生物信息学杂志 统计源期刊
China Journal of Bioinformatics
杂志简介：《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准，自2003年创刊，国内刊号为23-1513/Q，是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊，致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：综述、研究论文
杂志简介：《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准，自2003年创刊，国内刊号为23-1513/Q，是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊，致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目：综述、研究论文
作者：任鄄胜 肖培村 陈勇 吕启明 王玉平 赵慧霞 李仕贵 刊期：2010年第02期
利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因组数据库（TIGR Rice Genome Annotation - Release 5）中识别出565个编码抗病蛋白质的同源序列;利用识别出565个编码抗病蛋白质序列分别与籼稻基因组数据库进行BLASTP联配,共确定320个对应的等位基因.通过在线生物信息学软件,识别了这565个抗病基因的保守结构域、保守模体和DNA序列内转座子元件,其中有...
作者：申伟科 钟理 葛昆 张波 王建飞 张小刚 秦向东 刊期：2010年第02期
鉴定癌症表达谱的特征基因集合可以促进癌症类型分类的研究,这也可能使病人获得更好的临床诊断？虽然一些方法在基因表达谱分析上取得了成功,但是用基因表达谱数据进行癌症分类研究依然是一个巨大的挑战,其主要原因在于缺少通用而可靠的基因重要性评估方法.GA/WV是一种新的用复杂的生物表达数据评估基因分类重要性的方法,通过联合遗传算法（GA）...
作者：欧阳玉梅 刊期：2010年第02期
随着DNA芯片技术的广泛应用，基因表达数据分析已成为生命科学的研究热点之一。概述基因表达聚类技术类型、算法分类与特点、结果可视化与注释；阐述一些流行的和新型的算法；介绍17个最新相关软件包和在线web服务工具；并说明软件工具的研究趋向。
作者：张景祥 徐振源 赵晓兵 刊期：2010年第02期
根据DNA序列的＇终止密码子＇及其＇逆补终止密码子＇的分布情况,给出一种新的DNA序列向量的构建方法,运用Shannon熵相关理论,对Jensen-Shannon离散量和KL离散量进行了修正和比较.试验表明,该方法在预测DNA序列的基因编码与非编码区边界的效率上是86%显著高于Bernaola等人提出的70%.
作者：唐静仪 樊晓霞 杨中奇 宋晓婕 王万军 刊期：2010年第02期
用生物信息学方法对拟南芥叶状子叶（LEC）基因的核苷酸序列以及推导氨基酸序列的组成、功能结构域、亲水性等进行了分析.结果表明,拟南芥的LEC 蛋白为位于细胞核中的亲水性不稳定蛋白;通过对LEC蛋白的功能结构域的分析发现,LEC1和L1L蛋白中高度保守的区域即为CBF-NFYB-HMF结构域,LEC2和FUSCA3 蛋白中高度保守的区域为B3结构域.
作者：郭源远 尹京苑 刊期：2010年第02期
采用HMMER与BLAST相结合的方法确定拟南芥，水稻和杨树三种模式植物全基因组JMJC蛋白基因个数分别为21，20，24，并对其染色体定位，基因结构，保守功能域进行了系统分析，在系统进化分析基础上，将JMJC家族分为11个亚家族，内含子外显子结构分析与MPSS表达模式分析结果也进一步支持了进化关系研究．本研究有助于揭示植物JMJC基因家族的进化历史...
作者：盛嘉 郑思远 郝沛 刊期：2010年第02期
药物靶标发现是目前生物学研究领域的热点和难点问题。从已有药物靶标中寻找规律可以为新靶标的发现总结规律，提供依据。随着功能基因组学的发展，这种组学数据的积累为这一问题的研究提供了契机。本文研究了已有靶标在蛋白网络中的分布，并分析了它们的蛋白功能域组成情况。结果显示靶标基因倾向位于网络的核心区域，并且集中在一些特定蛋白家...
作者：田瑞琴 张静 胡俊 刊期：2010年第02期
真核基因的转录调控是后基因组时代研究的主要问题之一，其基础是认识DNA上转录因子结合位点（模体）及分布状况。基于马尔可夫链模型对酵母核糖体蛋白基因上游启动子序列中模体出现次数进行统计，利用z—score统计量抽提出过表达和低表达的模体，其中95％的模体与实验得到的转录因子结合位点相符合。然后将抽提出的模体两两配对，通过与背景序...
