作者:万晴; 马德珍; 张忠; 赵爱华; 张瑞玲 期刊:《中国病原生物学》 2019年第12期
目的探讨白纹伊蚊不同发育期可培养共生细菌的多样性。方法培养白纹伊蚊不同发育期共生菌,根据菌落形态特征和16S rDNA序列的系统发育分析,判定分离的可培养细菌种类。结果共分离到17株细菌,隶属于4个门、8个科、14个属,其中变形菌门是优势菌群;幼虫、蛹和雌蚊中分别分离到7、8、8株细菌,且3个发育期各分离到4个特有菌株。结论白纹伊蚊体内可培养共生细菌具有多样性,可为利用细菌进行蚊虫生物防制提供基础资料。
作者:邬张颖; 徐凡舒; 钟依妮; 马佳莹; 朱欣; 张慧娟; 蒋明 期刊:《贵州农业科学》 2020年第01期
为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌...
作者:周小飞; 熊文艳; 吴恩凯; 张欢; 张婷婷; 彭春秀 期刊:《中国食品学报》 2020年第01期
作者:陈至里; 沈娟; 王影姣; 方霞; 金小宝 期刊:《生物学通报》 2016年第11期
分离鉴定美洲大蠊肠道内生细菌。并初步研究了其抑菌活性。采用平板稀释法对美洲大蠊肠道内生细菌进行分离纯化.分离菌株通过形态学观察和16S rDNA基因序列BLAST比对进行种属鉴定。以金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、大肠埃希氏菌4株细菌为对象,采用牛津杯法初步鉴定各分离菌株的抑菌活性。BLAST比对分析结果表明:从15只美洲大蠊肠道内分离鉴定出125株内生细菌,分属12科20属。初步抑菌活性显示:部分...
作者:王琦琦; 张瑶; 雷勇辉; 冯丽; 熊杰; 孙燕飞 期刊:《生物资源》 2019年第01期
为了探究新疆本土蟠桃园可培养酵母菌多样性,并挖掘功能酵母资源,本研究以新疆石河子蟠桃园3年、8年、15年树龄的根际和非根际土壤以及桃树叶片为材料,经过传统的分离培养方法获得可培养的酵母菌菌株,并进行形态学、生理生化以及26S r DNA的D1/D2区序列分析,共获得可培养酵母菌129株,从属于12个属17个种,其中子囊菌酵母为优势菌群,占分离属的88%,分布于威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces),Vanrija属,Barnettozyma属和有孢圆酵母属(To...
作者:刘晓杰; 赵瑾; 郭扬; 吴春辉; 陈华新; 姜鹏 期刊:《海洋科学》 2019年第12期
海藻共附生细菌密切参与宿主的生长发育、营养吸收等重要过程,浒苔(Ulva prolifera)是构成黄海绿潮的唯一优势种,对其共附生细菌开展群落结构分析,有望为成灾机制研究提供重要线索。由于植物叶绿体基因组同时具备原核特征和高拷贝数,会严重干扰共附生细菌基于16S rDNA的序列扩增。高等植物中开发了通用引物799F,利用其3′末端与植物同源区的非配对双碱基,可实现对细菌来源序列的特异性扩增。本文针对多个浒苔群体样本,首次评价了引...
作者:韩学平; 刘宏金; 胡林勇; 徐世晓; 艾德强; 付弘贇; 陈永伟; 赵建忠 期刊:《动物营养学报》 2020年第01期
作者:华彦; 郎鹏飞; 王洪堂; 王姣; 曹和琴; 姜广顺 期刊:《野生动物学报》 2020年第01期
肠道真菌是肠道菌群的重要组成部分,对维系肠道菌群结构与功能发挥了重要的作用。华北豹是国家Ⅰ级保护野生动物,是中国特有的豹亚种,对其肠道真菌多样性的研究是濒危野生动物迁地保护的重要内容。本研究选取24份野生华北豹粪便样品、7份圈养华北豹粪便样品,运用18S rDNA高通量测序技术,测定野生和圈养华北豹肠道真菌多样性。结果表明:子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、毛霉门(Mucoromycota)、壶菌门(Chytridiomyco...
