首页 期刊 南京农业大学学报 森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析 【正文】

森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析

作者:林莹; 韩玉辉; 熊思嘉; 李泽斌; 张欣; 顾婷婷 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/园艺学院; 江苏南京210095
森林草莓   去乙酰化   进化分析   表达分析   基因复制  

摘要:[目的]本研究对森林草莓中组蛋白去乙酰化酶基因(HDAC)进行鉴定和分析,并研究其在生长发育以及逆境胁迫响应过程中的表达变化,为深入研究森林草莓组蛋白去乙酰化调控机制奠定基础。[方法]运用生物信息学方法,对森林草莓中HDAC基因进行鉴定,并进行蛋白结构域、染色体定位、基因复制类型和其他进化分析。利用转录组数据分析森林草莓中HDAC基因在不同组织和发育阶段中的表达变化。运用实时荧光定量PCR对森林草莓中HDAC基因在低温、高温胁迫下的表达变化进行分析。[结果]森林草莓中包含12个HDAC基因,其中RPD3/HDA1家族9个,SIR2家族2个,HD2家族1个;RPD3/HDA1家族基因可以分为5类,SIR2家族中基因分为2类。森林草莓中RPD3/HDA1和HD2家族HDAC基因主要通过离散型复制模式进行扩张,SIR2家族在双子叶进化过程中没有发生明显扩张。各个HDAC基因具有发育阶段或组织特异性表达。部分HDAC基因在森林草莓热胁迫处理中有不同程度的响应,对冷胁迫的反应相对较小。[结论]森林草莓HDAC基因具有植物的典型特性,并可能参与了森林草莓的生长发育和对热胁迫的响应。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

学术咨询 免费咨询 杂志订阅