首页 期刊 生物信息学杂志 2016年第03期
生物信息学

生物信息学杂志 统计源期刊

China Journal of Bioinformatics

杂志简介：《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准，自2003年创刊，国内刊号为23-1513/Q，是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊，致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：综述、研究论文

主管单位：中华人民共和国工业和信息化部
主办单位：哈尔滨工业大学
国际刊号：1672-5565
国内刊号：23-1513/Q
全年订价：¥ 177.60
创刊时间：2003
所属类别：生物类
发行周期：季刊
发行地区：黑龙江
出版语言：中文
预计审稿时间：1个月内
综合影响因子：0.81
复合影响因子：0.94
总发文量：582
总被引量：2019
H指数：17
期刊他引率：0.9556
平均引文率：11.35
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分期目录

  • 牦牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶（GGPS）的生物信息学分析

    作者：张鹏飞; 王宁; 周蔓; 李萍 刊期：2016年第03期

    GGPS是萜类化合物合成的一个重要分支点酶,同时也是合成GGPP的催化酶。本课题共选择了9个不同科的植物,对其GGPS核苷酸及氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构功能以及亲缘进化关系等进行详细的分析。结果表明,九个科植物GGPS核苷酸序列长度均大于1 000 bp小于2 000 bp;GGPS氨基酸都不含有信号肽,不存在跨膜结构域;GGPS蛋白的二级结构中α螺旋和无规...

  • 基于不同物种的热休克蛋白90的生物信息学分析

    作者：叶静; 陈伟; 金殿川 刊期：2016年第03期

    热休克蛋白90（Heat shock protein 90,Hsp90）是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。Hsp90包含Hsp90A,Hsp90B,Hsp90C,TRAP和Htp G5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况,验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律,即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种...

  • DnaK蛋白扭链残基突变体影响其ATPase活性的分子动力学模拟研究

    作者：张桥石; 李灌澍; 窦薛楷; 薛友林; 宋有涛 刊期：2016年第03期

    大肠杆菌分子伴侣蛋白Dna K氮端核苷酸结合域（NBD,nucleotide-binding domain）的II-A和II-B子域之间的一些高度保守的扭链残基突变后（I202A,S203A,G223A,L227A,G228A）,其ATPase活性也发生变化原因不清楚。我们通过同源建模的方法构建NBD与小分子ATP相互作用的各蛋白模型,使用分子动力学模拟方法研各模型的结构变化并尝试找出其与ATPase活性...

  • 茉莉酸信号受体COI蛋白家族的分子进化与基因表达分析

    作者：段龙飞; 李文燕; 慕小倩; 张园园; 郭邦利; 陈国爱 刊期：2016年第03期

    茉莉酸（Jasmonic acid,JA）存在于所有高等植物中,是植物对病原微生物和虫害防御反应的关键激素。在茉莉酸信号转导中,COI1（COR-insensitive 1）作为茉莉酸信号受体蛋白在其中发挥关键作用。本研究采用生物信息学方法,从藻类、苔藓类、蕨类、裸子及单、双子叶植物多谱系对COI蛋白家族进行比较基因组学研究,并取得以下结果：（1）同源基因鉴定...

  • 基于PBL结合多媒体教学模式在生物技术教学上的应用

    作者：丁忠庆; 卢卫红; 井晶; 姜华; 张兰威; 王振宇 刊期：2016年第03期

    为提升学生学习兴趣,培养学生自主学习的能力是当前教育关注的首要问题。本文针对在生物技术课堂上遇到的实际问题,提出建立多媒体资料库,引导学生自己提出问题并加以解决,拓展学生思路,提高了教学效果,学生反响良好。

  • 整合转录组学数据的代谢网络研究进展

    作者：汪慧; 丁德武; 孙啸; 谢建明 刊期：2016年第03期

    高通量测序技术的快速发展催生了涵盖各层次细胞生命活动的组学数据,如转录组学数据、蛋白质组学数据和互作组学数据等。同时,全基因组代谢网络模型在不断完善和增多。整合组学数据,对生物细胞的代谢网络进行更深入的模拟分析成为目前微生物系统生物学研究的热点。目前整合转录组学数据进行全基因组代谢网络分析的方法主要以流量平衡分析（FBA）...

  • NgAgo-gDNA基因组编辑系统的成功及启示

    作者：孙瑜; 蔡小宁; 陈德富; 高山 刊期：2016年第03期

    韩春雨等发明的DNA指导的基因组编辑系统NgAgo-gDNA，比原有的RNA指导的基因组编辑系统CRISPR—Cas9在靶向特异性（防脱靶），反应可控性和基因组编辑范围等方面都有显著的改进。NgAgo—gDNA不是一项简单的改进，是一项具有开拓性的工作，沿着这条研究路线，可以继续开发出更先进的基因组编辑系统。该研究充分体现了生物信息学，特别是大数据挖...

  • 动态规划算法对GenoCAD设计结果的优化

    作者：方刚 刊期：2016年第03期

    Geno CAD（www.genocad.com）是一种基于Web的免费合成生物学设计软件,用它可以进行表达载体及人工基因网络设计。持续点击代表各种合成生物学标准＂零件＂的图标,以一种语法进行设计,最后就可以得到由数十个功能片段组成的复杂质粒载体。但是在GenoCAD中,每一类的合成生物学标准＂零件＂数量众多。随着这些标准＂零件＂的不断开发,其数量也在进...

  • 蛋白质二级结构指定

    作者：曹晨; 马堃 刊期：2016年第03期

    蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠机制有着重要的作用。并且蛋白质二级结构信息广泛应用到蛋白质分子可视化、蛋白质比对以及蛋白质结构预测中。目前有超过20种蛋白质二级结...

  • 一站式全基因组和外显子组测序数据自动分析软件（SeqMule）

    作者：李鑫; 李凯; 李一佳; 马磊 刊期：2016年第03期

    SeqMule可根据调用的人类基因组和外显子组数据自动调节变量,对所有测序数据的单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）进行分析和注释。目的：通过对两名痛风患者的实验数据进行分析,详细地为生物信息学研究人员介绍了SeqMule软件,以期为全基因组和外显子组测序数据提供一站式的分析途径。方法：基于SeqMule内置的BWA（BurrowsWh...

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