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水稻ARF基因家族新成员ADP-Ribosylation Factor-Like Protein 5(OsARFL5)的克隆及表达分析

作者：汪琨璧; 付亚雄; 刘思琪; 朱骞; 熊海波; 李伟; Sadia; Nadir; 孙明姬; 李梦婷; 周丽; 李东宣; 陈丽娟 刊期：2019年第03期

小G蛋白家族中的亚家族ADP-核糖基化因子(ADP-ribosylation factor, ARF),在生物体内起众多的生理作用,参与基因表达、细胞骨架重组装、微管的形成以及囊泡和核孔运输等。本研究已成功克隆得到ARF基因家族中的一个新基因OsARFL5,系统进化分析表明该基因与SiARFC1亲缘关系较近;以该基因和其启动子序列构建了两种遗传转化表达载体(pOsARFL5::GUS, ...

紫心甘薯IbCHS基因启动子的克隆及功能分析

作者：郭丹华; 彭倩; 胡敏伦; 高峰 刊期：2019年第03期

利用hi Tail-PCR从紫心甘薯‘A5’基因组DNA中扩增得到查尔酮合成酶IbCHS基因5’端上游2470 bp的一段序列,用PlantCARE软件序列分析表明,该序列含有启动子基本元件CAAT-box和TATA-box,还有赤霉素应答元件、光应答元件、MYB和bHLH转录因子结合元件,初步推测其为IbCHS基因的启动子,命名为PIbCHS基因启动子。将PIbCHS启动子从5’端进行截短克隆,得...

木薯MeNF-YB转录因子的克隆及在诱导活性氧积累中的作用

作者：何欣宜; 韦运谢; 施海涛; 刘国银 刊期：2019年第03期

在植物的生长发育、生理活动和抗逆反应中,核因子Y的亚基NF-YB发挥着重要作用。木薯是一种具有饲用、工业利用、种植等价值的重要经济作物。为探究MeNF-YB在诱导活性氧积累中的作用,本研究克隆了华南124木薯的一个NF-YB转录因子对其进行分析,结果表明该转录因子在叶片中表达量最高,并受到H2O2诱导表达,同时MeNF-YB蛋白定位在细胞核上,而且MeNF-Y...

紫斑牡丹种子发育期油脂合成积累的源汇基因协同表达

作者：韩平; 阮成江; 丁健; 张莞晨; 吴波; 阮东; 刘文浩; 王国辉 刊期：2019年第03期

为研究紫斑牡丹种子油脂合成积累与相关基因(GPD1, DGAT1和DGAT2)表达间的关系,以四个不同发育期(6月20日, 7月7日, 7月17日和7月27日)的种子为材料,氯仿甲醇法测定种子含油率,实时荧光定量PCR方法分析基因的表达模式,分析相关基因在不同发育期种子中的表达差异及其对油脂合成积累的影响。结果表明:(1)不同发育期紫斑牡丹种子含油率呈不断升高趋...

香蕉BADH基因序列及表达特性分析

作者：唐露; 杨振; 白蓓蓓; 乔飞; 李新国 刊期：2019年第03期

甜菜碱醛脱氢酶(BADH)是植物体内甜菜碱合成过程中的关键酶,对植物抵御逆境具有重要作用。为研究香蕉BADH基因序列及表达特性,本研究利用香蕉基因数据库对香蕉BADH基因序列及蛋白序列进行生物学信息分析,采用qTR-PCR技术对香蕉幼苗中BADH基因进行表达分析。结果表明:MaBADH基因属单克隆基因,含有15个外显子,14个内含子;顺式调控元件预测显示在Ma...

红肉猕猴桃果实发育期不同果肉部位比较转录组分析

作者：涂美艳; 李明章; 孙淑霞; 李靖; 陈栋; 宋海岩; 江国良; 廖明安 刊期：2019年第03期

菠萝AcSAP转录因子对非生物胁迫和生物胁迫的应答响应

作者：夏杨; 周佳炜; 苏初连; 叶子; 蒲金基; 陈华蕊; 张贺 刊期：2019年第03期

STERILE APETALA (SAP)是调节花序、花和胚珠发育,调控分生组织细胞的增殖和器官大小的多功能基因。本研究利用生物信息学的方法对菠萝SAP转录因子进行序列分析,并通过qRT-PCR技术研究了非生物胁迫和生物胁迫对菠萝SAP基因表达的影响。结果表明,菠萝SAP蛋白为稳定疏水酸性蛋白且含有3个WD40重复区域,蛋白质二级结构显示,菠萝SAP蛋白主要结构元件...

基于高通量测序的梨果实常用内参基因表达稳定性分析

作者：王月志; 戴美松; 蔡丹英; 施泽彬 刊期：2019年第03期

合适的内参基因对基因表达分析结果准确性至关重要。通过同源搜索在梨中获取了102个常用内参基因同源基因,其中的89个基因以基因家族形式存在。高通量数据分析揭示,各基因在不同发育时段或家族成员间均检测到不同水平的表达水平差异和表达稳定性差异。而相同基因在不同材料间的表达水平相对保守。这些基因在不同发育时段梨果实中的表达存在明显...

