生物信息学

生物信息学杂志 统计源期刊

China Journal of Bioinformatics

杂志简介:《生物信息学》杂志经新闻出版总署批准,自2003年创刊,国内刊号为23-1513/Q,是一本综合性较强的生物期刊。该刊是一份季刊,致力于发表生物领域的高质量原创研究成果、综述及快报。主要栏目:综述、研究论文

主管单位:中华人民共和国工业和信息化部
主办单位:哈尔滨工业大学
国际刊号:1672-5565
国内刊号:23-1513/Q
全年订价:¥ 177.60
创刊时间:2003
所属类别:生物类
发行周期:季刊
发行地区:黑龙江
出版语言:中文
预计审稿时间:1个月内
综合影响因子:0.81
复合影响因子:0.94
总发文量:582
总被引量:2019
H指数:17
期刊他引率:0.9556
平均引文率:11.35
  • 循环肿瘤细胞识别技术研究现状

    作者:王燕; 徐秀林 刊期:2018年第03期

    循环肿瘤细胞(CTCs)对恶性肿瘤传播转移有重要影响,因此CTCs识别技术的出现与不断进步有着重要的临床意义,准确可靠的CTCs识别技术将为尽早确诊肿瘤、指导个性化治疗方案、诊断微小残留病变以及评估抗癌药物的敏感性提供强有力的工具。本文针对核酸检测法、免疫细胞化学术、流式细胞术和基于表征特性图像识别技术等CTC识别技术的发展情况进...

  • 基因置换发展研究综述

    作者:杨静芬; 乔战龙; 魏志伟; 刘涛 刊期:2018年第03期

    基因置换,又称基因替代作用,它指的是遗传信息单向的从一个序列向其同源序列传递的过程。近年来,人们对遗传重组的发生机制、功能及影响有了新的认识,尤其是发现“重组”造成的基因置换远超过以前认识。与遗传重组不同,基因置换有可能改变等位基因频率,搅乱等位基因的组合,降低连锁不平衡的程度,影响核苷酸多样性的即时效应和长期的效应...

  • 寿命调控同源蛋白Sch9与S6K1的结构与功能分析

    作者:刘雪飞; 范磊; 王楠; 黄新河 刊期:2018年第03期

    芽殖酵母Sch9与哺乳动物S6K1是保守的寿命调控同源蛋白,利用生物信息学手段比较分析了Sch9与S6K1的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区、空间结构、蛋白质相互作用网络、序列同源性及进化关系,以期对Sch9与S6K1的结构功能的深入研究提供线索和基础。结果表明Sch9为酸性稳定性亲水蛋白,而S6K1为酸性不稳定的亲水蛋白,均无信号肽和跨膜区域...

  • 琥珀酸对酵母细胞转录组的影响

    作者:THEKRA; Khushafa; 童侨; 范磊; 刘雪飞; 黄新河 刊期:2018年第03期

    寻找抗衰老活性小分子并研究其作用机制是衰老药物学研究的重点和热点。本文报道了一种新的抗衰老活性小分子琥珀酸,发现琥珀酸可以显著延缓芽殖酵母细胞的衰老并增强细胞的压力抗性。随后,利用DNA Microarray技术及生物信息学手段较系统分析了琥珀酸处理对基因表达谱、基因本体聚类及相关信号通路的影响。结果显示,琥珀酸处理对细胞转录组产...

  • 基于近邻成分分析算法的原发性肝癌精确放疗后HBV再激活分类预测

    作者:赵咏旺; 刘毅慧; 黄伟 刊期:2018年第03期

    原发性肝癌(PLC)患者在精确放疗后乙型肝炎病毒(HBV)再激活是一种常见并发症,及时的预测防护能降低发病率、死亡率。研究表明:多余的特征变量会影响HBV再激活的预测精度。通过提出基于近邻成分分析(NCA)的特征选择方法找出HBV再激活的危险因素及特征组合。之后分别建立经Bayes优化前后的支持向量机模型(SVM)对这些关键特征子集及初始...

  • 基于Perl脚本在NCBI网站自动或批量获取物种信息

    作者:李元; 丰磊; 吴玲惠; 舒青龙 刊期:2018年第03期

    根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动或批量获取物种信息。通过解析NCBI在线BLAST结果及其网页源程序特点,利用Perl语言编写自动化脚本,以达...

  • Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本

    作者:李旭凯; 王钇杰; 王俊杰 刊期:2018年第03期

    如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析...

  • 基于全外显子组数据的ABO血型的基因判定

    作者:雷建强; 张民霞; 唐元华 刊期:2018年第03期

    全外显子组测序研究已经应用在疾病、药物等方面,是临床研究中一种辅助分子诊断方法。该方法也逐步应用在临床ABO血型的判定中,由于目前临床血型判定的主要方法是血清学,疑难样本判定等问题无法解决,因此分子水平的基因测序方法提高了血型判定的准确性,比如PCR方法和基因芯片方法。为进一步提高ABO血型精细分型的准确性,通过分析全外显子...

  • 磁珠法快速提取基因组DNA的实验研究

    作者:许朋; 郑春辉; 孙智勇; 余兰; 冯昆 刊期:2018年第03期

    针对临床标本基因组DNA的提取方法缺乏广泛适用性,提取步骤繁琐,需要进行离心操作,并且提取过程中会用到苯酚、氯仿等有机试剂,会对操作人员有一定的危害性等不足,本研究拟建立一种适用于临床标本的基因组DNA快速提取方法。在传统的基因组DNA提取试剂和方法的基础上,本研究采用二氧化硅修饰的超顺磁珠设计了一种基因组DNA快速提取方法;探...

  • FOXD3的空间结构和理化性质分析

    作者:刘畅; 刘安 刊期:2018年第03期

    FOXD3(Forkhead box D3)作为一个有价值的肿瘤预后标志物,其抑癌机制和预后价值仍未被完全阐明。为了全面认识FOXD3,本研究利用生物信息学手段,对FOXD3蛋白的氨基酸序列同源性、理化性质、组织表达、亚细胞定位、空间结构及蛋白质相互作用网络进行了预测和分析。结果表明:人FOXD3蛋白是酸性不稳定的亲水蛋白,在进化过程中高度保守,无信...