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基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究

作者:左文明; 曾阳; 杨春芳; 李美雎; 李锦萍; 刘力宽 青海师范大学生命科学学院青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室; 青海西宁810008
蓼科   唐古特大黄   高通量   叶绿体   叶绿体全基因组  

摘要:目的获得野生唐古特大黄叶绿体全基因组信息特征,并对相关物种亲缘关系进行研究。方法本实验采用Illumina高通量测序技术构建了唐古特大黄叶绿体全基因组图谱。结果唐古特大黄基因组大小为161054 bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为86441 bp和12745 bp,反向互补重复区(IR)大小为30934 bp,共注释叶绿体基因132个,包括88个蛋白编码基因,36个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因,其中每个IR区19个。结论选取唐古特大黄在内的7个蓼科物种、4个其他科物种构建系统发育树,形态极其相似的唐古特大黄与掌叶大黄在分子上亲缘关系也最近,但rpl32等基因存在差异位点,对有效区分近缘物种提供新依据。

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