基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

人HLA-DPB1基因及蛋白的生物信息学分析

作者：易珊; 廖娟; 李寻亚; 袁小燕; 王烨; 张朝晖 刊期：2019年第10期

HLA-DPB1是MHC区域基因编码的跨膜糖蛋白,是人类免疫系统的重要组成部分。本研究采用生物信息数据库和分析软件对人HLA-DPB1基因的结构、单核苷酸多态性位点(SNP)、蛋白的理化特性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、二级结构、三级结构、磷酸化位点、组织表达情况及蛋白相互作用网络进行预测分析。结果表明,人HLA-DPB1基因位于6号染色体,有8种...

牙鲆fmr1基因的分子特征与表达分析

作者：向玉婷; 张俊玲; 王新艳; 施志仪 刊期：2019年第10期

脆性X智力低下1号基因(fragile X mental retardation 1,fmr1)编码的蛋白FMRP是一种RNA结合蛋白,当fmr1基因缺失时雌鼠卵巢中卵泡数目减少、生殖功能会降低。牙鲆(Paralichthys olivaceus)是中国重要的海水经济鱼类,其性腺发育一直颇受关注。为了探讨fmr1基因在牙鲆性腺发育中的作用,本研究运用生物信息学方法分析了fmr1基因的分子结构与进化特...

病毒灭活疫苗诱导云斑尖塘鳢脾脏转录组分析

作者：周阳; 李本旺; 林强; 付小哲; 李敏; 梁红茹; 刘礼辉; 卢伟华; 李宁求 刊期：2019年第10期

为阐明云斑尖塘鳢对病毒灭活疫苗的免疫应答机制,本研究采用RNA-sequencing技术结合生物信息学方法分析了传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗接种云斑尖塘鳢后脾脏转录谱。分别构建疫苗接种后7 d、14 d脾脏cDNA文库并对其进行高通量测序,共获得85547条Unigenes,其中32386条Unigenes被注释;共筛选得到13593个差异表达基因,其中免疫后7 d...

翘嘴鳜转录组测序及SSR新标记的开发与应用

作者：孙海林; 孙成飞; 董浚键; 田园园; 胡婕; 叶星 刊期：2019年第10期

为探讨翘嘴鳜转录组测序及SSR位点的分布和序列特征,为翘嘴鳜的SSR新标记开发及遗传研究提供便利,本研究利用高通量测序技术平台Illumina HiSeq 2500对翘嘴鳜(Sinipreca chuatsi)肌肉组织进行转录组测序及数据组装和分析,并对获得的Unigenes进行SSR检索和分析。研究共获得41533736条高质量Reads,组装为138728条平均长度为808.94 bp的非冗余Unige...

PGC-1α敲降对斑马鱼细胞冷应激过程的影响

作者：胡成枫; 王晓煜; 陈良标 刊期：2019年第10期

过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARγ)辅助激活因子1α(PPARγcoactivator-1α,PGC-1α)作为一个重要的转录激活因子,参与多种生理活动的调节。本研究探究了PGC-1α在斑马鱼(Danio rerio)ZF4细胞(胚胎发育3 d成纤维样细胞)冷应激过程中所起的作用。通过慢病毒质粒转染干扰PGC-1α基因的表达,并用嘌呤霉素...

中华鳖figlα基因的克隆及其在性腺中的表达分析

作者：赵岩岩; 李伟; 吴栩灵; 朱新平; 徐红艳 刊期：2019年第10期

为解析中华鳖figlα基因功能及其对配子生成的作用机制,本研究开展了中华鳖figlα基因的cDNA序列克隆及其mRNA表达模式分析。克隆获得的figlα基因cDNA序列为714 bp,包含长72个碱基的3'UTR和长642个碱基的开放阅读框(open reading frame,ORF),共编码213个氨基酸。中华鳖Figlα蛋白序列与西部锦龟Figlα蛋白的同源性高达93%,且包含一个Figlα蛋白高度保...

鰤鱼诺卡氏菌感染乌斑杂交鳢的组织病理学研究

作者：王文基; 陈建林; 侯素莹; 鲁义善; 夏立群 刊期：2019年第10期

人工养殖乌斑杂交鳢(Channa maculate♀×C.argus♂)受鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)侵害日益严重,为深入研究该菌的致病机理,鰤鱼诺卡氏菌感染乌斑杂交鳢的感染模型亟待建立。本研究通过对菌液浓度与吸光值、半致死剂量、组织病理学和病理组织切片等方面进行研究。结果表明菌液浓度为4.75×10^4~4.75×10^7 cfu/mL范围时与其吸光值呈线性关系。...

