首页 期刊 微生物学报 应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对kefir粒中细菌多样性的研究 【正文】

应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对kefir粒中细菌多样性的研究

作者:王荫榆; 李会荣; 贾士芳; 吴正钧; 郭本恒 光明乳业有限公司技术中心; 上海200072; 中国极地研究中心; 上海200136; 中国科学院微生物研究所; 北京100080
开菲尔粒   细菌多样性   16s   rdna   鞘氨醇杆菌  

摘要:以开菲尔(Kefir)粒为材料,经过DNA抽提和16SrDNA V3区PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离并切割电泳条带进行序列测定,并与现有的数据库进行了比较,对Kefir粒的细菌多样性进行分析。结果表明,DGGE图谱中可检测到的8条带的16SrDNA基因序列中有7个基因序列与GenBank数据库登录的相关序列的相似性大于98%,余下的1个基因序列的相似性也大于96%。相似性大于98%的7个克隆中,有3个属于鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium),2个属于乳杆菌属(Lactobacillus),其它2个分别属于肠杆菌属(Errterobacter)和不动杆菌属(Acinetobacter)。首次报道了鞘氨醇杆菌作为优势菌群存在开菲尔Kefir粒中。

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