摘要：基因mRNA的结构靶点筛选是反义核酸药物研发的一个难题，免(Oryctolagus cuniculus）β珠蛋白基因mRNA的结构靶位点通过运用MAST技术筛选获得，和计算机软件RNAstructure3.71模拟分析的位点进行了比较，也和寡核苷酸微阵列杂交技术筛选获得的靶点结果(M.Natalie，1997)进行了比较，显示：据MAST技术获得的兔β珠蛋白基因2个反义核酸结合靶位点，和用RNAstructure3.71软件给出的模拟分析的2个靶位点相同，且它们与寡核苷酸微阵列杂交技术的结果完全一致,运用MAST技术筛选获得绿色荧光蛋白(GFP)mRNA有4个结构靶位点，体外分析表明这4个靶位点均有效，其中有3个与RNAstructure3.71软件分析的靶点相同，但计算机模拟推荐的结构靶位点较多，而且随着基因长度增加确认靶位点的难度增大，获得的靶位点还需要实验验证，计算机软件模拟分析对实验筛选靶点、设计反义核酸有辅助价值，MAST方法能筛选各种长度基因mRNA的全部可及位点和准确给定核苷酸的起止位置以供设计反义核酸，具有简单快捷的优点，将能为反义核酸设计起重要作用。

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