首页 期刊 科学技术与工程 基于矩阵填充的肿瘤基因表达谱数据缺失点估计 【正文】

基于矩阵填充的肿瘤基因表达谱数据缺失点估计

作者:黄经纬; 杨国亮; 胡政伟; 王艳芳 江西理工大学电气工程与自动化学院; 赣州341000; 赣州市立医院信息技术科; 赣州341000
矩阵填充   模糊c均值   低秩   基因语义   缺失值估计  

摘要:为解决肿瘤基因表达谱数据后续研究需要完整数据矩阵的问题,针对包含缺失点的数据集。提出基于矩阵填充(matrix completion)与模糊C均值(fuzzy c-means algorithm,FCM)相结合的缺失点估计方法(FCM_MC)。该方法充分利用肿瘤基因表达谱数据的冗余信息,通过模糊C均值聚类得到具有良好的低秩特性的基因语义片段,再利用矩阵填充方法分别对每个语义片段进行缺失点的重建。在不同数据集上进行实验,与传统缺失点估计算法比较。实验表明FCM_MC算法在缺失数据估计准确度和类结构保持度上效果得到有效提升,同时运行效率较高。

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