基因组学与应用生物学

基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

杂志简介:《基因组学与应用生物学》杂志经新闻出版总署批准,自1982年创刊,国内刊号为45-1369/Q,是一本综合性较强的农业期刊。该刊是一份月刊,致力于发表农业领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

主管单位:广西大学
主办单位:广西大学
国际刊号:1674-568X
国内刊号:45-1369/Q
全年订价:¥ 920.00
创刊时间:1982
所属类别:农业类
发行周期:月刊
发行地区:广西
出版语言:中文
预计审稿时间:1-3个月
综合影响因子:0.89
复合影响因子:1.11
总发文量:5590
总被引量:22448
H指数:38
引用半衰期:5.6203
立即指数:0.0306
期刊他引率:0.8886
平均引文率:19.398
  • 马氏珠母贝NR1基因的克隆、序列分析与表达研究

    作者:吴羽媛; 梁海鹰; 吴家树; 雷倩楠; 黄荣莲; 杜晓东 刊期:2018年第10期

    N-甲基-D-天冬氨酸(N-methyl-D-aspartate, NMDA)受体属于是一类离子型谷氨酸受体,并且与脊椎动物和无脊椎动物的突触可塑性,记忆采集和学习等密切相关。本研究采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得了马氏珠母贝(Pinctada martensii) NR1型受体基因(PmNR1) cDNA全长序列,并且运用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术检测了PmNR1在马氏珠母贝...

  • 马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)Pm-Δ6FAD基因的克隆及其对温度胁迫的响应

    作者:刘雅; 郑哲; 王庆恒; 焦钰; 李利二; 杜晓东 刊期:2018年第10期

    本实验利用RACE技术克隆获得了马氏珠母贝Δ6-脂肪酸去饱和酶(Pm-Δ6FAD)基因,并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR技术分析了该基因在不同组织的表达模式及不同温度下的时序表达模式。序列分析表明,Pm-Δ6FAD c DNA序列全长为1 491 bp,其中开放式阅读框1 125 bp,5'UTR 225 bp,3'UTR 141 bp,编码374个氨基酸,理论蛋白分子量为42.72 k...

  • 基于移动序列模式分析人基因组调控短序列

    作者:施梦军; 赵海峰; 陈虹; 马猛 刊期:2018年第10期

    基因表达过程主要包括转录、剪接和翻译,多种调控元件参与其中,是个高度调控的过程。建模识别分析这些调控元件,对理解基因表达具有重要意义。本研究提出了一个基于移动序列模式的短序列建模模型,并对转录启动子和剪接调控元件进行了建模分析。启动子是基因转录的核心调控元件,剪接调控元件参与调控剪接位点的识别。分类实验结果表明,该模型可有...

  • 基于冗余的序列检测东北虎表达序列标签数据多态性

    作者:李倩; 杜海荣; 元虹懿; 张明海 刊期:2018年第10期

    以本研究室103测序获得的EST序列(expressed sequence tags)和公共数据库(GenBank)中下载的共29 832条东北虎EST序列为分析内容,利用生物软件DNA star对序列进行拼接,得到3 301个重叠群(contigs),含有4条EST以上的187条contigs (拼接序列)中,共获得489个候选SNP位点,其中颠换型、转换型和单碱基的插入与缺失分别为269个,182个和148个。S...

  • 百宜黑鸡PRL基因多态性检测与生物信息学分析

    作者:韩雪; 吴松成; 伍革民; 粟朝芝; 朱丽莉; 陶宇航; 陈林 刊期:2018年第10期

    为了对PRL基因的遗传机理进行更进一步的研究,本试验以百宜黑鸡为研究对象,利用DNA池结合PCR技术对PRL基因的全部外显子进行克隆扩增,并对扩增产物进行直接测序,运用生物信息软件进行序列分析。结果表明,仅在第五外显子发现了4个单核苷酸突变位点,4个位点分别位于该基因的位置为g.6171 C〉T、g.6232 C〉G、g.6306 C〉T和g.6440 T〉C,其中只有g.6...

  • 大口黑鲈NPY基因多态性及与生长的关联分析

    作者:李胜杰; 刘浩; 白俊杰; 吴建开; 马冬梅; 费志平; 樊佳佳; 孙建国 刊期:2018年第10期

    神经肽Y (NPY)是鱼类摄食调控网络中具有促进食欲的摄食因子,NPY基因上的多态性可能影响鱼类的摄食进而对生长性状产生影响。本研究通过PCR扩增和直接测序在大口黑鲈NPY基因5'非编码区筛选获得1个SNP位点S1 (A-85C)。随机选取同塘饲养的12月龄大口黑鲈327尾作为分型群体,采用SNaPshot方法检测每尾鱼中S1位点的基因型,运用Popgene 32软件进...

  • 家蚕全基因组微卫星分布规律及其生物信息学分析

    作者:甘丽萍; 谭爽; 戚文华; 石汝杰 刊期:2018年第10期

    本研究利用MSDB v2.4软件以及生物信息学方法获取了家蚕全基因组的完整型SSRs序列,并对其分布规律进行比较分析。家蚕全基因组中SSRs总数量为141 311个,相对丰度为209.01 No/Mb,总长度为2.41 Mb,全基因组SSRs六种碱基重复类型的数量和密度分布模式为:单碱基〉四碱基〉三碱基〉二碱基〉五碱基〉六碱基,说明全基因以单碱基为主要碱基类型,六种碱...

