作者:吕成龙; 田雨; 陈芳慧; 刘小军; 李丽丽; 吕林雪; 葛继文; 顾晨浩; 邹彦; 王根林; 蔡亚非 期刊:《南京农业大学学报》 2020年第02期
[目的]本研究以16S rRNA为分子标记,采用高通量测序技术分析探讨3种水平体细胞鲜奶样品中细菌种类、菌群多样性和菌群结构。[方法]选取江苏某牧场45头奶牛鲜奶样品,分为健康、亚临床乳腺炎型和临床乳腺炎型3组,并对临床型奶样进行细菌培养鉴定,同时分别提取各组鲜奶样品中细菌总DNA,根据16S rRNA V4—V5区设计引物进行扩增测序,利用生物信息学软件对测序结果进行分析。[结果]对体细胞数>1×106 mL-1的奶样进行细菌培养,鉴定出奶牛乳...
本试验以猕猴粪便为主要试验材料,为了解圈养条件下的猕猴粪便携带的细菌情况,对某动物园中的猕猴粪便细菌进行分离培养、16SrRNA基因PCR扩增和序列分析,结果显示,从粪便中分离并鉴定出5属共9种细菌:希氏肠球菌、索氏志贺菌、弗氏大肠杆菌、大肠埃希菌、痢疾杆菌、屎肠球菌、莫海威芽孢杆菌、胼胝体棒状杆菌、谷氨酸棒状杆菌。
作者:李盈; 周莹; 谭玉洁; 张坤杰; 刘儒圣; 姜红霞 期刊:《泰山医学院学报》 2019年第11期
目的从葡萄酒酿酒皮渣中分离筛选高效产酸醋酸菌并进行菌种鉴定,优化发酵条件。方法利用富集培养法,根据含碳酸钙平板透明圈大小分离筛选产酸效能优良的菌种,利用16SrRNA进行菌种分子鉴定。利用酸碱滴定法测定产酸量,分析醋酸菌的产酸能力。研究乙醇浓度、接种量、温度等单因素对优良醋酸菌发酵产酸的影响。结果共筛选到31株产酸菌,经16SrRNA分子鉴定确认其中的4株菌均属于苹果醋酸菌(Acetobacter malorum);菌株11的发酵性能最佳。...
作者:李明华; 刘冬梅; 刘进辉 期刊:《系统医学》 2018年第02期
目的探讨烧伤脓毒血症患者外周血清白细胞中微小RNA(16SrRNA)表达水平在脓毒血症患者中的意义以及与机体免疫调控之间的关系。方法选取2015年1月—2016年12月该院收治的50例烧伤脓毒血症患者作为观察组,选取同期健康体检人群25名作为对照组,比较两组16SrRNA、WBC、TNF-ɑ以及IL-10水平,分析烧伤脓毒血症患者的16SrRNA与WBC、TNF-ɑ以、IL-10以及SOFA评分的关系。测定不同病情严重度患者外周血Treg系列的表达以及16SrRNA表达,比较死...
作者:胡安东; 张明洋; 张安青; 程振涛; 周碧君; 姜海波; 文明 期刊:《畜牧与兽医》 2019年第07期
从患病鲟体内分离到1株细菌,通过形态学观察、生理生化特性鉴定、16SrRNA基因序列分析及系统进化树构建等方法对分离菌种属进行确定,采用纸片扩散法对分离菌进行药物敏感性分析。结果显示:分离菌为革兰阴性杆菌;可分解葡萄糖和木糖,氧化酶和鸟氨酸脱羧酶试验阳性;16SrRNA基因测序分析与荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)同源性大于99%,在系统发育树上与荧光假单胞菌聚为一枝;药敏结果显示,分离菌对氧氟沙星、多西环素、复方新...
作者:黄安妮; 闫鹤 期刊:《中国兽医》 2019年第02期
作者:张勤勤; 龚华; 吴高雄 期刊:《中国妇幼保健》 2010年第31期
目的:应用聚合酶链反应(PCR)检测细菌16SrRNA基因,研究其在新生儿败血症中的应用。方法:抽取临床疑为细菌感染的265例新生儿的静脉血,分别做血培养和细菌16SrRNA的基因检测。于血标本中抽提DNA后用聚合酶链反应(PCR)扩增,将扩增产物电泳后经凝胶成像系统扫描。结果:PCR检测阳性率为6.4%(17/265),明显高于血培养的阳性率〔3.4%(9/265)〕,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论:与血培养相比,检测细菌16SrRNA基因对新生儿败...