斜带石斑鱼肠道乳酸菌的分离、鉴定及特性分析

作者：伍元植; 韦光本; 简纪常; 蔡双虎; 汤菊芬; 黄郁葱; 马少鸿 刊期：2019年第10期

从健康斜带石斑鱼肠道中分离出3株形态特征不同的菌株,经革兰氏染色、氧化酶及触酶反应筛选出3株革兰氏阳性球菌,通过生化鉴定和16S rRNA测序结果发现他们分别为粪肠球菌、乳酸片球菌和乳酸乳球菌,命名为WYZ-1、WYZ-2和WYZ-3。选取嗜水气单胞菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌、哈氏弧菌以及大肠杆菌以琼脂扩散法测定WYZ-1、WYZ-2和WYZ-3的抑菌活性,结果...

饵料对不同规格红螯螯虾生长的影响

作者：冯廷廷; 刘春胜; 顾志峰; 王爱民 刊期：2019年第10期

瘤背石磺肌肉胶原蛋白提取工艺优化及其结构特征分析

作者：朱敏; 钱朝曦; 沈和定; 许国绿 刊期：2019年第10期

在酸性条件下,用胃蛋白酶酶解瘤背石磺肌肉并提取胶原蛋白,采用正交试验法确定提取胶原蛋白的最佳工艺,利用SDS-PAGE、红外扫描、氨基酸组成分析方法综合分析瘤背石磺肌肉胶原蛋白的基本结构特征。实验结果显示,酶解温度为35℃,酶添加量8 mg/mL,酶解时间24 h时,提取率最大为73.09%。所制备的胶原蛋白由3条肽链构成,纯度高,几乎不含杂带,甘氨酸含...

努比亚山羊BMPRⅠB基因5'UTR多态性与产羔性状的关联分析

作者：邹辉; 崔悦悦; 夏琴; 江雨航; 瞿秋红; 黄大安; 韦英明; 蒋小刚; 蒋钦杨 刊期：2019年第10期

为提高山羊产羔性能提供更多的基因信息,筛选出与山羊产羔性状相关的分子标记,本研究以努比亚山羊为试验材料,颈静脉采血后,提取血液全基因组DNA,根据NCBI GenBank山羊BMPRⅠB基因序列(NC-030813.1)设计引物,采用DNA池法结合PCR产物测序方法检测BMPRⅠB基因的多态性,结果发现BMPRⅠB基因5'UTR第469位发生T→C突变。采用限制性内切酶片段长度多态...

Twist2和Prrx1标记的间充质细胞对DSS诱导的小鼠结直肠炎的治疗

作者：方飞飞; 高亮; 邓琪; 刘慧娟 刊期：2019年第10期

间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSC)具有多分化潜能,免疫调节能力并且不具有免疫原性,这些特性使得它成为许多疾病的潜在治疗药物。为了研究不同间质细胞亚群对结肠炎的治疗效果,本研究采用Twist2和Prrx1标记的间充质细胞,通过不同移植方法来探究对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的小鼠结直肠炎的治疗效果。将30只10周龄...

重金属与霉菌毒素对动物细胞DNA甲基化的影响

作者：樊雨; 陈昌豪; 任志华; 王震宇; 张卓; 王雪梅 刊期：2019年第10期

相对于其他表观遗传学机制,DNA甲基化的研究最深入。相关研究表明,在机体的生长发育和疾病的发生发展中DNA甲基化起着重要的作用。表观遗传学中的DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质构型重塑一起参与了基因的转录调控。在饲料原料和人类食品中存在的重金属和霉菌毒素会对动物和人类健康造成严重威胁。研究发现DNA甲基化状态可被环境中多种重金属污染...

单细胞转录组测序及其在神经系统研究中的应用

作者：李亚雷 刊期：2019年第10期

哺乳动物神经系统的转录组学研究,可以从分子水平分析基因表达模式,并作为细胞形态学和电生理学等传统研究方法的补充。传统的多细胞转录组测序只能获取细胞群体的平均特征,掩盖了单个细胞之间的异质性。单细胞转录组测序可以分析神经系统中的基因表达,发现其中的可变剪切和新转录本,为神经系统的分子分类以及探究神经退化机制等方面带来更深层...

Pseudomonas protegens H78 中Crc 调控基因突变的转录组学分析

作者：张晴晴; 王正; 刘玉洁; 张雪洪; 黄显清 刊期：2019年第10期

转录后调控子Crc蛋白(Catabolite repression control protein)在防御假单胞菌(Pseudomonas protegens)H78中发挥着重要的代谢调控作用。运用RNA-seq(RNA sequencing)技术,针对H78野生型和H78Δcrc突变株开展比较转录组学研究,利用COG(Clusters of orthologous groups of proteins)、KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库对受到C...