基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

脊椎动物FoxO基因亚族的进化

作者：黄林艳; 张婉清; 黄晓; 朱广香; 王勤 刊期：2019年第07期

本研究以脊椎动物FoxO作为研究对象,选取NCBI上公布的多个FoxO基因编码蛋白的核苷酸序列,重点分析Fox O蛋白质结构和功能的相似性与差异性,重建FoxO基因的系统发育树并进行选择压力分析,对FoxO基因亚族的起源和进化进行研究分析。结果显示:脊椎动物FoxO蛋白间Forhead结构域十分保守但核定位信号区结构差异较明显,尤其是FoxO6蛋白,并且多个磷酸化...

猪线粒体控制区微卫星(mtMs)变异及其分布特征

作者：蔡原; 姜天团; 杨巧丽; 王川; 赵生国 刊期：2019年第07期

猪线粒体DNA长度因D-loop中mtMs序列重复数变异而不同。为阐明猪mtMs变异及其在不同群体中的分布特征,本研究对4个藏猪群体、八眉猪、烟台黑猪及3个引入猪群体共164个个体mtDNA D-loop全序进行测定,并与GenBank中发表的相关序列进行比对,分析了其中的重复单元核苷酸变异、重复次数及其在各群体间的分布规律。结果表明,因重复单元“5’-TGCGTACAC...

北川山羊PPARD基因克隆及组织表达分析

作者：赵旺生; 袁梦; 李鹏程; 伍仕鑫; 徐传飞; 易川平; 罗辉 刊期：2019年第07期

鳙基于10个微卫星标记的亲子鉴定分析

作者：张丹; 傅建军; 张利德; 方敏; 朱文彬; 王兰梅; 苏胜彦; 董在杰 刊期：2019年第07期

大鳞副泥鳅5个野生群体的遗传多样性分析

作者：白晓慧; 蔡超; 郝爽; 刘克明; 刘义; 李楠焦; 万明; 贾文平 刊期：2019年第07期

利用微卫星分子标记分析了天津地区于桥水库、大黄堡湿地、七里海湿地、团泊水库和潮白新河5个野生大鳞副泥鳅群体的遗传多样性。5个群体在12个微卫星位点共检测到98个等位基因,平均等位基因数为8.500;有效等位基因数为2.713;平均观测杂合度为0.526;平均期望杂合度为0.544。5个群体间的遗传分化指数介于0.021~0.106之间,平均遗传分化指数为0.059...

小鼠大脑皮质星形胶质细胞原代培养与鉴定

作者：许寒晓; 蒋烨; 罗道朋; 李强明; 令狐艳; 李丽娜; 于常海; 余资江; 戈果 刊期：2019年第07期

为探讨简便、高效的大脑皮质星形胶质细胞体外培养方法,本研究取新生24 h内的ICR小鼠大脑皮层,采用物理方法将其分成约1 mm^3,震荡过滤后进行培养。通过拍照的方式记录原代培养1 d、3 d、7 d、14 d、21 d、28 d、35 d和原代培养14 d后再传代培养14 d(记为P2-14 d)细胞形态;通过实时定量PCR和Western blotting比较原代培养1周、2周、3周、4周、5...

棉铃虫人工饲料主要污染细菌鉴定及其抗生素筛选

作者：范季尧; 翁小倩; 郭雅洁; 林白容; 余云钦; 吴松青 刊期：2019年第07期

棉铃虫的人工饲养是对其进行昆虫病原菌生物测定的重要步骤,而饲料污染是影响棉铃虫培养成功率的主要因素。因此,选择合适的抗生素对棉铃虫的饲养具有重要意义。为明确棉铃虫饲料中污染细菌的组成,筛选可抑制污染菌的抗生素,本研究以受污染棉铃虫饲料中分离出的9个菌株为实验材料,观察菌株形态。采用16S rDNA系统发育分析法构建进化树,同时根据...

Cbl-b蛋白的重组表达、纯化和活性检测方法的建立

作者：张彤晖; 胡有天; 吴方 刊期：2019年第07期

Cbl-b是一种重要的泛素连接酶E3酶,负责与多种底物蛋白的特异识别,并因此介导特定蛋白的降解。研究表明,Cbl-b缺失可激活自然杀伤细胞,从而阻止肿瘤的扩散转移,因此Cbl-b被认为是一种肿瘤免疫治疗的新靶点。但目前针对Cbl-b蛋白的生化性质以及体外活力测定方法研究较少。本研究构建了Cbl-b不同结构域的重组表达载体。通过对其表达和纯化条件进行...