作者:高敬华; 李楠; 郭士杰; 姜学霞 期刊:《科技创新导报》 2019年第16期
本文主要是研究了富湾银矿微生物的多样性,通过采集富湾银矿土壤样品,利用16SrRNA基因序列分析细菌基因文库,通过系统进化分析确定了该矿区的微生物群落组成。结果表明,富湾银矿土壤的主要微生物群落包括变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和浮霉菌门(Planctomycetes)以及未分类的细菌类群,揭示了富湾银矿的土壤中存在着丰富的细菌,这为探讨微生物修复矿区土壤污染提供理论的基础。
作者:宋洁; 张小芳; 刁雪淘; 金梅 期刊:《安徽农学通报》 2008年第09期
动物线粒体DNA是共价闭合的环状双链DNA,在真核生物具有高保守性,使其成为了研究物种进化的一种常用的标记,并为线粒体起源提供了有价值的线索。通过动物线粒体DNA从分子水平上研究类群的系统关系,获得种群遗传多态性的资料及建立种群遗传标记,对类群系统关系研究有重要意义。
作者:李烛南; 卢怡竹; 王振国; 刘志杰; 殷宏; 曾巧英 期刊:《动物医学进展》 2018年第07期
马属动物是嗜吞噬细胞无浆体的重要天然宿主,旨在弄清新疆昭苏县马感染嗜吞噬细胞无浆体情况和病原特征。对采集的100份马血清进行间接免疫荧光(IFA)检测嗜吞噬细胞无浆体抗体,对阳性样品相对应的DNA样品通过PCR扩增、16SrRNA基因测序、序列比对、完成了分子分型分析。间接免疫荧光法(IFA)检出率为8%(8/100),通过对阳性样品的基因组进行16SrRNA扩增,序列分析进一步确定马存在嗜吞噬细胞无浆体感染情况。分子分型发现存在2种嗜吞噬...
作者:李莉; 朱永肖; 卢晓颖; 杨健; 赵贤亮; 孔祥会 期刊:《动物医学进展》 2019年第01期
从患病圆眼燕鱼( Platax orbicularis )体内分离到一批形态一致的优势菌株,通过细菌鉴定并检测其药物敏感性,以期为圆眼燕鱼的疾病防治提供参考。对分离菌株进行形态观察、生理生化试验以及16S rRNA基因序列分析,结果显示该菌株与弧菌表型特征一致,16S rRNA与GenBank中哈维弧菌( Vibrio harveyi )的同源性高达99%,在系统进化树中与哈维弧菌(KU245727)聚为一分支,结合该菌的生理生化特征和基因序列分析,鉴定该优势菌株为哈维弧菌。...
作者:袁瑞强; 牛漾聃; 王鹏; 王仕琴 期刊:《环境科学学报》 2019年第02期
人类活动可明显降低地表水体水环境质量,同时对水生态系统产生深刻的影响.本文基于16S rRNA高通量测序技术,研究了引黄调水对汾河受水河段沉积物微生物群落组成、结构和多样性的影响,探讨了引水对沉积物中微生物群落的影响机制.结果表明,黄河水的引入使汇入口处沉积物中微生物群落多样性水平升高,并带来新微生物物种硫杆菌属、厌氧绳菌属和亚硝化单胞菌属,新增菌种不仅在下游逐渐适应环境,而且通过上溯扩张使汇入口上游河段沉积物...
作者:付琳林; 李海星; 曹郁生 期刊:《生物技术通报》 2004年第02期
综述了不依赖于培养的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)分析微生物多样性的原理,并列举它的应用实例.DGGE和传统方法相比有很多优点,若将DGGE和其他方法结合起来,效果更好,应用更广泛.
作者:赵晴; 刘梦莹; 吕慧; 梁俊宇; 刁兴兴; 张鑫; 孟了 期刊:《环境科学》 2019年第09期
本研究从某垃圾填埋场计划将现有的垃圾渗滤液短程硝化反硝化脱氮工艺改造为短程硝化反硝化耦合厌氧氨氧化工艺的实际需求入手,以短程硝化反硝化污泥作为接种污泥,在上流式厌氧污泥床反应器(UASB)中完成厌氧氨氧化启动.探究反应器运行中的脱氮效能、氮容积负荷和氮去除负荷情况,并利用16SrRNA基因序列分析技术对长期运行条件下系统中微生物群落结构演替进行分析.结果表明,反应器经历了149d后成功启动厌氧氨氧化,稳定运行后的进水总...
