摘要:目的通过TCGA数据库中肺鳞癌(Lung squamous cell carcinoma,LUSC)的转录组表达谱数据分析,找到与LUSC预后显著相关的转录基因,为后续研究提供数据支持。方法下载TCGA数据库中LUSC转录组表达数据及临床数据,应用R语言进行数据合并、标准化处理及差异分析,再用SPSS 20.0软件对差异表达基因进行数据分析,筛选出与LUSC生存显著相关的特异表达转录基因。结果Spearman秩相关分析筛选出预后相关的差异基因,再经Kaplan Meier进行Log-rank检验,筛出2个与LUSC患者预后密切相关的基因,而Cox多因素回归分析结果显示,DLX6更具有特异性。结论经Spearman秩相关分析和Kaplan Meier检验筛选出LUSC预后相关的转录基因的可信度较高,为LUSC预后分子标志物的研究和临床应用提供了数据支持。
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