首页 期刊 生物信息学杂志 2017年第01期
生物信息学

生物信息学杂志 统计源期刊

China Journal of Bioinformatics

杂志简介：《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准，自2003年创刊，国内刊号为23-1513/Q，是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊，致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：综述、研究论文

主管单位：中华人民共和国工业和信息化部
主办单位：哈尔滨工业大学
国际刊号：1672-5565
国内刊号：23-1513/Q
全年订价：¥ 177.60
创刊时间：2003
所属类别：生物类
发行周期：季刊
发行地区：黑龙江
出版语言：中文
预计审稿时间：1个月内
综合影响因子：0.81
复合影响因子：0.94
总发文量：582
总被引量：2019
H指数：17
期刊他引率：0.9556
平均引文率：11.35
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分期目录

  • 基于物化性质对嗜热蛋白的预测

    作者：刀福英; 陈欣欣; 林昊 刊期：2017年第01期

    嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助。目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋白质的热稳定性相关。本研究筛选出可靠的数据集,包括915个嗜热蛋白和793个非嗜热蛋白。利用蛋白质氨基酸的物化性质和氨基酸的组成表征嗜热蛋...

  • 靶向番茄SlACS2基因CRISPR-Cas9sgRNA的设计和分析

    作者：白云凤; 张爱萍; 闫建俊; 贺飞燕; 张维锋; 冯瑞云; 刘江娜; 张西英 刊期：2017年第01期

    番茄为呼吸跃变型果实,伴随呼吸跃变产生大量乙烯,即系统II乙烯,易使番茄果实过熟,导致腐烂变质。SlACS2是番茄系统II乙烯合成的限速酶,通过CRISPR-Cas9基因组编辑系统修饰该基因,调控系统II乙烯过量表达,将迟滞番茄过熟。本研究基于RNA-seq建立了SlACS2基因的数字表达谱,表明该基因呈果实特异性表达,在植株的根、茎、叶等部位不表达。SlACS2位...

  • 重组琼胶酶rAgaN3基因的生物信息学分析

    作者：谢勇; 洪晓昆; 鄢仁祥; 林娟 刊期：2017年第01期

    利用生物信息学软件和数据库对从Microbulbifer sp.BN中得到的琼胶酶rAgaN3全长基因进行预测分析,结果表明：重组琼胶酶rAgaN3理论分子量为31.243 kDa,理论等电为4.81,不稳定系数为26.23,脂肪系数为62.35,平均疏水性系数为-0.662,无跨膜结构域,无信号肽;二级结构表明该蛋白无螺旋结构,有15个折叠结构,其余均为卷曲结构;序列相似性分析表明,蛋白r...

  • 长野芽孢杆菌普鲁兰酶的同源建模及三维结构分析

    作者：韦旭钦; 李晓明; 廖东庆; 黄日波 刊期：2017年第01期

    普鲁兰酶（Pullulanase）是脱支酶,因其能水解葡聚糖的α-1,6-糖苷键而有不同的工业应用潜力。本研究通过同源建模和分子对接的方法对长野芽孢杆菌（Bacillus naganoensis）普鲁兰酶进行建模及其三维结构分析,表明该普鲁兰酶由CBM41-X45a-X25-X45b-CBM48-GH13_14多结构域组成,并在酶蛋白中心形成其催化区,催化区的Asp619、Glu648和Asp733三个残基...

  • 基于微量DNA样本的简化甲基化文库构建方法研究

    作者：魏冬凯; 南蓬; 徐康萍; 裘锋 刊期：2017年第01期

    RRBS（简化甲基化测序）是一种有效研究DNA甲基化状态的测序方案。文库构建是该方案中最关键的实验步骤之一,RRBS文库构建往往因为酶切产物少,文库构建步骤繁多等因素,导致DNA起始量需要1 ug以上。然而很多来源于人的样本,如冰冻组织穿刺、石蜡切片、显微微切割等,都往往只能获得100 ng以下的DNA,无法满足常规RRBS文库构建的起始DNA总量要求,从...

  • 基于组合药物网络的疾病关联性分析

    作者：赵媛媛; 王耘 刊期：2017年第01期

    组合药物在复杂疾病的治疗中形成了多靶点,多环节上的密切联系,对疾病的治疗效果也可达到单种药物治疗意想不到的效果。组合药物中各单药功能各异但联用后治疗效果更佳,说明所对应疾病之间可能存在某种关系。通过研究疾病间关联关系,可能会发现治疗某种疾病的新靶标,从而在新药的研发中取得新的进展。本文以DCDB（组合药物数据库）中的药物组合...

  • 一种新的RNA二级结构三维图形表示及其应用

    作者：刘立伟; 刘铁晖 刊期：2017年第01期

    本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式。根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似性的比较和分析。根据最终结果,可以很清晰地发现,AVII与LRMV两种病毒是最为相似的,另外,较大的距离值出现在了APMV与ALMV;PDV与AVII中,这说明这几种RNA二...

  • 血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系

    作者：齐燕姣; 陆会宁; 金能智 刊期：2017年第01期

    莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明莪术醇与人血清白蛋白相互作用的结合位点II和III处周围几...

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