首页 期刊 园艺学报 苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选 【正文】

苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选

作者:刘源霞; 兰进好; 柏素花; 孙晓红; 刘春晓; 张玉刚; 戴洪义 青岛农业大学园艺学院青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室; 山东青岛266109; 青岛农业大学农学与植物保护学院; 山东青岛266109; 青岛农业大学生命科学学院; 山东青岛266109
苹果   高分辨率熔解曲线   炭疽菌叶枯病   snp标记   indel标记  

摘要:以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材,挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的,第15条染色体上,位于SSR标记S0304673和S0405127之间500 kb物理距离内,由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记,通过高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting,HRM)技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个SNP及4个InDel标记。通过对重组个体的基因型及表型分析,发现标记InDel4227和InDel4254表现出与Rgls基因位点共分离,将基因Rgls精细定位于标记InDel4199和SNP4299之间100 kb的物理距离内。对该基因位点两侧4.14.3Mb距离内的基因进行统计分析,表明在该区段内存在40个有功能注释的基因,涉及到细胞组成、分子功能和生物过程方面共19个GO分类。

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