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基于文本挖掘的高通量癌症基因组数据注释

作者:刘燕; 孙月萍; 郭臻; 侯丽; 李姣 中国医学科学院医学信息研究所; 北京100020
癌症基因组   文本挖掘   命名实体识别   数据挖掘   可视化展示  

摘要:癌症基因组学科学计划的实施,推进了分子层面疾病诊断、疾病预防检测和靶向治疗等临床应用,积累了大规模的癌症基因组学数据,对癌症基因组数据进行有效挖掘和利用,成为该领域的研究重点。在高通量癌症基因组学数据挖掘的基础上,以美国国家癌症研究中心的癌症基因组数据为研究对象,利用文本挖掘技术对特异癌症基因加以注释和可视化展示,即从基因功能描述文本中识别疾病实体和药物实体,从临床应用的角度注释高通量数据挖掘结果,便于研究人员从高通量的数据和科学文献中发现疾病、药物及基因之间的关系。

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