首页 期刊 作物学报 基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜分枝角度QTL 【正文】

基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜分枝角度QTL

作者:汪文祥; 储文; 梅德圣; 成洪涛; 朱琳琳; 付丽; 胡琼; 刘佳 中国农业科学院油料作物研究所/农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室; 湖北武汉430062; 南漳县植保站; 湖北襄阳441500
甘蓝型油菜   分枝角度   60k   snp   芯片  

摘要:分枝角度是油菜株型的重要性状, 与油菜的耐密植性密切相关。本研究利用油菜分枝角差异显著的育种亲本材料1098B (分枝角小)和R2(分枝角大)杂交获得F1, 通过小孢子培养获得含163份株系的DH 群体。以油菜60KSNP 芯片进行DH群体基因分型, 构建高密度遗传图谱, 并利用QTL Cartographer 2.5对2个环境下油菜顶端分枝角和基部分枝角进行QTL分析。结果表明, 构建的高密度遗传图谱覆盖甘蓝型油菜19条染色体, 包含9521个多态性SNP标记, 1442 个簇(bin), 覆盖基因组长度为2544.07 cM, 相邻簇(bin)之间平均距离为1.76 cM。在此图谱基础上采用复合区间作图法(CIM), 在2个环境下检测到17个分枝角度QTL, 分别位于A01、A02、A03、A06、A09、CO2、C03、C04、C06 和C08 染色体上, 单个QTL解释的表型变异为6.39%~21.78%。用比较基因组方法与拟南芥分枝角度同源基因区间比对, 鉴定出其中6个QTL的12个候选基因。其中位于A03连锁群QTL在2年的试验中被重复检测到, 根据物理位置和基因组信息推测VAMP714为分枝角度的候选基因。这些QTL和候选基因将为油菜分枝角度的遗传改良提供有用的信息。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

学术咨询 免费咨询 杂志订阅