首页 期刊 疾病监测 基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的克柔念珠菌遗传分化研究 【正文】

基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的克柔念珠菌遗传分化研究

作者:龚杰; 张沈茜; 张慧芳; 肖盟; 何利华; 赵飞; 徐英春; 张建中; 肖迪 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室; 感染性疾病诊治协同创新中心; 北京102206; 北京大学国际医院皮肤科; 北京102206; 中国医学科学院北京协和医院检验科; 北京100730; “侵袭性真菌病机制研究与精准诊断”北京市重点实验室; 北京100730
克柔念珠菌   谱系   遗传分化   基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱   分类模型  

摘要:目的在蛋白质水平明确克柔念珠菌的遗传分化特征,建立基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的不同谱系克柔念珠菌的鉴定方法。方法选取20株克柔念珠菌,采用MALDI-TOF MS结合分析软件ClinProTools,确定克柔念珠菌不同谱系的质谱标志峰,构建基于遗传算法(GA)的分类模型,用于区分不同谱系的克柔念珠菌菌株,选择25株克柔念珠菌对该模型进行验证。结果利用20株克柔念珠菌构建的GA分类模型,反映模型正确鉴别能力的识别能力值(RC)为100%,反映模型处理测试谱图变异能力的交叉验证值(CV)为97.89%。25株克柔念珠菌、150张谱图外部验证模型显示其分类能力为95.30%。确定13个克柔念珠菌谱系相关的特征峰(m/z 3971.40、3136.95、3427.33、2405.28、2996.73、2913.95、3376.97、6736.13、5819.03、4045.16、5869.00、3618.10及3946.14),可用于正确区分来自不同谱系的克柔念珠菌。结论本研究论证并确认了克柔念珠菌的群体遗传分化事件,同时也建立了一种简便而有效的快速谱系分型方法。

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