,明确OsWRKY在植物抗病及耐逆反应过程中的作用机理,对OsWRKY76进行了氨基酸序列分析,发现OsWRKY76具有典型的WRKY结构域,属于WRKY-GCM1锌指WRKY超家族。克隆了OsWRKY76中300 bp的cDN段OsWRKY76-300,并扩增GUS基因中500 bp的片段作为连接物,通过片段末端人为增加的酶切位点将上述片段与Gateway系统的入门载体pENTR L16连接,...
作者:贾彩红; 王卓; 王静毅; 张建斌; 金志强; 徐碧玉 期刊:《分子植物育种》 2019年第23期
为了明确巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作过程中WRKY转录因子的作用,对巴西蕉与香蕉枯萎病菌互作2 d的转录组中WRKY基因的表达量进行分析。结果表明,在互作过程中筛选到log值大于1的基因有55个,1个基因是上调表达的,其余是下调表达。55个基因中第Ⅰ类家族包含5个基因;Ⅱa亚家族中包含8个基因,Ⅱb亚家族中包含5个基因,Ⅱc亚家族中包含13个基因,Ⅱd亚家族中包含7个基因,Ⅱe亚家族中包含3个基因;第Ⅲ类家族中包含14个基因。55个基因在根中的...
作者:王佳; 郑琳琳; 顾天培; 王学峰; 王迎春 期刊:《草业学报》 2014年第04期
根据长叶红砂转录组数据信息,选取在盐胁迫处理后表达上调明显且注释结果为WRKY转录因子的两个cDN段。通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),从长叶红砂中克隆获得2个WRKY基因。在NCBI数据库比对与拟南芥AtWRKY33同源性分别为79%和87%,因此命名为RtWRKY33-1和RtWRKY33-2。其中RtWRKY33-1的cDNA全长2163bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为1681bp,编码573个氨基酸;RtWRKY33-2的cDNA全长21...
作者:徐群刚; 邝健飞; 单伟; 陆旺金; 陈建业 期刊:《热带亚热带植物学报》 2015年第05期
为探讨香蕉(Musa acuminata)响应冷胁迫的分子机制,从香蕉果实冷害的数字基因表达谱中筛选并分离了1 个WRKY转录因子,命名为MaWRKY11.MaWRKY11 具有2 个WRKY 保守结构域,属于I 类WRKY 成员,定位于细胞核,是核蛋白.MaWRKY11 具有转录激活活性,且激活区在N 端.实时荧光定量PCR 分析表明MaWRKY11 受冷胁迫诱导,外源茉莉酸甲酯(MeJA)处理减轻香蕉果实冷害的同时也上调了其表达.另外,酵母双杂交筛选表明,MaWRKY11 可与脱水诱导的早...
作者:张凡; 尹俊龙; 郭瑛琪; 岳艳玲 期刊:《生物技术通报》 2018年第01期
WRKYs是高等植物中最大的转录因子家族(TFs)之一。它具有特殊结构-WRKY结构域,这些结构可使WRKY转录因子拥有不同的转录调控功能。WRKY TFs不仅可以通过调节植物激素信号转导途径来调节它们的应激反应,还可以结合其靶基因启动子中的W-box[TGACC(A/T)],通过激活或抑制下游基因的表达来调节它们的应激反应。此外,WRKY蛋白不仅可以与其他TFs相互作用来调控植物防御反应,而且还可以通过识别和结合本身目标基因中的W-box进行自我调...
作者:王庆竹; 尚先文; 汤纬玮; 李慧平; 文晓鹏; 范付华 期刊:《农业生物技术学报》 2019年第06期
作者:曾铭; 高文杰; 帅鹏; 马祥庆 期刊:《东北林业大学学报》 2019年第04期
通过转录组数据分析,BLAST以及多序列对比鉴定出44个杉木WRKY基因序列,并且探究其在低磷胁迫下的表达模式,为研究杉木在低磷逆境胁迫响应的机制和进一步深入杉木WRKY基因的研究提供相关信息基础。通过使用DNAMAN等软件及根据其基因结构特点对其蛋白序列与保守元件进行分析,将杉木WRKY基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ这3大亚家族,每组成员分别为6、37、1个,且每个成员都包含保守域WRKYGQK及不同的锌指结构;靶基因预测结果显示miRNA164与ClWRKY21...