作者：申志勇 屈武斌 李稚锋 杭兴宜 张成岗 刊期：2010年第02期
聚合酶链式反应（PCR）虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此.为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用户频繁使用Blast比对检查非特异性,我们开发了基于NCBI-Blast的引物评估和模板DNA特异性结合能力评估的核查系统PSC（Primer Specificity Checking,http：//...
作者：周贵良 洪来法 梁敏玲 郑柳城 陈转贤 刊期：2010年第02期
利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Green I Real Time PCR引物,同时选取5 000条基因进行SYBR Green I Real Time PCR引物验证,95.92%的基因引物取...
作者：周祎 陈洪俊 李明福 易丽萍 刘选明 谭钟扬 刊期：2010年第02期
现有92株芜菁花叶病毒（TuMV）的全基因组序列已在GenBank报道,据分析报道其中58株不含重组序列.利用系统聚类法对92株TuMV的全基因组序列和58株TuMV全基因组序列的相对密码子频率RSCU值进行聚类分析.同时利用系统发育分析方法分析了这92株和58株TuMV全基因组序列.结果发现,92株芜菁花叶病毒株的密码子偏性聚类树与其系统进化树的一致度很低;而...
作者：黄晓韵 曹波 杨跃 刊期：2010年第02期
利用SAS软件对GEO的一个肺癌芯片实验进行挖掘.采用非参数检验,判别分析和回归分析对该芯片实验中14个核受体的表达信息进行分析.结果表明,在0.05显著性水平下,ER1、VDR、 RARα和 RORα四个基因在腺癌和鳞癌表达具有统计学差异;RARβ在复发组和非复发组表达有差异.判别分析结果显示VDR和RORα表达量可以对病理类型进行预测,但是总误判率很高（0.238...
作者：梁群 王琪 张秀清 汪建 刊期：2010年第02期
单碱基突变的筛选和分类是SNP分析的基础。为解决手工进行突变位点挖掘工作的困难，编写了VemusSNP软件。它可以解析并过滤序列比对结果，并根据突变类型将位点加以分类，以图形界面呈现给用户。使用VemusSNP，用户可以直观地了解基因组中单碱基突变的情况。其程序及源代码可以从http：／／sourceforge．net／projects／versussnp下载。
作者：李彬彬 黄培春 钟复光 刊期：2010年第02期
对线粒体DNA（mtDNA）序列进行多态性分析，将有利于从母系遗传的角度研究各人群的源流、迁移以及亲缘关系等情况。探讨利用Intemet共享生物学软件对各种生物样本mtDNA高变区进行序列比对分析及多态性分析，结果显示DNAstar、ClustalX、DnaSP以及Mega等软件操作简便、易于判读、结果准确可靠，可广泛应用于人类学、系统发育学以及法医鉴定等领域...
作者：高洁 蒋丽丽 徐振源 刊期：2010年第02期
利用DNA序列的混沌游戏表示（chaos game representation,CGR）,提出了将2维DNA图谱转化成相应的类谱格式的方法. 该方法不仅提供了一个较好的视觉表示,而且可将DNA序列转化成一个时间序列.利用CGR坐标将DNA序列转化成CGR弧度序列,并引入长记忆ARFIMA（p,d,q）模型去拟合此类序列,发现此类序列中有显著的长相关性且拟合度很好.
影响因子：0.48
期刊级别：北大期刊
发行周期：旬刊
影响因子：0.76
期刊级别：统计源期刊
发行周期：旬刊
影响因子：1.16
期刊级别：统计源期刊
发行周期：月刊
影响因子：0.5
期刊级别：部级期刊
发行周期：月刊
影响因子：0.88
期刊级别：北大期刊
发行周期：月刊
影响因子：0.69
期刊级别：北大期刊
发行周期：双月刊
影响因子：--
期刊级别：部级期刊
发行周期：月刊
影响因子：0.55
期刊级别：北大期刊
发行周期：月刊
影响因子：0.98
期刊级别：北大期刊
发行周期：月刊
影响因子：1.12
期刊级别：北大期刊
发行周期：双月刊
影响因子：0.79
期刊级别：北大期刊
发行周期：月刊
影响因子：1.09
期刊级别：统计源期刊
发行周期：双月刊