基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

基于高通量转录组测序的草鱼雌雄性腺差异表达基因分析

作者：姚汶励; 姜鹏; 白俊杰; 马冬梅 刊期：2019年第09期

基于RNA-Seq高通量测序技术的菠萝洁粉蚧转录组研究

作者：何衍彪; 詹儒林; 赵艳龙; 常金梅 刊期：2019年第09期

为了探索调节昆虫世代历期的相关基因,研究了菠萝洁粉蚧在转录水平上对温度的响应。组装后获得49898个Unigenes,其平均长度为1007bp;其中有15015(30.10%)个Unigenes被成功注释到Nr、SwissProt、KOG和KO等功能数据库中。DEG分析表明,7960个Unigenes被诱导差异表达,其中MIX21相对于MIX27表达量上调的有5080个,下调的有2880个。差异基因代谢通路分...

秧鸡科部分鸟类线粒体基因组的比较及系统发育关系分析

作者：徐小蓉; 何诗远; 张明明; 粟海军; 熊勇; 王野影 刊期：2019年第09期

秧鸡科鸟类的系统发育关系尚不明确,本研究通过对秧鸡科11属共17种鸟类的线粒体基因组中各基因进行变异位点和简约信息位点分析。选取变异位点和简约信息位点含量均较高的CR、ND2、ND4、ND5及线粒体基因组分别作为分子标记,采用NJ法、ML法和贝叶斯法分别构建系统发育树。通过对各系统树进行比较分析,结果表明:红胸田鸡、小田鸡、紫水鸡、南秧鸡...

SUMO融合系统高效表达可溶性IBDV NB株VP2 S-P域蛋白

作者：朱艳平; 邢瑞林; 李润芷; 何勇; 申一兰; 王玲玲; 闫占鹏; 任鹏举; 徐若楠; 岳锋; 李鹏; 王选年 刊期：2019年第09期

鸡传染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus, IBDV)导致机体出现免疫抑制。VP2 是IBDV主要保护性抗原表位的结构蛋白,Shell 域和Projection 域位于IBDV VP2 蛋白的胞外区和跨膜区,包含VP2主要的抗原位点。前期研究在Shell 域筛选到能够与IBDV 多抗结合的多肽。因此,本研究利用PCR 扩增Shell 域和Projection 域的基因,添加小泛素相关...

基于COⅠ基因的龟鳖目动物鉴定与分类进化分析

作者：叶朝阳; 李伟; 赵建; 陈海港; 朱新平 刊期：2019年第09期

为探索COⅠ基因条形码技术在龟鳖目物种分类与鉴定中的适用性,本研究应用通用引物PCR扩增获得龟鳖目动物9科26属45种共205个样品的634bpCOⅠ基因序列片段进行研究分析。结果显示,COⅠ基因在龟鳖目动物中存在少量的碱基插入和缺失,共计12种20个位点,物种占比34.28%;平均碱基含量(A+T)为55.42%,显著高于(G+C)的44.58%。通过Kimura's2-parameter计...

中华绒螯蟹IAG基因的克隆及生物信息学分析

作者：付春鹏; 于杰伦; 李法君; 王慧 刊期：2019年第09期

采用RACE-PCR技术,获得中华绒螯蟹胰岛素样促雄激素腺基因(Es-IAG)全长cDNA序列,并利用相关生物信息学软件对该基因及其蛋白质的结构、理化特性进行生物信息学分析。结果发现,Es-IAG基因序列全长1392bp,编码151个氨基酸,Es-IAG多肽的相对分子量为16.61kD,理论等电点pI为5.08,前体多肽中存在分泌型信号肽,存在两个糖基化位点和16个磷酸化位点,存...

华贵栉孔扇贝Akirin 2 基因的克隆与表达分析

作者：陈金辉; 冼昶华; 罗月红; 林曼芬 刊期：2019年第09期

为了解Akirin 在华贵栉孔扇贝(Chlamys nobilis)中的作用,本研究分离了华贵栉孔扇贝Akirin 2 基因(命名为CnAkirin 2),并描述了CnAkirin 2 的特征。使用转录组分析和PCR 方法获得了CnAkirin 2 cDNA序列,通过序列比对分析了Akirin 氨基酸序列在不同物种中的保守性,使用MEGA 7.0 软件的邻接法构建了Akirin 2 的系统进化树,使用实时定量PCR 分析了A...