作者:王鹏飞; 代玲敏; 王珊; 李廷刚; 任凤山; 王咏梅 期刊:《中外葡萄与葡萄酒》 2019年第02期
本研究鉴定出18个葡萄VQ motif-containing蛋白家族成员。18个葡萄VQ motif-containing蛋白家族成员可分为6个亚家族,并包含2个孤儿VQ motif-containing蛋白基因。很多葡萄VQ motif-containing蛋白基因的表达不仅受到非生物胁迫及外源ABA处理的影响,也可能受到葡萄CBF4 基因的调控,还会受到病毒感染或白粉病感染的影响。通过比较易感病品种‘赤霞珠’和抗病品种‘诺顿’感染白粉病后VQ motifcontaining蛋白基因的表达变化发现,二者...
作者:李珍; 华秀婷; 张积森 期刊:《热带作物学报》 2018年第02期
WRKY转录因子是植物转录调节因子的最大家族之一,并且是调节植物许多生物过程的信号网络的组成部分。WRKY转录因子通过其保守结构域与靶基因启动子区域的W-box特异性结合,调节靶基因的表达,进而调控植物的叶片衰老、种子萌发与休眠、开花等生长发育过程外,还参与调控植物生物和非生物胁迫的响应过程。本文用代表性植物基因组数据,对WRKY的基因演化作了归纳,综述了近二十年来国内外WRKY转录因子的相要研究进展,并介绍了该转录因子在...
作者:陈悦; 王田幸子; 杨烁; 张彤; 马金姣; 燕高伟; 刘玉晴; 周艳; 史佳楠; 兰金苹; 魏健; 窦世娟; 刘丽娟; 杨明; 李莉云; 刘国振 期刊:《中国农业科学》 2019年第12期
[目的]水稻中有近百个WRKY转录因子家族成员,其中很多与生长发育、生物与非生物逆境胁迫应答有关。河北农业大学生命科学学院分子生物学与生物信息学实验室(molecular biology & bioinformatics lab,MBB)前期发现OsWRKY68在水稻接种白叶枯病菌后诱导表达,本研究试图进一步探究 OsWRKY68的功能。[方法]采集水稻TP309不同生长发育时期的组织样品,包括萌发期、幼苗期、分蘖期、孕穗期和开花期的根、茎、叶、叶鞘、叶枕、穗子、花药、...
作者:彭喜旭; 白宁宁; 王海华 期刊:《中国水稻科学》 2018年第02期
【目的】镉(Cd)是一种对植物生长发育和人类健康均具有很强毒害效应的重金属元素。WRKY转录因子在抗逆生理过程中起重要的调节作用。为了研究WRKY基因在镉胁迫响应和抗性反应中的作用,【方法】基于基因注释,采用RT-PCR策略从一氧化氮(NO)处理的水稻叶片中分离完整的OsWRKY15编码序列,运用生物信息学软件分析其编码蛋白的结构特征,采用qRT-PCR分析其基因的空间(器官)特异性及诱导表达模式;运用酵母单杂交方法检测其转录激活活性。【...
作者:彭婷; 王艺琴; 陈曼曼; 冯蓝萍; 包满珠; 张俊卫 期刊:《华中农业大学学报》 2019年第05期
为揭示梅花WRKY基因的功能,采用RT-PCR技术从梅花品种'雪梅'(Prunus mume'Xuemei')中分离得到1个WRKY转录因子基因PmWRKY40。序列分析结果显示,该基因cDNA全长1072bp,完整开放阅读框972bp,编码323个氨基酸,包含1个WRKY结构和1个C2H2型锌指结构。系统进化分析结果显示,梅花PmWRKY40蛋白与欧洲甜樱桃亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析表明:PmWRKY40基因受低温、氧化胁迫诱导,但诱导程度存在差异。此外,SA处理显著提高PmWRKY40的表达...
作者:刘辉; 韦永选; 邓治; 代龙军; 杨洪; 李德军 期刊:《华北农学报》 2017年第05期
为阐明巴西橡胶树WRKY转录因子基因Hb WRKY41的分子特征及表达特性,利用RT-PCR方法从巴西橡胶树中克隆了该基因。Hb WRKY41开放阅读框1 020 bp,编码339个氨基酸,预测蛋白分子量为38.48 k Da,理论等电点为5.52。Hb WRKY41含有1个WRKY保守结构域和1个C_2HC型锌指结构,与蓖麻、棉花、大豆及拟南芥WRKY41蛋白聚为一类,属于Ⅲ类WRKY转录因子家族成员。实时荧光定量PCR检测结果表明,Hb WRKY41在巴西橡胶树根、树皮、胶乳、叶和花等组织中...