  • M、F型ATP8基因在雌雄三角帆蚌不同发育时期的表达差异研究

    作者:吴丛迪; 陈亚; 汪桂玲; 李家乐; 王雅昱; 郭鹏飞 刊期:2018年第10期

    双壳贝类中有两种线粒体遗传方式,一种通过精子传递线粒体基因组,一种通过卵子传递线粒体基因组。这种现象被称为线粒体基因组的双单亲遗传(doubly uniparental inheritance, DUI)。本实验首先对三角帆蚌(Hyriopsis cumingii) F、M-type ATP8基因进行了克隆,得到了它们的cDNA全序列。F-type ATP8基因全长275 bp,编码49个氨基酸;M-type ATP8...

  • 基于转录组分析红耳龟盐度适应的离子调节

    作者:洪美玲; 李江月; 江爱萍; 丁利; 史海涛 刊期:2018年第10期

    外来有害入侵物种红耳龟(Trachemys scripta elegans),原属于淡水龟类,但目前研究发现其可存活于半咸水环境中,这使得未来红耳龟可入侵的潜在范围及危害将增大。为了探究红耳龟对盐度适应的分子机制,本研究应用高通量转录组测序技术,分析其在不同盐度环境中参与离子调节的主要基因及通路。我们设计了三个处理组:对照组(自来水)、低盐度组(...

  • 基于功率谱分析的外显子三周期特性的影响因素研究

    作者:耶晓东; 张军英 刊期:2018年第10期

    针对不同长度外显子的三周期特性强弱不同,尤其是短外显子的三周期较弱的情况,利用Matlab软件建立了DNA序列外显子仿真模型。研究了外显子长度、碱基ATCG在密码子3个位置上出现的概率及不同映射方法对外显子三周期特性的影响。研究结果表明:当碱基ATCG在密码子的3个位置的概率一定时,随着外显子长度的增加,三周期特性会越来越明显,并具有一定的...

  • 哈氏弧菌(Vibrio harveyi)lexA基因的克隆与原核表达

    作者:常云胜; 周维; 高增鸿; 丁燏 刊期:2018年第10期

    LexA是调节SOS反应的阻遏蛋白,而且与细菌耐药性的形成密切相关。本研究以水产养殖经济动物的条件致病菌哈氏弧菌ZJ0603基因组DNA为模板,设计同源引物克隆出SOS基因lexA,并对lexA基因进行了生物信息学分析;构建了lexA基因的原核表达载体PGEX-lexA,在大肠杆菌BL21(DE3)中诱导表达成功,还对LexA蛋白表达的诱导温度、时间、IPTG浓度等条件进行了...

  • 水稻穗发育相关基因酵母双杂交cDNA文库的构建

    作者:邱牡丹; 李莉; 李懿星; 王建龙 刊期:2018年第10期

    利用cDNA文库筛选与已知功能蛋白质互作蛋白质,是研究蛋白质之间相互作用的重要途径之一。本试验利用水稻武运粳7号(95-22)穗为材料,构建了一个穗发育相关基因酵母双杂交cDNA文库,试验表明,本实验构建的cDNA初级文库容量和目的文库容量分别为1.44×107 CFU/mL和9.6×106 CFU/mL,重组率均为95%;初级文库插入片段长度介于500~2 000 bp之间,目的文...

  • 广西巴马小型猪内源性反转录病毒类型群体检测

    作者:邹辉; 李禄彬; 崔悦悦; 夏琴; 吴延军; 何剑雄; 蒋钦杨; 郭亚芬; 兰干球 刊期:2018年第10期

    抽样检测广西巴马小型猪内源性反转录病毒(PERV),了解广西巴马小型猪携带PERV的情况。为培育无PERV广西巴马小型猪提供依据。对广西巴马小型猪PERV-A、PERV-B基因亚型以及陆川猪PERV-C基因亚型进行基因克隆分析,三种亚型基因克隆片段与NCBI上的目的片段一致,确保了PCR分型方法检测PERV的准确性。根据通用的env基因分型方法检测广西巴马小型猪...

  • 桑花叶萎缩类病毒基因组结构特征及聚类分析

    作者:孔卫青; 杨金宏 刊期:2018年第10期

    桑花叶萎缩类病毒(Mulberry mosaic dwarf viroid, MMDVd)是近些年发现的桑花叶型萎缩病的病原物,本研究利用Mfold等软件和保守序列分析了MMDVd的二级结构及其中存在的核酶,并进一步对类病毒和卫星RNA进行了聚类分析,以期解决其分类和进化地位。结果表明MMDVd的正链存在典型的锤头型核酶结构,自切割位点为AUC,负链存在有疑似发夹型核酶的二级...

  • 内蒙古西部地区土壤放线菌的多样性分析

    作者:王雪寒; 夏冬双; 武志华; 任兴波; 丁一秀; 马强; 刘惠荣 刊期:2018年第10期

    为明确内蒙古西部地区放线菌的多样性,为未来该地区放线菌资源的开发利用及生态系统的稳定性提供一定的理论基础。本研究从内蒙古西部地区采集土壤样品,提取土壤样品的总DNA,通过巢式PCR扩增放线菌16S rRNA基因片段,利用DGGE (denaturing gradinent gel electrophoresis)技术进行分析,切胶回收,再利用不带GC夹子的引物进行扩增,将PCR产物送往...