作者:韩兴; 何运转; 康占海; 王高杨; 王冰; 李亚宁; 刘大群 期刊:《作物》 2019年第06期
茎基腐病是河北省安国市掌叶半夏(Pinellia pedstisecti)生产中为害较严重的多发性病害,对该病害的病原菌进行了分离、鉴定、致病性测定和防治药剂的筛选。通过形态鉴定和rDNA-ITS序列分析,将安国掌叶半夏茎基腐病的病原菌鉴定为瓜果腐霉(Pythium aphanidermatum)。选用5种常用化学杀菌剂、2种生物杀菌剂和玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63抗生素粗提物对aphanidermatum进行室内毒力测定,结果表明:35%精甲霜灵ES、玫瑰黄链霉菌Men-myco-...
作者:朱昶宇; 陆凯晖; 伊珍珍 期刊:《水生生物学报》 2020年第01期
文章分别在丰水期和枯水期于珠江广州段和西江广东段43个样点采集水样,基于末端限制性长度多态性分析,研究了珠三角地区珠江水体的浮游真核微型生物的分子多样性及其群落结构和水体理化因子的关系。结果表明,西江广东段及珠江广州段水体氮和磷严重超标,水质状况堪忧。枯水期样本浮游真核微型生物香农威尔多样性指数普遍高于丰水期样本,西江广东段样本浮游真核微型生物多样性指数普遍高于珠江广州段样本。不同水期,不同区域的浮游真...
作者:白杰; 周美红; 胡秀彩; 吕爱军; 叶明皓; 孙敬锋 期刊:《大连海洋大学学报》 2019年第06期
为探明患病巴西龟Trachemys scripta elegans的病原及其生物学特征,从病龟体内分离获得1株革兰氏阴性细菌,编号为TC-1,采用PCR方法扩增16S rDNA、gyrB基因序列,将其亚克隆到pMD18-T载体中测序获得片段大小分别为1503 bp、989 bp,与GenBank中模式菌株弗氏柠檬酸杆菌Citrobacter freundii序列相似性分别为99.60%、98.80%;系统进化树分析显示,分离菌株与C.freundii自然聚为一支,最终鉴定分离菌株TC-1为弗氏柠檬酸杆菌;药敏试验显示,TC...
作者:白映禄; 薛玉丽; 常芸; 尚素琴 期刊:《甘肃农业大学学报》 2019年第05期
【目的】明确甘肃省叶螨属和全爪螨属种群遗传多样性及系统发育关系.【方法】对采自甘肃省的不同地理种群及不同寄主的共27个叶螨种群的rDNA ITS1序列进行PCR扩增并测序,利用MEGA 6.0软件分析叶螨不同种群的序列差异情况,采用NJ法构建系统发育树并进行系统关系分析.【结果】共获得27条叶螨rDNA ITS1序列,长度范围在596~688 bp,A、T、C、G平均含量分别为32.5%、31.0%、18.6%,17.9%,A+T含量(63.5%)高于G+C(36.5%)含量,有明显的A/T偏...
作者:徐婧; 胡兰; 刘可杰; 张明会; 姜钰; 徐秀德 期刊:《沈阳农业大学学报》 2019年第05期
高粱炭疽病是近年来我国高粱产区严重发生的高粱病害,局部地区已造成严重的高粱产量损失。为了明确我国高粱炭疽病症状类型及其相应的病原菌种类,为病害田间诊断和抗病育种提供理论指导,于2015~2017年连续3年,对我国8省13市高粱产区高粱炭疽病发生情况进行系统调查,依据高粱炭疽病病斑形状、颜色、晕圈有无、分生孢子盘和孢子有无及数量多少等特征,将不同地区的高粱炭疽病症状分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ等8种类型,不同类...
作者:陈莎; 杨柳; 张世国 期刊:《国际检验医学》 2019年第S02期
目的评价两种基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS)-安图Autof ms1000和美华M100对临床常见分离菌鉴定的准确性。方法收集来自不同医院881株临床菌株:311株革兰阳性菌、436株革兰阴性菌、127株酵母菌、7株厌氧菌,采用两台不同厂家的质谱仪上机鉴定鉴定,结果不一致菌株采用16SRNA测序确认,对鉴定结果进行分析比较。结果安图Autof ms1000对881株临床常见菌鉴定属和种的准确率分别为99.89%和99.09%,美华M100对881株临床...
