基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

陆川猪GPR1基因的克隆及生物信息学分析

作者：谢婉; 何剑雄; 陈宝剑; 关志惠; 郭亚芬; 兰干球; 谢炳坤 刊期：2018年第08期

本试验旨在对陆川猪G蛋白偶联受体1（G protein-coupled receptor 1,GPR1）基因进行克隆及相关生物信息学分析。本研究根据NCBI上公布的野猪GPR1基因序列设计引物,应用RT-PCR技术扩增得到包含全长编码区在内的基因片段,应用生物信息学软件对陆川猪GPR1基因的理化性质,修饰结构,二级结构和三级结构进行分析。结果显示：GPR1基因编码区全长1 068 b...

陆川猪SOCS3基因克隆及生物信息学分析

作者：夏琴; 崔悦悦; 邹辉; 瞿秋红; 江雨航; 蒋钦杨; 黄艳娜 刊期：2018年第08期

细胞因子信号通路抑制因子3（SOCS3）是一类调节机体免疫和神经内分泌功能的生物活性物质。本研究以陆川猪背最长肌cDNA为模板,克隆获得了SOCS3基因编码区序列（CDS）。序列分析结果显示,陆川猪SOCS3基因CDS全长为690 bp,与Gen Bank中公布的长白猪的CDS的同源性为99.9%,并发现存在第70位点的A→G,碱基G为陆川猪所特有,导致苏氨酸突变为丙氨酸。...

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作者：殷弋轲 刊期：2018年第08期

金黄色葡萄球菌,又称为＂金葡菌＂或＂嗜肉菌＂,隶属于葡萄球菌属（Staphylococcus）,是一种革兰氏阳性细菌。典型的金黄色葡萄球菌为球型,直径0.8滋m左右,显微镜下排列成葡萄串状。金黄色葡萄球菌无芽胞、鞭毛,大多数无荚膜,革兰氏染色呈阳性。

猪Nramp1基因外显子2的SNP位点筛选及生物信息学分析

作者：刘丽霞; 张丽; 古少波; 杜倩 刊期：2018年第08期

本研究采用DNA混合池扩增并进行直接测序的方法,对3个引进猪种和3个地方猪种Nramp1基因外显子2的SNP位点进行筛选,并通过生物信息学软件对该基因的m RNA二级结构、蛋白质二级结构和功能进行预测。结果在2个引进猪种（大白猪,长白猪）和3个地方猪种（八眉猪,蕨麻猪,烟台黑猪）中共检测到2个SNP位点,分别为T~（62）C和A~（92）G,而在杜洛克猪中未...

藏山羊KLF6基因克隆及组织表达分析

作者：池永东; 王永; 朱江江; 林森; 赵越; 林亚秋 刊期：2018年第08期

本试验旨在获得藏山羊KLF6基因序列,并分析其序列生物学特征,同时阐明该基因在不同组织中的表达情况。利用RT-PCR技术克隆藏山羊KLF6基因序列,利用实时荧光定量PCR检测其在藏山羊各个组织中的表达丰度。结果表明,获得藏山羊KLF6基因序列1012 bp（登录号：KY677697）,其中包括5＇UTR序列3 bp和3＇UTR序列154 bp,CDS为855 bp,编码284个氨基酸,为无...

贵州黑山羊、黔北麻羊IL-2基因的克隆与生物信息学分析

作者：鲜思美; 李鹏飞; 刘嫒; 李婷; 包细明; 张益; 冯将 刊期：2018年第08期

为获得贵州特色品种黑山羊与黔北麻羊IL-2基因,本试验以Con A刺激的贵州黑山羊与黔北麻羊外周血淋巴细胞为材料,采用RT-PCR方法分别扩增贵州黑山羊与黔北麻羊IL-2基因,进行克隆与生物信息学分析。结果显示,（1）贵州黑山羊与黔北麻羊IL-2基因核苷酸与氨基酸一致性为100%,完整编码阅读框大小为468 bp,编码155个氨基酸;（2）黔北麻羊、贵州黑山羊I...

