首页 期刊 药学学报 基于DNA条形码的川贝母及其近缘种的分子鉴定与亲缘关系研究 【正文】

基于DNA条形码的川贝母及其近缘种的分子鉴定与亲缘关系研究

作者:郑辉; 邓楷煜; 陈安琪; 付绍兵; 周德; 王威威; 倪典墨; 任瑶瑶; 周嘉裕; 廖海 西南交通大学生命科学与工程学院; 四川成都610031; 青海绿康生物开发有限公司; 青海西宁810003; 阿坝州食品药品检验所; 四川阿坝624000
川贝母   its2   dna条形码  

摘要:基于ITS2与psbA-trnH条形码序列,对川贝母及其近缘种开展分子生物学鉴定与亲缘关系研究。本文在采用《中国药典》规定的PCR-RFLP鉴定方法对川贝母及其近缘种的鉴定基础上,扩增所有样品的ITS2及psbA-trnH条形码序列,对其遗传距离进行分析,构建进化树,评价ITS2及psbA-trnH条形码的鉴定效果,探讨样品的亲缘关系。结果显示,PCR-RFLP方法仅能将样品分为非酶切组(包括平贝母、浙贝母及伊犁贝母)与酶切组(包括浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母与川贝母)。进一步获得川贝母与其近缘种的ITS2与psbA-trnH序列,发现ITS2序列长度为235~239 bp,种内和种间平均遗传距离为0.001和0.022,NJ树能够将样品分为“北方贝母群”(包括平贝母与伊犁贝母)与“南方贝母群”(包括浙贝母、浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母和川贝母)。后者又可细分为浙贝母与“川贝母复合群”,其中“川贝母复合群”中的贝母品种具有相近的亲缘关系。psbA-trnH序列长度为337~373 bp,种内及种间的遗传距离为0.263和0.329,NJ树未能有效聚类。说明ITS2条形码序列不仅能够对川贝母及其部分近缘种进行快速、准确地鉴定,还能够清晰不同贝母种之间的亲缘关系,这为川贝母分子标记的开发、药用植物资源的有效保护和合理开发利用提供了重要的理论依据。

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