分子植物育种杂志 北大期刊 统计源期刊

猕猴桃WRKY转录因子家族全基因组鉴定与分析

作者：包昌艳; 邓浪; 周军; 王连春; 王大玮; 沈兵琪; 周凡; 夏天帅 刊期：2018年第14期

本研究旨在鉴定猕猴桃WRKY基因家族成员,为进一步研究Ac WRKY转录因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息。利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据,通过生物信息学在线分析网站与软件利用的方法,对猕猴桃WRKY转录因子家族成员进行鉴定和系统分析。分析表明：从猕猴桃全基因组中共鉴定出89个Ac WRKY基因,分组鉴定和进化分析...

菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析

作者：胡利宗; 王俊生; 刘红占; 赵锦慧; 王秋霞; 纪秀娥 刊期：2018年第14期

SBP蛋白是植物特有转录因子,参与众多生物学过程。尽管在许多植物中SBP家族基因已经被鉴定,但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆SBP-box基因家族,基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源,鉴定出23个菜豆SBP基因,并系统分析了这些SBP基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明：23个基因被分为2个大类群,散...

木薯MePYL8基因克隆及表达分析

作者：颜彦; 铁韦韦; 丁泽红; 吴春来; 胡伟 刊期：2018年第14期

脱落酸介导的核心信号通路在植物应答非生物胁迫的过程中具有重要功能,而PYL蛋白是该信号通路中ABA的受体,因此研究PYL家族基因有助于完善对该信号通路的理解。本研究利用PCR技术从木薯栽培种KU50中克隆得到一个PYL家族基因,命名为MePYL8,该基因的开放阅读框全长为579 bp,编码193个氨基酸。对其进行序列比对表明MePYL8与橡胶树和麻疯树中的氨基...

观赏羽衣甘蓝BoMYB114基因编码区的克隆及序列分析

作者：王玉书; 王欢; 庞彩燕 刊期：2018年第14期

花青素是羽衣甘蓝叶片呈紫色、红色及粉色的重要色素,R2R3-MYB类蛋白被认为是调控植物花青素生物合成的转录因子。本研究以羽衣甘蓝叶片为试材,采用同源克隆的方法克隆BoMYB114转录因子基因的编码区序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明：BoMYB114基因编码区长度为753 bp,其包含1个完整的开放阅读框ORF,可编码250个氨基酸,预测蛋白的分子量...

醋栗番茄NHX4基因及其启动子序列的克隆与分析

作者：李红婷; 魏露阳; 孙亚东; 朱路英 刊期：2018年第14期

本研究在醋栗番茄基因组鸟枪序列的基础上,基于同源序列的保守性,克隆了醋栗番茄液泡膜Na＋/H＋逆向转运蛋白4基因（SpNHX4）的cDNA序列,对其响应盐胁迫的表达模式进行了分析。通过染色体步行法克隆了该基因的启动子区域,并通过生物学软件对该基因编码的蛋白和启动子序列进行分析。结果显示,SpNHX4的c DNA序列包含1 611 bp的开放阅读框,编码536...

百合类胡萝卜素代谢途径关键酶基因的分析及LoLcyB的克隆

作者：梁晶; 王莉; 丁榕; 崔金腾; 张克中 刊期：2018年第14期

本研究以东方百合品种‘Justina’叶片的5个生长阶段（10 d,25 d,50 d,75 d和100 d）和生长100 d的花柱、花药、花瓣、叶片、茎、鳞茎和根这7个不同部位为试验材料,采用有机溶剂法测量百合类胡萝卜素和叶绿素含量,根据转录组文库测序结果对百合类胡萝卜素代谢途径的12个关键酶基因（PSY,PDS,Z-ISO,ZDS,CRTISO,LCYB,LCYE,%HYB,VDE,ZEP,CCS和NCED...

基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析

作者：张加强; 史小华; 刘慧春; 马广莹; 邹清成; 朱开元; 周江华; 毛军铭 刊期：2018年第14期

蝴蝶兰花色丰富且极具变化,是研究花着色机制的理想材料。本研究利用RNA Sequencing（RNA-Seq）技术比较三种不同色系蝴蝶兰花器官转录组,鉴定蝴蝶兰花色苷合成的相关基因,从转录组水平揭示蝴蝶兰花色苷生物合成的分子调控机制。选取白花蝴蝶兰（PAPW）、红花蝴蝶兰（PAPR）和黄花蝴蝶兰（PAPY）为试验材料,对其花苞及盛开花朵分别釆样,分别提取...

