首页 期刊 中草药 基于ITS2序列的滨海白首乌及其近缘种DNA分子鉴定 【正文】

基于ITS2序列的滨海白首乌及其近缘种DNA分子鉴定

作者:刘琪; 谷巍; 杨兵; 祁乃喜; 王小浩 南京中医药大学药学院; 江苏南京210023; 江苏省中医院; 江苏南京210029; 滨海县卫生监督所; 江苏盐城224500
滨海白首乌   萝藦科   近缘种   its2   物种鉴定  

摘要:目的采用ITS2条形码鉴定滨海白首乌及其近缘种药用植物。方法采集滨海白首乌Cynanchum auriculatum及其近缘种植物样品共54份,分别提取基因组DNA,通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,测序结果提交至GenBank;从GenBank下载萝藦科植物16种47条序列,并通过ITS2数据库注释出ITS2序列;对提交与下载的101条序列,应用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间距离,采用相似性搜索法、最近距离法进行鉴定分析,并构建neighber-joining(NJ)系统进化树直观反映鉴定结果。结果滨海白首乌ITS2序列长度均为249 bp,是1个单倍型,与萝藦科鹅绒藤属植物距离较近,与萝藦科其他属近缘种之间遗传距离较远,NJ树结果显示滨海白首乌及其近缘种药用植物均可明显区分,表现出良好的单系性,依据ITS2二级结构,也可以直观地将滨海白首乌与萝藦科近缘种区分。结论 ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别滨海白首乌,为保障安全用药提供了新的技术手段。

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