作者:包昌艳; 邓浪; 周军; 王连春; 王大玮; 沈兵琪; 周凡; 夏天帅 期刊:《分子植物育种》 2018年第14期
本研究旨在鉴定猕猴桃WRKY基因家族成员,为进一步研究Ac WRKY转录因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息。利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据,通过生物信息学在线分析网站与软件利用的方法,对猕猴桃WRKY转录因子家族成员进行鉴定和系统分析。分析表明:从猕猴桃全基因组中共鉴定出89个Ac WRKY基因,分组鉴定和进化分析显示,Ac WRKY蛋白可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ个类型。Ⅰ组共有19个成员,其锌指结构是CX4CX(22-2...
作者:禹阳; 贾赵东; 马佩勇; 郭小丁; 谢一芝; 边小峰 期刊:《分子植物育种》 2018年第21期
植物体具有天生免疫系统以避免病原菌的入侵。转录因子作为信号途径调控基因在植物抗病反应中扮演重要角色,尤其是WRKY转录因子家族。本综述阐述了近年来WRKY转录因子在植物抗病反应中的研究进展。研究表明,WRKY蛋白可能参与不同的调控途径从而正向或负向调节下游靶基因的表达。对其信号转导和转录调控机制的深入研究更揭示了WRKY蛋白能够通过参与不同的信号通路或与不同蛋白互作对植物抗病反应进行调控,其中包括参与激素信号通...
作者:石元豹; 汪贵斌; 杨晓明; 曹福亮 期刊:《分子植物育种》 2019年第05期
本研究以银杏基因组数据为基础,利用HMMER软件对银杏WRKY家族进行预测,用保守域分析软件进行确认,再以密码子分析的序列筛选原则对序列进行筛选,共计筛选出34条基因编码序列作为研究对象,对其密码子使用偏向性进行分析。结果显示,银杏WRKY家族基因密码子GC含量范围在40.51%~52.07%,平均含量为45.60%,GC3平均含量为41.75%,说明该家族偏向使用以A或U结尾的密码子;ENC值在49.58~60.45之间,说明其密码子偏向性较弱;相对同义密码子使用...
作者:周之楠; 阚金红; 栾海业; 沈会权; 杨平; 冯宗云 期刊:《植物遗传资源学报》 2019年第01期
大麦黄花叶病是我国长江中下游地区大麦种植区域的主要病毒病害,由大麦黄花叶病毒(BaYMV,Barley yellow mosaic virus)及大麦和性花叶病毒(BaMMV,Barley mild mosaic virus)引起,自然条件下病毒寄生于禾谷多黏菌中,通过感染大麦根部导致病害发生。本研究通过分析RNA-seq数据,获得感染BaMMV后上调表达的基因HORVU1Hr1G069640(WRKY55)。荧光定量PCR分析发现WRKY55在感病品种中的表达水平极显著高于抗病材料,说明WRKY55参与到大麦感染...
作者:王鹏洋; 曲姗姗; 梁源; 付泽元 期刊:《安徽农业科学》 2019年第12期
[目的]对水稻WRKY转录因子家族成员进行生物信息学分析,为进一步研究水稻WRKY转录因子的功能提供依据。[方法]从NCBI网站下载水稻全基因组序列,利用CDD、Blast、MEME、MEGA、ProtParam等在线工具或本地软件筛选WRKY家族成员,对所得WRKY家族成员的理化性质、系统进化亲缘关系、保守元件等项目进行生物信息学分析。[结果]共从水稻基因组中鉴定筛选出65个WRKY家族成员,每一个成员中都具有WRKYGQK的保守元件,除此之外还有一个保守锌指...
作者:李晓颖; 徐红霞; 陈俊伟 期刊:《园艺学报》 2019年第05期
以枇杷(Eriobotrya japonica)转录组数据为材料,利用生物信息学手段对枇杷WRKY转录因子进行鉴定与特征分析。分离鉴定出33条具典型WRKY结构域的序列,CDS长度分布在492~2 040 bp,命名为EjWRKY01~EjWRKY33。分组鉴定和进化树分析结果显示,枇杷WRKY转录因子可分为3大类,其中Ⅰ类数量为6个,Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22和5个,其中Ⅱ类又进一步分为a~e等5个亚类。WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结...