摘要：目的:探讨CVB2云南分离株编码主要中和抗原的衣壳蛋白VP1基因的分子特征,以期为中国CVB2感染致病的分子基础、基因疫苗的研制和心脏基因工程实施提供参考依据.方法:采用逆转录PCR技术扩增CVB2云南分离株VP1基因,经分子克隆获得pMD18-T-CVB2VP1并测序,应用生物信息学进行其序列、同源性分析、预测蛋白质二级结构,并建立进化树.结果:CVB2云南分离株VP1基因全长约846bp,无起始密码及终止密码,与Ohio-1株(GenBank登录号:AF081312)核苷酸、氨基酸序列同源性最高为98%.BC环的βB区与βC区之间缺失6个腺嘌呤,其编码2个构成无规卷曲结构的赖氨酸.CVB的共同抗原表位区中RIYFKPKHVKA高度保守,为云南分离株及其他参考毒株的共同序列,变异主要在CVB2云南株的251～252位,W→Y,V→I.结论:CVB2云南分离株与Ohio-1株同源性最高,亲缘关系最近,以主要中和抗原表位区存在缬氨酸缺失,CVB共同抗原表位区存在具有规律性的变异及保守序列等为其主要分子特征.

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