橡胶树感白粉病基因LFG1和LFG2的克隆及表达分析

作者：李书缘; 刘承圆; 梁鹏; 何其光; 缪卫国 刊期：2019年第03期

白粉病是橡胶树的主要病害之一,为阐明橡胶树与白粉菌分子互作机制,本研究基于已报道的负调控基因LFG为基础,克隆出橡胶树中同源基因LFG1和LFG2,采用同源克隆方法,以橡胶树基因组DNA和cDNA为模板,PCR扩增HbLFG1和HbLFG2基因;利用生物信息学方法分析该基因及其同源蛋白;并分别对白粉菌侵染不同时间和不同病害等级的橡胶树叶片进行RT-PCR测定,检测...

柳杉维管形成层及木质部区转录组序列及基因表达分析

作者：曹玉婷; 莫家兴; 欧阳磊; 施季森; 徐进 刊期：2019年第03期

柳杉是中国南方重要的针叶用材树种,具有树形高大,纹理直等特点,已广泛用于板材和建筑生产中,研究柳杉木材形成过程中维管形成层及木质部区转录组特征,为木材形成主要过程的分子机理,木材形成有关基因调控,培育优良材质的林木提供理论参考。本研究以柳杉形成层组织为材料,通过Illumina Hiseq测序平台对4个不同发育阶段的柳杉维管形成层进行转录...

杨树10种miRNA的低氮胁迫差异表达及靶基因的鉴定与分析

作者：包海; 孙丰硕; 徐千惠; 王延伟 刊期：2019年第03期

microRNA (miRNA)是一类重要的非编码小分子RNA,在植物应对逆境胁迫的响应中起着重要调控作用。为了探讨miRNA在杨树受低氮营养胁迫不同时间段的差异表达模式以初步鉴定参与低氮胁迫响应的miRNA,本研究以重要乡土树种毛白杨为材料,进行不同时间段的低氮胁迫处理,分别提取长度在200 nt以下的小片段RNA,利用实时定量PCR技术研究毛白杨在低氮胁迫后...

杨树PeNHLd基因的克隆与表达模式分析

作者：刘思安; 陈彩慧; 杨春霞; 胥猛; 李火根 刊期：2019年第03期

含有NHL结构域的基因在人类、动物和微生物的生长发育过程中扮演着重要角色,但是在植物中关于该类基因的研究还未曾有过报道。为了探究该类基因在植物中的表达模式,本研究以“南林895”杨为材料,采用RACE技术克隆得到了PeNHLd基因,并通过RT-PCR对预测的ORF框进行了验证。杨树PeNHLd基因包含7个外显子和6个内含子,其c DNA全长为1 971 bp,包括1个1...

马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析

作者：吴晓刚; 陈佩珍; 韦蔷; 武星; 季孔庶 刊期：2019年第03期

在木质素生物合成里,咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase, COMT)起重要作用。本论文以马尾松幼苗作为材料,并通过PCR技术以及RACE技术从马尾松材料中克隆出Pm COMT基因的cDNA全长。该cDNA全长为1660bp,其中预测完整ORF全长为1125bp,可编码374个氨基酸的蛋白。蛋白相对分子质量为41.81 kD;等电点(pI)为5.03,总平均亲水性为-0....

长筒石蒜类胡萝卜素裂解双加氧酶基因LlCCD4的克隆与表达

作者：岳远征; 王晰; 丁文杰; 李娅; 刘家伟; 王良桂 刊期：2019年第03期

长筒石蒜(Lycoris longituba)是石蒜属植物,为中国特有的观赏花卉,具有极高的观赏价值也是石蒜属少有的香花品种,然而目前尚未有关于其花香方面的报道。故本研究以长筒石蒜花瓣为材料,在长筒石蒜中开展了花香基因CCD4的研究。利用课题组已获得的长筒石蒜花瓣转录组数据库,我们筛选到1个与拟南芥CCD4基因同源性最高的序列,并克隆得到了其完整的编...

转录组学技术在茶树抗逆性的研究进展

作者：林海燕; 曾超珍; 谭斌; 王坤波; 刘仲华 刊期：2019年第03期

茶树(Camellia sinensis)属山茶科山茶属,是一种重要的木本经济作物,其叶片富含多种活性物质,其中尤以儿茶素、咖啡因、茶氨酸及其他游离氨基酸等活性成分对茶叶品质有重要影响。逆境胁迫是影响茶树生长发育、产量及品质的重要因素,人们对茶树应答逆境胁迫的分子机理越来越关注。转录组学作为功能基因组学的重要组成部分,它从RNA水平上全面研究...