杂志简介:《基因组学与应用生物学》杂志经新闻出版总署批准,自1982年创刊,国内刊号为45-1369/Q,是一本综合性较强的农业期刊。该刊是一份月刊,致力于发表农业领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。
作者:张津闽; 张小玉; 林森; 黄林; 郑玉才; 林亚秋 刊期:2018年第04期
本研究旨在克隆藏系绵羊BMP2基因序列,并获得其生物学特征,同时阐明其组织表达规律。提取藏系绵羊皮肤组织的总RNA,利用RT-PCR技术克隆BMP2基因序列,同时利用荧光定量PCR技术检测该基因在不同组织中的表达情况。结果表明,获得藏系绵羊BMP2基因序列1 217 bp,其中CDS区长度为1 188 bp,编码395个氨基酸。BMP2蛋白有36个磷酸化位、6个糖基化位点和1...
作者:石斌刚; 谢建鹏; 胡江; 高小莉; 罗玉柱; 李少斌; 石红梅 刊期:2018年第04期
角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)是毛纤维的主要结构成分。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛和野血牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测KAP6-1和KAP6-4基因外显子序列多态性。结果表明4个牦牛群体的KAP6-1基因外显子区存在c.42T〉C、c.135C〉T的同义突变及c.173G〉C、c.175G〉T的非同义突变,导致p.Cys58Ser和p.Gly59Cys的...
作者:王净; 王鹏; 王长顺; 史冠旭 刊期:2018年第04期
为了确定中国小反刍兽疫各毒株间的进化关系,本研究从Gen Bank下载世界各国PPRV全基因组序列,以生物信息学方法建立遗传进化树。搜集到13株PPRV全基因组序列,其中中国10株,印度3株,巴基斯坦0株。中国2013~2014年毒株在同一个分支,2014年北京毒株和同年份的其它毒株相比枝条最长,2015年新疆巴州毒株独立成一个小分支。2014~2015年每一个毒株和201...
作者:谭杰; 彭晓君; 刘志刚; 高友; 刘付少梅 刊期:2018年第04期
利用微卫星(SSR)分子标记技术,对墨西哥湾扇贝和“中科红”海湾扇贝2个群体共80个个体的遗传结构和遗传多样性进行分析。结果显示:6个微卫星位点共扩增出31个等位基因,各位点的等位基因数为4~8个,平均等位基因数为5.2个;墨西哥湾扇贝与“中科红”海湾扇贝群体平均有效等位基因数(Ne)分别为2.890、2.753;平均观测杂合度(Ho)分别为0.415、0...
作者:张正义; 邢秀梅; 胡鹏飞; 刘松啸; 董依萌; 鞠贵春 刊期:2018年第04期
未来养殖业的持续发展中,离不开完善的家族系谱,微卫星的亲子鉴定为精确繁殖策略和群体总体质量提供了有力的工具。只有利用亲子鉴定技术才能对家族系谱进行有效的修改和完善,才能进行优势选择,扩大优势生产力。微卫星分子具有共显性遗传、稳定性好、多态性高等特点,已经成为第二代分子标记,并在动物上面应用广泛。通过对猪、马、羊、牛等大家畜...
作者:聂宗恒; 白俊; 许姝歆; 汪雁; 朱春潮; 王洪举; 卓玛央金; 刘彩; 马兵成; 石林波; 张小燕; 洪芬芳; 王一帆; 闵卫平; 邹节新; 周宪民 刊期:2018年第04期
日本血吸虫(Schistosoma japonicum)等具有重要流行病学意义的寄生虫,在分类学上均隶属于吸虫纲(Trematoda)的复殖亚纲(Digenea)。目前,对复殖亚纲成虫及虫卵形态、生活史及其防治的研究已较为深入,分子生物学手段也已逐渐应用于人体寄生虫学研究领域,但在基因组学角度对该类群遗传特征的系统性研究尚不多见。自首条人类线粒体基因组公布...
作者:徐嘉威; 贺花; 沈雪梅; 刘鲲鹏; 雷初朝; 陈宏; 黄永震 刊期:2018年第04期
基因编辑技术近几年来受到了极大的关注,被广泛运用于生命科学研究以及临床应用等方面。本研究综述了基因编辑主要的方法手段,包括以锌指蛋白核酸酶(zinc-finger nucleases)为核心的ZFN方法、以转录激活子样效应核酸酶(transcription activator-like effector nucleases)为核心的TALEN技术还有以RNA指导的CRISPR/Cas 9(clustered regularly...
