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大豆引进种质抗胞囊线虫病、抗花叶病毒病和耐盐基因型鉴定及优异等位基因聚合种质筛选

作者：叶俊华; 杨启台; 刘章雄; 郭勇; 李英慧; 关荣霞; 邱丽娟 刊期：2018年第09期

我国从美国、俄罗斯、日本等26个国家或地区共引进大豆种质3218份,仅对部分种质进行了大豆胞囊线虫病(Soybean cyst nematode,SCN)、大豆花叶病毒病(Soybean mosaic virus,SMV)和盐敏感性的抗性鉴定,但基因型的系统分析尚未见报道。本研究针对大豆抗胞囊线虫病3个基因(rhg1、Rhg4、SCN3-11)和耐盐基因(GmSALT3)开发KASP标记5个,结合与大豆花叶病...

限制性两阶段多位点全基因组关联分析方法的特点与计算程序

作者：贺建波; 刘方东; 邢光南; 王吴彬; 赵团结; 管荣展; 盖钧镒 刊期：2018年第09期

全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)的理论及应用是近十几年来国内外数量性状研究的热点,但是以往GWAS方法注重于个别主要QTL/基因的检测与发掘。为了相对全面地解析全基因组QTL及其等位基因构成,本研究提出了限制性两阶段多位点GWAS方法(RTM-GWAS,https://github.com/njau-sri/rtm-gwas)。RTM-GWAS首先将多个相邻且紧密连锁...

玉米隐花色素CRY1b和CRY2基因转录丰度对不同光质处理的响应

作者：李红丹; 闫蕾; 孙蕾; 樊晓聪; 陈士瞻; 张燕; 郭林; 游光霞; 李庄; 杨宗举; 苏亮; 杨建平 刊期：2018年第09期

玉米株高、开花期、产量、品质等性状与环境中的光密切相关。隐花色素是一类蓝光和近紫外光的受体,主要参与植物的光形态建成及动、植物的生物钟调控。通过研究玉米隐花色素基因对不同光处理的表达模式,可为进一步研究其对玉米光形态建成的作用奠定基础。本研究采用RT-PCR技术克隆了玉米ZmCRY1b和ZmCRY2基因;利用生物信息学相关网站和软件对其编...

水稻窄叶突变体nal20的表型分析与基因定位

作者：龙海馨; 邱海阳; Muhammad; UZAIR; 房静静; 赵金凤; 李学勇 刊期：2018年第09期

叶片作为植物光合作用的主要器官,其面积的大小影响着光能利用率和最终产量。为了研究水稻叶片形态建成的分子机制,利用60Co-γ射线诱变粳稻品种春江06,在M2代中得到1份窄叶突变体,命名为narrow leaf20(nal20)。该突变体叶片变窄、株高降低、分蘖增多、茎节间缩短、抽穗期提前。本研究重点调查了3片功能叶的形态,发现突变体叶片宽度减少了50%,叶...

油菜种子含油量GWAS分析及位点整合系统构建

作者：魏大勇; 崔艺馨; 梅家琴; 汤青林; 李加纳; 钱伟 刊期：2018年第09期

含油量是油菜最重要的性状之一,目前已有较多的油菜种子含油量定位研究,然而各研究系统相对独立,群体与标记的差别使得难以比较不同研究结果。本研究连续4年种植了一个含308份材料的油菜自然群体,结合60K SNP芯片数据对种子含油量进行了全基因组关联分析(GWAS),并将所鉴定的显著位点与早前2个自然群体及10个分离群体鉴定到的位点进行全基因组比...

利用陆地棉MAGIC群体定位产量、生育期和株高性状的QTL

作者：黄聪; 李晓方; 李定国; 林忠旭 刊期：2018年第09期

棉花的产量、生育期和株高是重要的农艺性状,决定着棉花的经济效益和生产方式。为了研究这些性状的遗传基础,利用8个亲本构建的包含960个株系的陆地棉MAGIC(multi-parent advanced generation inter-cross)群体和SSR标记对这些性状进行关联分析。对产量、生育期和株高共8个相关性状进行了3年3个地点共5个环境的田间试验。经过最佳线性无偏预测(B...

甘蓝型油菜PIN家族基因的鉴定与生物信息学分析

作者：高堃; 华营鹏; 宋海星; 官春云; 张振华; 周婷 刊期：2018年第09期

PIN家族基因是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件,PIN基因编码生长素输出蛋白,介导生长素在植物体的运输,然而在基因组较复杂的甘蓝型油菜中缺乏系统研究。本研究运用生物信息学方法在甘蓝型油菜全基因组数据库筛选甘蓝型油菜PIN家族基因,对鉴定出的29个BnPINs基因开展拷贝数变异、分子特征、跨膜结构域、保守基序、染色体定位、系统进...

