首页 期刊 黑龙江大学自然科学学报 基于Logistic奇异值分解模型的全基因组关联检测 【正文】

基于Logistic奇异值分解模型的全基因组关联检测

作者:于婷; 袁超凤; 周影; 马维军 黑龙江大学数学科学学院; 哈尔滨150080
生物标记检测   全基因组关联研究   logistic   svd   snp  

摘要:从海量的单核苷酸多态性(SNPs)中,挑选出与疾病或某些临床、环境因素有关的位点,仍是全基因组关联研究中的一个重要课题。针对表型-SNP数据构成的二维列联表结构,提出了一个Logistic SVD模型。该模型可以同时考虑所有的SNP。另外,通过刻画SNP基因型在不同疾病表型水平下的分布差异,基于该模型构建了一个SNP检测准则。模拟研究显示,所提出的检测准则比现有的检测方法更加有效。

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