作者:姚彦敏; 高乐; 张东远; 令利军 刊期:2018年第04期
本研究依托桧状青霉的基因组学和蛋白组学数据,发现一种新型的阿魏酸酯酶。利用PCR技术成功扩增得到桧状青霉阿魏酸酯酶的基因,构建真菌表达盒通过原生质体的方法将其转化到黑曲霉中。通过SDS-PAGE检测和酶活力检测验证该阿魏酸酯酶成功地在黑曲霉胞外分泌表达。根据氨基酸序列相似性和底物特异性分析都显示该阿魏酸酯酶属于C型的阿魏酸酯酶,与...
作者:韩军军; 段斐; 刘进兰; 张爱东; 张玉明; 李红权 刊期:2018年第04期
Bacillus coagulans IPE22是一株重要的乳酸生产菌,对其乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)基因进行克隆、表达和生物信息学分析十分必要。以B.coagulans36D1序列信息(Gen Bank:CP003056.1)设计引物,PCR扩增获得B.coagulans IPE22中LDH(Bc-LDH)基因,构建重组表达质粒并转化Escherichia.coli BL21(DE3)中进行诱导表达,针对Bc-LDH的...
作者:包建莹; 刘斌; 耿阳; 颜日明; 张志斌; 汪涯; 朱笃; 杨慧林 刊期:2018年第04期
为了实现内生真菌Shiraia sp.Slf 14菊粉酶基因在大肠杆菌中的高效表达,建立有效的包涵体复性技术,获得有活性的重组菊粉酶,本研究通过提取Shiraia sp.Slf 14的总RNA,反转录合成cDNA,设计PCR引物扩增出菊粉酶基因,将其克隆至pET-22b(+)载体后转入E.coli BL21(DE3),利用SDS-PAGE法检测IPTG诱导表达后重组蛋白的表达情况,并进一步检测了包涵...
作者:黄庆; 唐乐丽; 王晓萌; 范新炯; 李荷 刊期:2018年第04期
利用生物信息学方法对β-葡萄糖苷酶Bgl2238的氨基酸序列进行分析。采用Prot Param、DNAMAN、Multicoil、SOPMA、PROSAN等软件对其理化性质、亲/疏水性、不稳定指数、PEST序列、蛋白质二级结构及蛋白质修饰位点等重要参数进行预测,并对其三级结构进行同源建模及模建结果质量的评估。结果发现:Bgl2238由745个氨基酸组成,蛋白质序列中α-螺旋占36.6...
作者:周阳; 刘莉; 宋宇; 吴奇梅; 欧国香; 彭雪娇; 欧刚卫; 杨加伟 刊期:2018年第04期
在手性亚砜类药物合成领域,利用单加氧酶催化硫醚底物生成手性亚砜中间体是最便利和绿色的新方法。但是,现阶段具有高底物耐受、高选择性和高活性的加氧酶相当匮乏。本研究从课题组前期获得的能够高效催化硫醚生成手性亚砜的假单胞菌中克隆出编码甲苯单加氧酶的两个基因,构建共表达载体进行重组表达。最后将整细胞作为催化剂催化苯甲硫醚,初步探...
作者:付珊; 陈墨; 薛双; 覃宏平; 尹朝群; 何勇强; 姜伟 刊期:2018年第04期
双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCSs)是微生物适应外界环境最重要的调控系统。十字花科黑腐病菌是引起十字花科黑腐病的主要致病菌,其中有111个双组分调控基因,包括两个未知功能的基因:XC3981和XC3982。为了研究其功能,我们通过同源双交换构建了这两个基因的缺失突变体,并对其进行表型检测及功能互补,结果表...
作者:蔡刘滕子; 谢晶晶; 陈亚文; 周晨妍; 李同彪 刊期:2018年第04期
利用生物信息学分析黑曲霉木聚糖酶Xyn ZF-2,选择α-螺旋178位点、170位点和180位点氨基酸进行定点突变(K178M,S170F,G180V)获得突变木聚糖酶基因xyn MFV,构建重组表达载体转化大肠杆菌E.coli BL21(DE3)诱导表达。酶学性质分析对比发现,突变酶最适温度(50℃)比原酶(40℃)提高了10℃;40℃条件下保温1 h突变酶Xyn MFV相对酶活力下降到热处...
作者:曹迅; 王晓; 董子维; 沈琼雯; 邓年方; 李有志 刊期:2018年第04期
以贵州喀斯特地貌地区土壤为材料,采用稀释平板法基于解钾细菌培养基从该地区中分离筛选鉴定出10株解钾细菌:SHD144K1(Pseduoxanthomonas japonensis)、SHD131K2(Paenibacillus illinoisensis)、ML280K1(Rhodococcus ruber)、ML289K1(Variovorax soli)、PT258K1(Pa.taichungensi)、GZ2K2(Rhizobium tropici)、GZ2K1(Burkholderia ...