三角帆蚌SOX2基因的分子鉴定及表达分析

作者：徐智诚; 刘斐斐; 汪桂玲 刊期：2019年第09期

SOX基因家族是一系列在性别分化、胚胎发育、细胞多功能性的维持等方面具有重要作用的转录因子,在高等脊椎动物中研究比较深入,但在淡水珍珠蚌中却很少见。本研究利用RACE法克隆获得了三角帆蚌SOX2基因的序列,其cDNA全长为1840bp,开放阅读框为672bp,编码氨基酸223个。该基因具有SOX基因家族典型的HMG-box蛋白结构域,与其他物种对比发现,保守性极...

热应激对虹鳟CRT基因和PDIA4基因mRNA表达的影响

作者：刘晓霞; 刘哲; 王永杰; 康玉军; 马芳; 王建福; 黄进强 刊期：2019年第09期

c-myb基因启动子表观遗传修饰对该基因表达的影响

作者：赵丽蓉; 李小霞; 姜蓬垒; 兰树雨; 张俊芳; 韩兵社 刊期：2019年第09期

基于Cytb基因的NCBI数据库序列可靠性分析

作者：黄娅琳; 徐燕红; 侯森林; 顾翀实 刊期：2019年第09期

本研究以常用于动物种属鉴定的Cytb基因位点为研究对象,利用所测得的30种盗猎案件中常见的野生动物Cytb基因部分片段序列及NCBI数据库中下载的该物种序列及其近缘物种序列,构建系统进化树。根据进化树的聚类情况,判断NCBI数据库中的相关基因序列或物种名称的正确性,并对其中错误序列的登陆号进行标记,以防对后续涉案动物的准确鉴定造成影响。分...

雅鲁藏布江湘河流域浮游生物群落结构的探究与多样性分析

作者：邓捷; 童猛; 张红星; 赵虎; 姜维; 孔飞; 许涛清; 王启军 刊期：2019年第09期

为了探究雅鲁藏布江湘河流域生物群落结构及物种多样性现状,为西藏地区湘河流域浮游生物资源的保护及开发利用提供科学依据。本研究于2017年3~4月对湘河流域浮游生物进行了生物采样与调查,共设置采样点8个。本次调查共检出浮游植物6门61种,其中硅藻门为优势种,共41种,占总种类数的67.21%;绿藻门、蓝藻门次之,分别占总种类数的11.48%;甲藻门、隐...

地塞米松对从江香猪细胞色素氧化酶P450 3A29 mRNA表达的影响

作者：杨家大; 吴声榕 刊期：2019年第09期

从江香猪是全国稀有的微型猪种,其细胞色素氧化酶P450 基因纯合度较高,遗传稳定,具备开发药物代谢动物模型的良好基础。本研究旨在应用实时荧光定量方法研究从江香猪细胞色素氧化酶P4503A29 mRNA 的组织分布及地塞米松对其表达的影响,并比较与人细胞色素氧化酶P450 3A4 的相似性。结果表明,从江香猪细胞色素氧化酶P450 3A29 mRNA 的组织分布特征...

家犬用狂犬病口服基因工程疫苗的研究初探

作者：潘艳; 金硕; 卢摇; 梁晶晶; 李晓宁; 罗廷荣 刊期：2019年第09期

中国的狂犬病主要由农村家犬通过咬伤传染所致,为了研制高效实用的家犬用狂犬病口服基因工程疫苗,本研究把狂犬病病毒G蛋白基因插入真核表达质粒pIRESneo,构建重组表达质粒pIRESneo-G,转化入鼠伤寒减毒沙门氏菌SL3261,构建重组口服疫苗SL3261-pIRESneo-G。通过口服免疫小鼠,检测免疫血清中和抗体水平及其病毒保护效果。结果显示,经小鼠口服免疫...

一种自制DNA提取剂在微量细胞和单个囊胚上的应用

作者：游小燕; 范骁琳; 何琦琳; 刘雪芹 刊期：2019年第09期

目前微量DNA的提取方法,不仅操作繁琐耗时,而且所需试剂价格昂贵。为了解决这个问题,本研究旨在开发一种快速、经济的微量DNA提取剂。用自制提取剂快速提取50个、100个、500个、5000个、50000个猪胎儿成纤维细胞的基因组DNA。经PCR扩增,电泳结果显示:自制提取剂可有效提取数量低至50个的猪胎儿成纤维细胞。分别采用自制提取剂、酚氯仿以及试剂盒...