作者:索效军; 杨前平; 陶虎; 熊琪; 李晓锋; 陈明新; 张年 期刊:《黑龙江畜牧兽医》 2019年第19期
为了解湖北黑头羊瘤胃细菌多样性及群落结构,选择体重(35±2)kg、安装有永久性瘤胃瘘管的12月龄湖北黑头羊羯羊15只,正常饲喂20 d后采集瘤胃液样品,提取样品总DNA后对细菌16S rDNA序列的V4区进行PCR扩增,利用Illumina MiSeq PE300平台对扩增子进行高通量测序,并采用QIIME等软件对测序序列进行生物信息学分析。结果表明:15个样本共获得高质量有效序列51 762条,基于97%相似性共归为851个操作分类单位(OTU);α-多样性指数表明Chao1、Ace...
作者:陈博文; 成鑫花; 廖秋妮; 陈艳艳; 李尚泉; 吴家法; 龙寒; 禤金彩; 刘红全; 何秀苗 期刊:《南方农业学报》 2019年第10期
【目的】鉴定广西北部湾近海产胞外多糖(EPS)的海洋细菌种类多样性,并测定其EPS生物学活性,为后续研究EPS活性及其开发利用打下基础。【方法】采用黏液比色法、乙醇沉法和苯酚硫酸法初筛产EPS细菌,通过16S rDNA序列鉴定细菌种属并进行遗传进化分析,以1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)测定EPS的抗氧化活性。【结果】从广西北部湾近海海水、沙粒和红树林泥土中共分离出205株产EPS细菌,结合分离株的菌落特征和形态观察结果可将所分离获...
作者:谢文娟; 黄江; 马小军 期刊:《华南农业大学学报》 2019年第06期
【目的】了解45S和5S rDNA序列在20种葫芦科Cucurbitaceae植物基因组中位点数目和分布特点,为研究葫芦科植物核型、遗传育种和进化分类等提供依据。【方法】采用改进的荧光原位杂交(FISH)法,在45S rDNA和5S rDNA的5′端进行荧光修饰,对20种葫芦科植物中期染色体进行45S和5S rDNA的物理定位,在Nikon 80i荧光显微镜下观察,冷CCD收集图像并分析。【结果】确定了金瓜Gymnopetalum chinense、波棱瓜Herpetospermum pedunculosum、葫芦La...
作者:吕品; 亓倩; 杨璞; 陈航; 陈晓鸣 期刊:《林业科学研究》 2019年第05期
[目的]探明白蜡虫二龄雌雄若虫共生菌的种类和结构。[方法]利用高通量测序技术,对白蜡虫二龄雌雄虫16SrRNA的V3-V4区进行高通量测序,使用Uparse软件对有效标签进行聚类,使用Mothur方法与SILVA的SSUrRNA数据库进行物种注释,分析雌雄间共生菌物种丰度及多样性的差异。[结果]共得到了1 798 646条有效标签,以97%相似度为标准进行聚类分析,得到1 334个OTUs,其中,有14个门,29个纲,60个目,109个科,165个属,55个种得到注释。与其他昆虫明显...
作者:赵晓曼; 赵松宇; 孙婷婷; 田雪亮; 弭宝彬 期刊:《中国蔬菜》 2019年第12期
为了评价转mapk双链RNA表达载体黄瓜的生物安全性,明确其对根际土壤线虫多样性的影响,采用18S rDNA基因克隆文库方法对转mapk双链RNA表达载体黄瓜和非转基因黄瓜根际土壤线虫多样性进行研究。结果表明,转基因黄瓜和非转基因黄瓜根际土壤线虫均以食细菌线虫为主,其中小杆线虫属、头叶线虫属、拟丽突线虫属为优势属。转基因和非转基因黄瓜根际土壤线虫多样指数和生态指数无显著差异,表明转mapk双链RNA表达载体基因黄瓜对土壤线虫群落...
作者:古扎丽阿依·牙生; 库热西·马木提汗; 艾山江 期刊:《分子植物育种》 2019年第19期
蓝藻(Cyanobacteria)是地球上生存最古老,形态结构较简单的一类原核生物。目前藻类研究比较集中于淡水藻与海洋藻类,关于塔克拉玛干沙漠蓝藻的生物学鉴定研究尚未报道。本研究以从塔克拉玛干沙漠中分离,纯化的5株藻种为样品进行显微结构观察与16S核糖体RNA基因(16S rDNA)序列分析。结果表明:5株藻细胞均为丝状,呈蓝绿色,除了藻种Y4外,其他藻种都有明显的分节点。从同源性分析结果来看,5株藻种均属于蓝藻纲(Cyanophyceae)的颤藻目(O...