斑马鱼tnfb启动子的克隆和报告基因载体的活性分析

作者：张秋月; 丁安; 张哲; 潘杲英; 李伟明; 张庆华 刊期：2018年第08期

本研究通过采用生物信息学软件预测细胞因子tnfb基因5＇上游2 000 bp左右的序列,并预测其相关的转录因子,克隆启动子,构建双荧光素酶报告基因表达载体,经双酶切和测序鉴定,最后通过双荧光素酶报告基因系统检测重组载体的活性。研究发现tnfb的转录因子结合位点为：Oct-1、TBP、GATA-1、RSRFC4、GLO、C/EBPα、NF-资B、ER、Pit-1a、Oct-2、Oct-2.1...

家畜全基因组分析中稀有变异上位效应检测方法

作者：梅步俊; 王志华 刊期：2018年第08期

下一代测序技术的出现和检测费用不断下降清除了稀有变异检测的技术障碍,可以检测出包括常见变异和稀有变异在内的数以千万的遗传变异,其中绝大部分的变异都是稀有变异。这种情况对统计分析方法和结果解释提出了新的挑战。当前最为流行的全基因组分析方法主要针对常见变异间上位效应的检测问题,家畜育种中较少涉及稀有变异间、稀有变异-常见变异...

Legume Genomics and Genetics（LGG）

刊期：2018年第08期

马氏珠母贝（Pinctada fucata martensii）PmGIFLP基因的分子特征与表达分析

作者：范闪闪; 李绮晴; 郑哲; 郝瑞娟; 杜晓东; 焦钰 刊期：2018年第08期

胃内因子（gastric intrinsic factor,GIF）是一种转运蛋白,在介导维生素B12（VB12）维持机体正常造血功能、神经系统功能和免疫调节功能等方面发挥重要作用。为探究胃内因子样蛋白（gastric intrinsic factorlike protein,GIFLP）在马氏珠母贝免疫调节中的作用,本研究运用RACE技术获得马氏珠母贝胃内因子样蛋白基因（Pm GIFLP）的c DNA序列全长...

International Journal of Super Species Research

刊期：2018年第08期

活泼与不活泼褐牙鲆尾部神经系统UI表达差异的研究

作者：元辉明; 邹华锋; 吕为群 刊期：2018年第08期

日本褐牙鲆是主要的广盐性底栖鱼类,主要分布于我国的黄渤海及东海和朝鲜半岛、日本、俄罗斯等地区,是我国重要的经济鱼类之一。本研究运用行为学方法筛选得到了活泼与不活泼褐牙鲆,并从呼吸代谢的生理方面比较了两者的差异,呼吸代谢研究显示活泼褐牙鲆的标准代谢率（SMR）,最大代谢率（MMR）和绝对有氧范围（AAS）都比不活泼褐牙鲆高。免疫组化...

Journal of Mosquito Research（JMR）

刊期：2018年第08期

基于SLAF-seq技术的沙带鱼（Lepturacanthus savala）微卫星标记开发以及在近缘种中的通用性

作者：张浩冉; 梁镇邦; 吴仁协; 牛素芳; 梁炎; 王权; 韦欢; 肖瑶; 孙贝 刊期：2018年第08期

沙带鱼是带鱼科中一种重要的海洋经济鱼类,广泛分布于印度-西太平洋海域。近年来,过度捕捞和渔业生态环境变化使沙带鱼的自然资源和种群结构受到了严重影响。因此,为了制定出科学合理的资源保护和管理措施,急需开发出大量多态的沙带鱼微卫星位点以促进其种群遗传学研究。本研究采用SLAF-seq技术,首次在沙带鱼基因组DNA中筛选出28个多态性微卫星...

脊椎动物酪氨酸激酶基因家族差异进化研究

作者：刘当云; 谷迅 刊期：2018年第08期

酪氨酸激酶（PTKs）基因家族是后生动物信号网络的核心组分,在细胞通讯、细胞粘附、细胞增殖和分化过程中起着关键作用,与人类许多疾病的发展密切相关。根据结构的不同,PTKs可分为两类：胞质型酪氨酸激酶（CTKs）和受体型酪氨酸激酶（RTKs）。通过多角度进化分析,我们发现在脊椎动物进化过程中RTKs比CTKs经历了纯化选择压力的放松,拥有更复杂的...