分子植物育种杂志 北大期刊 统计源期刊

水稻OsVQ20基因生物信息学及表达分析

作者：骆鹰; 何福林; 李治章; 张斌; 刘永昌; 谭炎宁; 刘小文; 张超 刊期：2019年第06期

植物VQ蛋白作为植物体内一类重要的辅助调控因子,对植物生长发育、基因调控以及响应外界环境变化方面发挥重要作用。探讨激素及非生物胁迫下OsVQ20基因的表达模式,为水稻的品种改良提供理论依据。通过PlantCARE数据对OsVQ20基因启动子元件进行分析,利用水稻激素芯片及荧光定量PCR分析OsVQ20基因的表达模式。结果表明,OsVQ20基因启动子含有干旱(M...

大豆GmGLDH基因的克隆、表达及生物信息学分析

作者：薛晨晨; 徐筋燕; 郭娜; 赵晋铭; 邢邯 刊期：2019年第06期

为了探究大豆L-半乳糖酸-1,4-内酯脱氢酶基因Gm GLDH-Glyma.02G166300 (以下简称GmGLDH)的功能,本研究采用同源克隆法获得大豆GmGLDH基因,开展了相关生物信息学分析,并对其非生物胁迫下表达模式进行调查。结果表明,GmGLDH基因包含一个长度为1 752 bp的ORF序列,编码584个氨基酸。GmGLDH蛋白为亲水性较强的蛋白;二级结构中以无规则卷曲和α螺旋结构...

山药块茎膨大过程内源激素的变化及相关基因的表达验证

作者：唐雯琪; 夏薇; 黄东益; 黄小龙; 吴文嫱; 许云; 肖勇 刊期：2019年第06期

山药(Dioscorea opposite, 2n=40)属于薯蓣科,其地下茎能膨大,膨大的地下茎具有良好的食用和药用价值,为了解析山药块茎膨大的分子机制,本研究对块茎膨大的3个时期对其叶片、地上茎、块茎各部位进行取样,测定内源激素含量,并结合山药转录组数据,对植物激素相关基因进行表达验证。研究表明:IAA、JA、MeJA全部呈上升趋势,而GA3含量先上升后下降;IA...

春性甘蓝型油菜sBnTCP2基因的克隆及表达分析

作者：李潘; 许唱唱; 罗玉秀 刊期：2019年第06期

克隆春性甘蓝型油菜相对于蕾期在苗期特异性表达的基因,并对其在各个发育时期以及各组织中的表达模式进行研究。用cDNA-AFLP技术筛选苗期特异性表达的基因片段,根据差异片段设计引物,用RACE技术扩增差异基因两端序列,再根据两端序列设计引物,进行全长cDNA克隆;用RT-qPCR法进行基因表达分析。结果获得了一个昼夜节律基因的CDS全长序列1 077 bp,该...

黄瓜苯丙氨酸解氨酶基因CsPAL的克隆及响应白粉菌侵染的表达分析

作者：高红胜; 张仁英; 许学文; 齐晓花; 徐强; 陈学好 刊期：2019年第06期

为了分析苯丙氨酸解氨酶基因(CsPAL)在黄瓜侵染白粉菌中的转录应答响应,对CsPAL基因(GenBank No.JN 675927)及其启动子进行了克隆与序列分析,再利用qRT-PCR技术分析了该基因在黄瓜高抗白粉病品种‘Jin5-508’接种白粉菌后不同时间的相对表达量。结果表明:CsPAL基因全长2 142 bp,编码713个氨基酸;推测CsPAL蛋白存在于细胞质中;系统发育进化树分析...

黄灯笼辣椒肉桂酰辅酶A还原酶(CCR1)基因的克隆及序列分析

作者：倪苗; 居利香; 雷欣; 王龙飞; 郝园园; 舒黄英; 汪志伟; 成善汉 刊期：2019年第06期

CCR是调控苯丙烷代谢木质素合成支路的关键酶,其活性对辣椒辣味具有重要影响,本研究通过RT-PCR结合RACE法成功从海南黄灯笼椒茎尖克隆到一个全长CCR1,并通过DNAMAN、DNAStar等软件与网站对该序列进行生物信息学分析,结果表明:黄灯笼辣椒CCR1 cDNA序列全长1 362 bp,含有一个840 bp的完整的ORF,编码279个氨基酸;该基因编码蛋白无跨膜结构域,无信号...

红花玉兰和白玉兰冷应激代谢组学分析

作者：段二龙; 马履一; 杨杨; 邓世鑫; 马江; 段晓婧; 周明明 刊期：2019年第06期

为探究红花玉兰和白玉兰低温胁迫下的代谢表型特性,以红花玉兰和白玉兰茎尖为材料,采用GC-MS检测技术,分别检测了两个物种在常温20℃和低温4℃下的代谢物质,共检测出代谢物323种,对所有样本进行了多元统计分析。将处理间代谢物进行了四次比对分析,并对差异代谢物进行了统计和归类,筛选出了相关性最高的代谢通路,总结分析了两个物种在低温胁迫下...