作者:褚文珂; 陈敏; 谢蔚鹏; 黄媛 期刊:《科技通报》 2018年第07期
利用富集培养和平板分离的方法,从西溪湿地土壤中分离得到一株高效好氧反硝化细菌CD1。显微镜观察显示,CD1菌株为革兰氏阴性杆菌。进一步通过生理生化特性和16S rRNA基因序列分析,初步鉴定该菌株为假单胞菌属(Pseudomonas sp.)。脱氮特性研究结果表明,CD1菌株在培养22h进入生长稳定期;48h氮去除率为91.6%。
作者:卢婉婷; 黄玉秀; 何斐; 林征; 胡志坚 期刊:《中国微生态学》 2019年第03期
近年来,随着人口老龄化和生活方式的不断改变,妇科恶性肿瘤的发病呈现上升趋势,严重损害女性生命健康。目前关于妇科恶性肿瘤的病因、发病机制尚未完全阐明。除遗传因素外,环境因素在肿瘤的发生、发展中也扮演着重要的角色。女性生殖道的解剖特点使其处于开放性结构,易受各种病原体的入侵。高通量测序及序列识别技术的不断发展与成熟,使得微生物菌群与妇科恶性肿瘤的关系成为研究的热点,阐明微生物菌群对妇科恶性肿瘤的影响至关重...
作者:吕彩云; 王德青; 黄松; 桂荣银; 王伟; 董雪梅; 曹誉芬; 彭涛; 王康 期刊:《绵阳师范学院学报》 2019年第05期
为了解地方品种皖南花猪细菌感染情况,运用16SrRNA基因序列分析方法鉴定从皖南花猪地方品种猪分离的8种细菌.通过提取细菌DNA,采用通用引物PCR扩增16SrRNA基因片段并测序.将测序结果用BLAST在线软件在Nucleotide数据库中进行序列同源性比对,根据序列同源性鉴定病原细菌.结果表明:7种细菌鉴定到“种”,1种细菌鉴定到“属”.16SrRNA基因序列分析对于皖南花猪病原菌鉴定是一种有效的方法.
作者:王锦祥; 桑雷; 孙世坤; 陈冬金; 陈岩峰; 谢喜平 期刊:《中国养兔》 2019年第03期
为确定福州某兔场乳房炎和脚皮炎的病原,本试验从病死兔的乳房炎和脚皮炎病料中分离到一株革兰氏阳性菌FZYHSA001。根据分离菌的菌落形态、革兰氏染色特征和16SrRNA基因序列,确定为金黄色葡萄球菌。药敏试验结果显示,该菌对卡那霉素、环丙沙星、阿奇霉素和头孢曲松4种药物不敏感,对链霉素中度敏感,对青霉素、庆大霉素、恩诺沙星、头孢克肟、氟苯尼考、左氧氟沙星和头孢唑肟高度敏感。
作者:黄旭俊; 王鹏勇; 陈素娟; 成大荣; 张信军 期刊:《上海畜牧兽医通讯》 2018年第03期
从某湖羊养殖场发病死亡的成年湖羊的肾脏中分离到1株革兰阴性短杆菌,形态特征与生化试验结果基本符合肺炎克雷伯氏菌的特征.药物敏感性试验显示,该分离菌株对氨苄西林、哌拉西林、头孢唑啉、头孢哌酮、卡拉霉素、庆大霉素、诺氟沙星、氧氟沙星高敏,而对氟苯尼考、青霉素、苯唑西林、红霉素、四环素、多西环素、万古霉素、复方新诺明等药物具有耐药性.以细菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,将所测序列与GenBank中的序列进行BLAST...
作者:王宇慧; 李昕; 孙晓莉; 孟佳丽; 尚翠玲; 林静; 金天明 期刊:《天津农学院学报》 2018年第04期
以天津某大型猪场病死青年猪为研究对象,综合猪只脏器病变状况观察,以及形态学鉴定、培养基鉴定、生化鉴定和16SrRNA扩增PCR鉴定等4种方法,并通过动物致病性试验验证,结果显示,该发病猪为猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae,APP)感染。药敏试验结果显示,猪胸膜肺炎放线杆菌对头孢哌酮敏感;对氯霉素、阿莫西林、环丙沙星为中度敏感;对强力霉素、链霉素、卡那霉素、青霉素、四环素、氨苄青霉素、万古霉素、庆大霉素...