首页 期刊 计算机应用研究 基于分块存储格式的稀疏线性系统求解优化 【正文】

基于分块存储格式的稀疏线性系统求解优化

作者:程凯; 田瑾; 吴飞; 汪茹; 李洪芹 上海工程技术大学电子电气工程学院; 上海201620
gpu加速   共轭梯度   稳定双共轭梯度   重排序   hmec存储格式  

摘要:针对基于GPU求解大规模稀疏线性方程组进行了研究,提出一种稀疏矩阵的分块存储格式HMEC(hybrid multiple ELL and CSR)。通过重排序优化系数矩阵的存储结构,将系数矩阵以一定的比例分块存储,采用ELL与CSR存储格式相结合的方式以适应不同的分块特征,分别使用适用于不对称矩阵的不完全LU分解预处理BiCGStab法和对称正定矩阵的不完全Cholesky分解预处理共轭梯度法求解大规模稀疏线性系统。实验表明,应用HMEC格式存储稀疏矩阵并以调用GPU kernel的方式实现前述两种方法,与其他存储格式的实现方式作比较,最优可分别获得31.89%和17.50%的加速效果。

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