基于转录组金银花WRKY转录因子的挖掘与分析

作者：陈亮; 崔芬芬; 王勇飞; 曹亚萍; 宋芸; 乔永刚 刊期：2019年第06期

WRKY转录因子是植物抗逆应答过程中最为常见的蛋白家族。为了挖掘金银花抗寒相关的WRKY基因,本研究基于已有的转录组数据,利用植物转录因子数据库和BioEdit对WRKY进行筛选及保守结构域分析,对筛选出的WRKY转录因子利用ExPASy进行理化性质分析,利用PSORT进行亚细胞定位预测,NetPhos进行磷酸化位点分析并且利用MEME数据库对WRKY基因的氨基酸进行序...

基于转录组测序的云南‘火把梨’花青素相关基因分析

作者：王大玮; 沈兵琪; 周凡; 周军 刊期：2019年第06期

本研究以云南‘火把梨’转色前后的梨果皮为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq TM 2000/MiSeq)对两种梨材料全转录功能基因组测序后组装,再通过GO、Swiss-Prot两大数据库进行花青素相关差异表达基因筛选,以了解可能与花青素合成相关的基因及其表达模式,同时将差异基因在NCBI数据库进行Blast序列比对,对其功能进行分析。最终共获得7.52...

NO及SA诱导三生烟草抗逆调控基因的动态分析

作者：宿梅飞; 王俊红; 魏小红 刊期：2019年第06期

茶树CCoAOMT基因克隆及启动子的结构分析

作者：林海燕; 罗勇; 陈丝; 禹双双; 曾泽媛; 刘仲华; 王坤波; 黄建安 刊期：2019年第06期

茶树咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是甲基化EGCG生物合成的一种重要酶,为探明CCoAOMT基因的表达调控规律,进一步解析甲基化EGCG生物合成的调控机制。本研究采用同源克隆法获得了茶树CCoAOMT的cDNA全长序列,采用染色体步移技术(Genome walking)获得了该基因的启动子序列,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明,CCo AOMT全长cDNA为1 000 ...

槟榔花果转录组数据组装及基因功能注释

作者：代佳妮; 陈曦; 云一倩; 王勇; 于靖 刊期：2019年第06期

为了挖掘参与槟榔主要次生代谢产物生物合成与积累的关键酶基因,并明确其组织特异性,本研究以‘热研1号’槟榔雄花、雌花、种子、果肉为试验材料,用Illumina HiSeq TM 2000分别进行转录组测序,共获得265 505 184个Clean reads片段,组装后与Nr、KOG、KEGG、Swiss-Prot四大数据库进行比对,共有78 798个Unigenes被四大数据库注释,其中NR共注释35 46...

橡胶树中碱性转化酶HbNIN9表达及酶学特性分析

作者：王佳; 龙翔宇; 阳江华; 方永军; 秦云霞; 白蓓蓓; 卢基来; 唐朝荣 刊期：2019年第06期

转化酶作为蔗糖分解代谢的关键酶,在植物生长发育、生物与非生物胁迫响应等生理过程中发挥重要作用。基于对橡胶树不同组织转录组数据库的分析,本研究克隆了一个在橡胶树种子中有较高丰度表达的中碱性转化酶基因HbNIN9;系统进化分析和在线软件预测均显示其亚细胞定位为线粒体,属于中碱性转化酶α亚族成员;利用原核表达体系成功获得Hb NIN9优化表...

文冠果种仁油脂脂肪酸形成的多基因协同调控

作者：刘祾悦; 阮成江; 王莉; 张莞晨; 王海明; 吴波; 闫蕊 刊期：2019年第06期

文冠果是中国北方重要的木本油料树种,种仁油脂富含油酸、亚油酸,特别是含有3%~5%其他食用植物油缺乏的神经酸。为探讨文冠果种仁油脂脂肪酸形成的基因调控机制,以品系‘12-03’4个不同发育期(6月22日, 7月6日, 7月19日, 8月1日)的种仁为材料,利用GC-TOF/MS (气相色谱飞行时间质谱)方法测定种仁油脂脂肪酸组份及不同组份的相对百分比;利用q RT-P...

阳春砂WRKY40的克隆、分析及原核表达

作者：李萌; 王虹; 赵海莹; 黄韵萍; 杨锦芬 刊期：2019年第06期

转录因子可有效调控植物次生代谢产物的生物合成,本研究从姜科药用植物阳春砂(Amomum villosum Lour.)中克隆获得两个WRKY转录因子基因,命名为AvWRKY 40-1和AvWRKY 40-2。两个基因的编码框分别为852 bp和885 bp,分别编码283和294个氨基酸。Av WRKY 40-1和Av WRKY 40-2编码的蛋白序列一致性为75%,在GenBank中均比对上拟南芥的WRKY 40,且均含有WRK...