枣WRKY转录因子家族的生物信息学分析

作者：薛宝平; 张昊; 祖欢欢; 姬俏华; 林金辉; 党峰峰; 王延峰 刊期：2018年第14期

明确枣WRKY转录因子家族生物学特征,为深入研究枣WRKY家族基因的功能提供科学依据。通过DNAMAN6、MEGA5、Mapdarw和MEME Suite 4.12.0等软件对枣WRKY转录因子的数目、基因分类、染色体定位、系统进化关系和保守基序进行了分析。结果表明：枣中包含92个WRKY基因,根据WRKY结构域数量及其锌指结构的特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ,Group...

樱桃bHLH转录因子家族基因鉴定及表达分析

作者：应炎标; 朱友银; 郭卫东; 陈文荣; 宗宇; 张婷; 汤腾跃; 李永强 刊期：2018年第14期

低温被认为是诱导‘短柄樱桃’花芽休眠解除的关键因子,而花芽如何响应低温并完成积累仍不清楚。植物bHLH转录因子可以响应低温而调控植物生长发育和非生物胁迫过程。研究小组在‘短柄樱桃’花芽转录组文库中发现了30个具有完整开放阅读框的bHLH类转录因子,但其结构特征和低温诱导表达模式仍不清楚。为此,本研究采用生物信息学方法对30个bHLH转...

毛竹PheWRKY9-1基因序列及相关表达分析

作者：黄容; 李龙; 刘俊; 高红艳; 李雪平 刊期：2018年第14期

WRKY转录因子参与植物生长发育和逆境胁迫响应的调节过程。采用PCR方法从毛竹中分离了WRKY家族的一个基因,命名为PheWRKY9-1（ID：PH01000326G0720）基因的序列。PheWRKY9-1的CDS的全长为1 578 bp,含有6个外显子和5个内含子,编码一个525 aa的蛋白,含有WRKYGQK高度保守结构域,推测分子量和等电点分别为54.9 kD和9.65。系统进化树分析表明,PheWRKY...

四种木本油料内参基因筛选及Actin基因时空表达分析

作者：张莞晨; 阮成江; 李景滨; 韩平; 丁健; 刘祾悦; 吴波; 阮东 刊期：2018年第14期

以油茶、沙棘、文冠果和油用牡丹的成熟种子为材料,利用实时荧光定量PCR分析了7个内参候选基因GAPDH、Actin、TUB、eEF1α、RPL4、UBQ和e IF4A在四种木本油料中的表达稳定性,并进一步验证了Actin基因在沙棘不同发育期种子和果肉中的表达。结果表明,6个内参候选基因GAPDH、TUB、eEF1α、RPL4、UBQ和e IF4A的表达水平在四种本油料种子间存在明显差异...

蓖麻RcFAH12基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

作者：狄建军; 张庆波; 王月; 佘集凯; 张树军; 黄凤兰; 李国瑞; 陈永胜; 陈宇杰 刊期：2018年第14期

RACE技术是一项扩增基因末端序列的新技术。本研究以蓖麻籽的RNA为模板,以Gen Bank上FAH12基因序列设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术扩增并获得了特异片段。该片段经PCR、酶切和测序验证,证实所克隆序列为蓖麻FAH12的cDNA全长序列。生物信息学分析,此片段包含1 164 bp组成的开放读码框（ORF）,编码387个氨基酸,分子量为44 426.21 Da,p I=8.95...

International Journal of Molecular Medical Science（IJMMS）

刊期：2018年第14期

生物信息学手段鉴定和分析蒺藜苜蓿基因组中水孔蛋白基因家族

作者：李菲; 何小红; 李欲柯; 乙引 刊期：2018年第14期

植物水孔蛋白不仅调控水分运输,同时还可以在植物细胞间传递气体如CO2,和营养物质如硼（B）、硅（Si和活性氧（ROS））,是多功能的蛋白质。植物水孔蛋白的功能对于植物生长和非生物胁迫的反应也起到重要的作用。对蒺藜苜蓿基因组序列进行检索和筛选,共鉴定出46个水孔蛋白基因。蒺藜苜蓿水孔蛋白基因大小较为集中均一（绝大多数由200～400个氨基...

白花虎眼万年青QtWOX8基因的克隆及特性分析

作者：姜福星; 魏帼英; 孙晓兰; 宋贤; 文好雨; 陈其兵 刊期：2018年第14期

Wuschel-related homeobox（WOX）基因是植物特有的同源异型盒转录因子,在调控干细胞活性和器官发育中发挥重要作用,然而在百合科植物等鳞茎球根花卉中中尚未见到报道。本研究首次从百合科植物白花虎眼万年青叶上珠芽中分离出WOX基因家族成员,进行氨基酸保守序列比对及系统进化分析后,将其命名为QtWOX8基因。将其置于UBI启动子下在烟草中超量表...