采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库

作者：何雨琦; 李桂梅; 周鑫; 李晓璐; 高跃东; 丁昭莉 刊期：2019年第07期

新一代测序技术(NGS)的文库制备方法在基因组的拼装中起着重要作用。但是NGS技术制备的普通DNA文库片段只有500 bp左右,难以满足复杂基因组的从头(de novo)拼装要求。三代测序技术的读长可以达到20 kb,但是其高错误率及测序成本过高使得其又不易推广。因此二代测序的Mate-paired文库制备技术一直在基因组的de novo拼装中扮演着非常重要的角色。...

体外装配核小体过程组蛋白浓度依赖的动力学模型

作者：张凤慧; 郭明欣; 赵宏宇; 蔡禄 刊期：2019年第07期

为探索组蛋白浓度对核小体体外装配的影响,本研究表达纯化了4种组蛋白,通过控制实验反应体系中组蛋白的浓度,利用盐透析法在体外装配了核小体,检测分析了组蛋白浓度与核小体组装效率的关系。以此实验数据为基础,提出了核小体组装过程组蛋白浓度依赖性的动力学模型。实验结果发现,反应体系中组蛋白浓度与核小体生成量呈典型的线性关系。依据动力...

分级分筛式异位重金属污染土壤淋洗技术

作者：徐持平; 周卫军; 徐庆国 刊期：2019年第07期

本研究采用去离子水作淋洗剂,开发一种分级分筛式异位重金属污染土壤淋洗技术,研究显示,土壤中粒径大于25μm颗粒占比接近80%,重金属Pb、Cu、Ni、Cd和Cr含量分别为125.85 mg/kg、85.93 mg/kg、63.29 mg/kg、1.31 mg/kg和108.39 mg/kg,基本符合土壤环境质量二级标准,可用于农田回用土;土壤中粒径小于25μm颗粒占比低于20%,其对应重金属含量超出土壤...

基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法

作者：邓小燕; 徐胜超 刊期：2019年第07期

为了解决生物信息学中基因多序列比对的计算速度慢和软件陈旧的问题,提出了基于Yarn(Yet Another Resource Negotiator)云平台的生物基因多序列比对并行计算方法Yarn_clustalW。分析了clustalW算法的数学模型及其面向MapReduce的任务划分方式,Yarn_clustalW中综合考虑了基因的长度和数目,采用一种基于阈值刻度的任务划分方式。利用NCBI的GenBank...

凝溶胶蛋白基因的生物学功能及其应用研究进展

作者：师书玥; 李丽娟; 寇浩玮; 郑立; 雷初朝; 张禹; 钟佳琳; 陈宏; 黄永震 刊期：2019年第07期

凝溶胶蛋白(gelsolin,GSN)是Gelsolin/Villin超家族的核心成员,是一种多功能的钙依赖性肌动蛋白结合蛋白,在细胞中Ca^2+和PIP2等多因素的调控下,对细胞凋亡、吞噬功能、肌动蛋白微丝切割、细胞信号转导等方面起着重要的作用。近年来,凝溶胶蛋白还被频繁用于相关疾病的预防、诊断与治疗,但其在调控细胞凋亡、炎症等病理生理中的作用机制还存在些...

基于组学技术的鹿茸生物学研究进展

作者：刘文媛; 巴恒星; 李春义 刊期：2019年第07期

鹿茸是唯一可周期性再生的哺乳动物器官,由软骨、骨、血管、神经及皮肤组织构成。鹿茸再生过程是基于干细胞的增殖和分化,且生长速度极快而不发生癌变。其不仅可作为一种肢体再生的生物医学模型,而且也作为一种研究骨组织生长发育的模型。现代组学技术快速发展,已普遍应用于生物学的各种领域。利用组学技术,在转录和蛋白质水平上,有力地推动了在...

人母乳细菌Streptococcus salivarius F286和S.parasanguinis F278对HT29细胞的细胞毒性

作者：曹杰; 申剑 刊期：2019年第07期