大豆GmHDL57基因的克隆及抗盐功能鉴定

作者：柯丹霞; 彭昆鹏; 张孟珂; 贾妍; 王净净 刊期：2018年第09期

HD-Zip I类转录因子在植物抵御非生物胁迫过程中发挥重要功能,本研究克隆得到1个大豆HD-Zip I类基因GmHDL57(Glycine max homeodomain-leucine zipper protein 57)。序列分析表明,GmHDL57基因包含1个1038 bp的开放读码框,编码345个氨基酸,具有HD-Zip类家族蛋白典型的保守结构域。基因时空表达分析表明,大豆GmHDL57基因在大豆植株的各个不同时期...

玉米株高主效QTLqPH3.2精细定位及遗传效应分析

作者：刘忠祥; 杨梅; 殷鹏程; 周玉乾; 何海军; 邱法展 刊期：2018年第09期

甘蔗ScWRKY4基因的克隆与表达特性分析

作者：王玲; 刘峰; 戴明剑; 孙婷婷; 苏炜华; 王春风; 张旭; 毛花英; 苏亚春; 阙友雄 刊期：2018年第09期

WRKY是植物中特有的转录因子家族之一,在植物对生物和非生物逆境胁迫的应答反应中起重要调控作用。本研究基于课题组前期构建的甘蔗(Saccharum spp.)转录组数据库,从新台糖22(ROC22)中成功克隆到1个WRKY基因,命名为ScWRKY4(GenBank登录号为MG852087)。序列分析发现,ScWRKY4基因cDNA全长1265 bp,包含1个741 bp的完整开放读码框,编码246个氨基酸,...

彩色棉多药和有毒化合物输出蛋白MATE家族基因的鉴定及表达分析

作者：王作敏; 刘瑾; 孙士超; 张新宇; 薛飞; 李艳军; 孙杰 刊期：2018年第09期

植物多药和有毒化合物输出家族(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)是一类可转运阳离子染料、氨基葡糖、多种抗生素与药物等次生代谢产物的转运蛋白家族。本研究利用生物信息学手段从陆地棉基因组数据库中鉴定了MATE家族基因,并从基因的系统进化关系、染色体分布、基因结构和表达模式等方面对该基因家族特征进行了比较分析。共鉴定出...

外源NO供体对水分亏缺下玉米叶片碳同化关键酶及抗氧化系统的影响

作者：杨青华; 郑博元; 李蕾蕾; 贾双杰; 韩心培; 郭家萌; 王泳超; 邵瑞鑫 刊期：2018年第09期

为了探讨外源NO供体(硝普钠,SNP)对水分亏缺下玉米叶片碳同化关键酶及抗氧化系统的影响及其调控机制,在20%PEG-6000模拟水分亏缺胁迫下,研究了SNP对玉米品种驻玉309幼苗叶片光合碳同化核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶(Rubisco)和Rubisco活化酶(RCA)活性及其基因表达、抗氧化酶活性及其同工酶谱变化的影响。结果表明,在水分亏缺胁迫下,SNP显著上调...

基于甘蔗热带种(LA-purple)全基因组序列的SSR开发及特征分析

作者：王恒波; 肖乃衍; 朱专为; 刘翠翠; Intikhab; ALAM; 陈平华; 卢运海 刊期：2018年第09期

现代甘蔗栽培品种(2n=100~130)是由甘蔗热带种(2n=80)与割手密(2n=40~128)种间杂交而来,形成异源多倍体、非整倍体作物,使得甘蔗栽培品种中80%~90%的染色体来源于热带种。开发热带种基因组SSR分子标记,有助于甘蔗遗传多样性分析、分子标记辅助选择、遗传图谱的构建等。本研究基于热带种LA-purple的全基因组测序数据的255 398个预测基因序列(累计...

黄土高原旱作玉米籽粒水分与机械粒收质量的关系

作者：樊廷录; 王淑英; 续创业; 李尚中; 王甲玺; 王克如; 赵刚; 程万莉; 张建军; 王磊; 党翼 刊期：2018年第09期

玉米机械粒收是全程机械化的关键,但存在着籽粒破碎、果穗和落粒损失严重等备受关注的问题。开展机械粒收质量及其影响因素研究,对推进旱作玉米机械粒收技术应用具有重要意义。本研究选择国内玉米主栽品种33个,于2016–2017年在甘肃泾川同一地块上用福田雷沃谷神收割机械粒收,分析籽粒水分与机械粒收质量指标的关系。结果表明,基因型差异是造成...