摘要：目的 探讨基于真实单核苷酸多态性（SNPs）数据有效的计算机仿真方法,为探索SNPs与疾病的关联研究,基因-基因交互作用研究提供帮助.方法 利用gs2.0软件实现真实SNPs数据的仿真,利用Haploview、Plink、MDR软件对仿真效果进行评价.结果 利用gs2.0以中国傣族人群第22号染色体的500、1000、5000个SNPs位点为原始数据,分别生成了含有单致病位点和两交互作用致病位点的仿真数据.通过比较发现原始数据与其仿真数据的LD模式基本相似,有接近的r2值,单致病位点的差异显著性明显,两交互作用致病位点能被MDR识别.结论 gs2.0是一个简单高效的计算机仿真软件,能较好地仿真SNPs的LD模式并能准确设置单致病位点和两交互作用位点用以批量生成SNPs仿真数据.

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