首页 期刊 中药新药与临床药理 基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析 【正文】

基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析

作者:王丽君; 李艳青; 谢舒平; 石雨荷; 朱敏; 童巧珍; 段礼新 湖南中医药大学; 湖南长沙410208; 广州中医药大学; 广东广州510006; 南京中医药大学; 江苏南京210000; 湖南省岳阳市中医院; 湖南岳阳414000
黑老虎   角鲨烯合酶   转录组测序   基因克隆  

摘要:目的研究黑老虎[Kadsura coccinea(Lem.)A. C. Smith]转录组特征,克隆三萜生物合成上游途径的关键酶基因角鲨烯合酶(KcSQS),为黑老虎资源利用奠定基础。方法对黑老虎不同部位进行转录组测序分析,根据筛选出的KcSQS候选基因序列设计引物,利用PCR技术进行基因克隆,并借助生物学软件进行生物信息学分析。结果克隆得到一个KcSQS基因,包含全长1 227 bp的开放阅读框(ORF),编码408个氨基酸,预测其蛋白分子量为46.65 kD,定位于细胞质膜,含一段跨膜超螺旋结构。该基因在黑老虎叶片中表达量最高,与同科植物厚朴(Magnolia officinalis Rehd. et Wils.)角鲨烯合酶(MoSQS)蛋白序列相似性为76.77%,预测为角鲨烯合酶。结论该研究对黑老虎植物根、茎和叶进行转录组测序,成功克隆了角鲨烯合酶基因,并对其进行生物信息学分析,可为进一步研究黑老虎三萜类化合物的生物合成提供依据。

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