杂志简介:《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准,自2003年创刊,国内刊号为23-1513/Q,是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊,致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目:综述、研究论文
作者:孙彤; 闫莉婕; 黄勤妮; 印莉萍 刊期:2004年第03期
水稻不仅是非常重要的粮食作物,也是用于研究的模式植物之一. 由于水稻基因组测序的完成,用功能基因组学的现代方法来研究缺铁相关基因的表达调控是最高效的方法之一. 在前期工作的基础上,精心设计了缺铁和EDTA鳌合二价铁诱导5天的水稻根实验,并进行了转录水平的微点阵(microarray)分析.但只获得了第5天的结果. 在10531个水稻cDNA芯片图谱中,缺...
作者:张艳萍; 靳飞; 柴小青; 卫功宏; 印莉萍 刊期:2004年第03期
水稻幼苗经缺铁胁迫诱导分别处理1、3、5天后,用酚法和TCA/丙酮法提取叶片中的可溶性蛋白进行双向电泳分析,从而研究在缺铁条件下叶片中蛋白表达的动态变化规律.结果显示:1.不同pH IPG胶条分离蛋白的效果不同.用pH3-10的IPG胶条进行双向电泳,经考马斯亮蓝染色后,可在胶面上检测到大约450个蛋白点,其中约有89%的蛋白是酸性蛋白.如果用pH4-7的IPG...
作者:徐建震; 郭政; 李霞; 屠康; 王辰光 刊期:2004年第03期
为了比较特定的基因芯片的功能偏岐,我们研制开发了一个简单实用的基因芯片功能评价与辅助设计软件GeneHubD.通过结合GO、KEGG、BIND、MIPS、Unists数据库的基因功能注释信息,该软件有助于实验人员选择或设计合适的芯片开展芯片实验.
作者:马相如; 陈焕春 刊期:2004年第03期
ACEDB作为一个优秀的基因组数据库管理系统,已被用作包括从细菌、真菌、寄生虫、植物、昆虫、动物到人类等许多生物的基因组数据库.ACEDB基因组数据库管理系统在许多生物类数据库中都得到应用
作者:吕飒丽; 汪强虎; 李霞; 郭政 刊期:2004年第03期
应用DNA芯片可获得成千上万个基因的表达谱数据.寻找对疾病有鉴别力的特征基因,滤掉与疾病无关的基因是基因表达谱数据分析的的关键问题.利用决策森林方法的集成优势,提出基于决策森林的两种特征基因识别方法.该方法先由决策森林按照一定的显著性水平滤掉大部分与疾病类别无关的基因,然后采用统计频数法和扰动法,根据所选特征对分类的贡献程度对...
作者:张智俊; 李亚玲; 田兴军 刊期:2004年第03期
利用Genbank中已知SARS-Cov完整基因组信息,通过Beacon Designer 2.1软件进行其分子信标探针设计,共找出7条分子信标探针和相对应的引物,它们均分布在SARS-Cov基因组的保守区域,后经过软件评估和Blast搜索,证明所获得的7条分子信标探针为SARS-Cov的特异性探针.这将为今后SARS-Cov的快速诊断提供线索和参考
作者:倪青山; 王正志; 李冬冬 刊期:2004年第03期
掩模板在高密度基因芯片的探针合成过程中起着重要的作用,由于其制造工艺复杂、造价较高,因此在不改变探针合成结果的条件下,需要尽可能的减少基因芯片探针合成过程中所用的掩模板数量.提出了一种新的预测搜索算法,对掩模板进行了优化设计,对设计结果的测试显示,其减少的掩模板数量超过了传统方法的20%,表明了该算法的有效性.
作者:李华; 张治洲 刊期:2004年第03期
大范围基因表达调控的机制研究是目前功能基因组学研究的一个重要课题,所以也是功能生物信息学研究的热点.基因表达的两个方面即激活(activation)和抑制(repression)是同等重要的,但是长期以来在基因激活方面积累的知识远比抑制要多.越来越多的理和实验研究表明,激活和抑制应该是同一问题的相互依存的两个方面.基因抑制从形式上可以分成主动抑制...
作者:徐琪; 成荣; 谢芳; 刘博; 陈国宏 刊期:2004年第03期
近年来随着现代分子生物学的发展,一些高效的分子遗传标记将各种畜禽的遗传图谱研究推向深入.为高密度、覆盖面广的连锁图谱的构建及QTL的定位奠定了基础.有关QTL的基本理论、QTL定位的步骤、QTL的检测方法以及家禽中定位的QTL已经展开了深入的研究,但目前QTL定位中存在诸多问题的问题.
作者:胡永钢; 须文波 刊期:2004年第03期
借助各种应用数学和计算机技术,将大量积累并急需处理的生物信息数据利用起来,探索生物信息中的规律,是当前国内国际生物信息学研究的热点和重点.其中数据挖掘技术在生物信息研究中发挥着巨大的作用.
作者:张华; 王静 刊期:2004年第03期
生物芯片检测技术是一种全新的微量分析技术.生物芯片基本技术包括方阵构建、样品制备、化学反应和结果检测;生物芯片技术在食品微生物领域、食品毒理学、营养学、转基因产品检测中均有应用.