摘要：为研究山桐子遗传多样性，对山桐子转录组数据进行分析，开发SSR分子标记技术. 将山桐子高通量转录组测序获得的84 213条Unigene进行简单重复序列（SSR）位点挖掘和分析，并结合引物验证，初步证明其可行性. 通过软件分析，共获得含SSR位点的序列数23 077，出现频率为27.40 %，涉及序列数量为29 953条，发生频率为35%. SSR序列中包括1 620种重复基元类型，其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸为优势重复类型，SSR位点数分别为9 782（32.67%）、6 921（23.11%）和5 420（18.10%）. 单核苷酸中A/T类型比例最高，为9 630（32.15%），二核苷酸和三核苷酸中以类型AG/CT（4 679；15.62%）和AAG/CCT（1 220；1.53%）为主. SSR位点重复次数差别较大，主要是3次（4 748；15.70%），其次为6次（3 707；12.25%）和5次（3 475；11.60%）. 运用多态性分析的方式初步验证SSR位点在不同地区山桐子标记中的可行性. 同时，利用Primer 5.0进行引物设计，随机筛选100对引物进行验证，31对引物可以扩增出条带，19对引物扩增出预期大小的条带，8对引物能特异性区分宜宾、资阳、宁强、成都4个不同地区的山桐子. 本研究通过分析山桐子高通量转录组序列的SSR信息，筛选出8对引物验证不同地区山桐子的遗传多样性，将有助于山桐子基因挖掘、分子标记育种和资源保护等后续工作的开展. （图6 表4 参26）

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