首页 期刊 食用菌学报 基于交配型基因的酶切扩增多态性序列鉴定双孢蘑菇核型 【正文】

基于交配型基因的酶切扩增多态性序列鉴定双孢蘑菇核型

作者:冯志勇; 陈辉; 汪虹; 黄建春; 郝海波; 王倩; 宋晓霞; 隽加香; 张津京 南京农业大学生命科学学院; 江苏南京210095; 上海市农业科学院食用菌研究所; 农业部南方食用菌资源利用重点实验室; 国家食用菌工程技术研究中心; 国家食用菌加工技术研发分中心; 上海市农业遗传育种重点开放实验室; 上海201403
双孢蘑菇   交配型基因   核型   限制性内切酶  

摘要:为建立鉴定双孢蘑菇(Agaricus bisporus)核型的方法,根据GeneBank公布的其基因组信息,针对交配型基因序列设计特异性引物,以W192两个不同核型的同核体菌株A1和A2的菌丝体基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得交配型基因序列,筛选存在差异的序列,预测基因片段的限制性内切酶位点,筛选最佳酶切位点,根据酶切片段的差异鉴定菌株的交配型。结果表明:筛选得到长度为736 bp的基因序列,将其命名为aba1;核型为A1的同核体菌株,采用内切酶EcoRⅤ可以将aba1酶切成大小为257 bp和479 bp的两个片段;核型为A2的同核体菌株,采用内切酶XhoⅠ可以将aba1酶切成大小为327 bp和409 bp的两个片段;如果同时可以被两种限制性内切酶酶切,说明该菌株为异核体。采用基因测序鉴定了5株标记为孢子同核体的菌株和8株标记为原生质体同核体的菌株,测序结果表明:5株标记为孢子同核体的菌株中176P11、176P14和176P17的核型属于A1型,176P12和176P19属于A2型;8株标记为原生质体同核体的菌株中101-1P75和03P75的核型为A1型;152P11、46P23、46P27和152P2为A2型;03P46和176P21属于异核体;同时又采用笔者建立的内切酶方法鉴定了这些菌株,核型与基因测序鉴定结果相同。

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