首页 期刊 基因组学与应用生物学 病毒灭活疫苗诱导云斑尖塘鳢脾脏转录组分析 【正文】

病毒灭活疫苗诱导云斑尖塘鳢脾脏转录组分析

作者:周阳; 李本旺; 林强; 付小哲; 李敏; 梁红茹; 刘礼辉; 卢伟华; 李宁求 中国水产科学研究院珠江水产研究所; 农业部渔用药物创制重点实验室; 广东省水产动物免疫技术重点实验室; 广州510380; 上海海洋大学水产与生命学院; 上海201306; 广东省东莞市水生动物防疫检疫站; 东莞523127
云斑尖塘鳢   转录组   传染性脾肾坏死病毒   鳜弹状病毒   免疫应答  

摘要:为阐明云斑尖塘鳢对病毒灭活疫苗的免疫应答机制,本研究采用RNA-sequencing技术结合生物信息学方法分析了传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗接种云斑尖塘鳢后脾脏转录谱。分别构建疫苗接种后7 d、14 d脾脏cDNA文库并对其进行高通量测序,共获得85547条Unigenes,其中32386条Unigenes被注释;共筛选得到13593个差异表达基因,其中免疫后7 d上调基因1291个、下调基因2030个,14 d上调基因3732个、下调基因6540个。GO功能注释显示,差异表达基因编码蛋白主要与免疫应答、细胞黏附以及细胞增殖相关;KEGG分析表明差异表达基因集中在细胞-细胞受体互作通路、细胞粘附分子通路和MAPK信号通路等。选取差异表达的IL-1β、IL-12、MHCⅠ、MHCⅡ等4个基因进行qPCR验证,结果与转录谱结果相符。研究结果为阐明云斑尖塘鳢对传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗的免疫应答机制提供依据。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

学术咨询 免费咨询 杂志订阅