分子植物育种杂志 北大期刊 统计源期刊

小麦TaNF-YB6基因亚细胞定位和非生物胁迫表达分析

作者：万千; 张秀荣; 赵兰飞; 刘风珍; 王宏伟; 孔令让 刊期：2016年第11期

本研究以小麦山融3号为材料,克隆出基因Ta NF-YB6,其全长为435 bp,预测该基因编码蛋白分子量为16.06 k D,等电点为8.48。生物信息学分析显示,该基因与其他植物中NF-YB家族成员具有较高同源性,其中与一粒小麦Tm NF-YB5同源性最高,为74.15%。亚细胞定位结果显示,该基因编码蛋白在细胞膜和细胞核中均有分布。利用Real-time PCR对该基因在多种非生物...

玉米全基因组中UXS基因家族的鉴定及生物信息学分析

作者：王维维; 高贵珍; 单玲玲; 陈军; 吴萧; 闫飞飞 刊期：2016年第11期

UXS基因参与植物细胞壁的合成过程,在植物生长发育中起着重要作用。本研究采用生物信息学方法鉴定了玉米全基因组中全部UXS结构基因,对其命名和检测相关属性,并对玉米中UXS结构基因家族进行构建进化树和染色体定位。通过对进化树的分析可清晰地看出基因的相似程度和基因之间的亲缘进化关系,染色体定位图的分析可看出基因在染色体上的位置,为进一...

腐霉菌诱导的大豆谷胱甘肽转移酶GmGST26基因的分子特征和表达分析

作者：王伟威; 魏崃; 张丽; 于志远; 杨剑飞; 刘丽君 刊期：2016年第11期

腐霉根腐病严重影响着大豆种子发芽和植株的生长,谷胱甘肽转移酶是植物与生物胁迫和非生物胁迫相互作用的主要酶,在失活有毒化合物,保护植物细胞免受氧化损伤等方面扮演着十分重要的角色。本研究从腐霉菌侵染的抗病大豆灰不支黑豆中分离出Gm GST26基因,采用生物信息学方法对大豆Gm GST26的序列特征、结构、大豆Gm GST家族基因的进化关系及表达数...

International Journal of Molecular Medical Science (IJMMS)

刊期：2016年第11期

割手密2个DREB2基因的克隆与比较分析

作者：姚艳丽; 胡小文; 徐磊; 邢淑莲; 刘洋 刊期：2016年第11期

干旱应答元件结合蛋白(dehydration responsive element binding protein,DREB),在植物应对干旱、盐碱和低温胁迫的反应中起非常重要的调控作用。利用已知的甘蔗栽培种DREB2转录因子序列,设计引物,按照同源克隆的方法,获得了2个割手密DREB2基因组DNA序列,分别命名为Ss DREB2-a和Ss DREB2-f(Gen Bank登录号分别为:KU963272和KU963277)。序列分析...

花生籽仁不同发育时期的转录组测序分析

作者：和小燕; 胡晓锋; 王允; 张幸果; 李贺敏; 崔党群; 殷冬梅 刊期：2016年第11期

通过花生籽仁不同时期转录组测序分析,从分子水平上揭示控制花生油脂合成的重要基因。本研究以高油和低油花生新品系为研究对象,构建了花生籽仁早期和中后期4个转录组测序文库。通过高通量测序共获得了59 236条Unigenes,其COG功能涉及了大多数的生命活动,整体功能类的基因最多有4 730条;其中与代谢类和油脂转运相关的基因有654条;Unigene参与的...

花生长链酰基辅酶A合成酶1基因(LACS1)的克隆、鉴定与组织表达

作者：徐日荣; 陈湘瑜; 林栩松; 唐兆秀 刊期：2016年第11期

长链酰基辅酶A合成酶(long chain acyl-Co A synthetase,LACS)是油脂代谢的重要催化酶。本研究采用RT-PCR技术,从花生(Arachis hypogaea L.)克隆到LACS1(Gen Bank登录号:KT932703),分析了该基因的结构组成,预测编码氨基酸与其他植物的同源性,采用实时Real-Time PCR技术对LACS1的组织表达进行研究。结果显示,花生LACS1基因全长2 219 bp,包含1 992...

Genomics and Applied Biology (GAB)

刊期：2016年第11期

PCR-walking法扩增马铃薯DM突变体侧翼序列与初步分析

作者：杨永智; 连欢欢 刊期：2016年第11期

本研究以双单倍体马铃薯DM的突变体为材料,利用PCR-walking的方法扩增其突变体的侧翼序列。在试验中,以60个鉴定过的阳性突变体样品为材料扩增后,有28个样品扩增出有效条带。PCR胶回收后测序,有2个样品测序无信号,其他26个样品,将测序与载体序列和马铃薯基因组序列用BLASTN比对,发现有6个样品分别插入到了马铃薯1、3或7号染色体上。通过进一步比...

水芹OjHSP90基因克隆及生物信息学分析

作者：胡艳平; 李德明; 朱白婢; 黄文枫; 周曼; 蔡兴来; 王敏 刊期：2016年第11期

本研究从水芹中克隆得到一个HSP基因Oj HSP90,生物信息学分析表明:水芹Oj HSP90基因全长2 100 bp,编码699个氨基酸;Oj HSP90蛋白的理论分子量为80.3 k D,等电点为5.01,是一种亲水性的稳定蛋白;Oj HSP90蛋白的二级结构中,α-螺旋占52.93%,延伸链占16.74%,β-折叠占5.87%,无规则卷曲占24.46%;该蛋白的N端含有1个HSP90超家族蛋白保守的结构域YSNKEIFL...

草莓FaUVR8基因的cDNA克隆、生物信息学分析及原核表达条件优化

作者：刘勇强; 王熙然; 叶云天; 娄可飞; 陈清; 汤浩茹 刊期：2016年第11期

紫外线B(UV-B)对于植物生长发育具有重要调节作用,其中UV RESISTANCE LOCUS 8蛋白作为UV-B的光受体在植物响应UV-B过程中起关键作用。草莓是一种重要的经济果树,目前关于草莓的UV-B光受体报道较少。为研究草莓中UV-B受体蛋白,本研究采用同源克隆的方法获得‘丰香’草莓中编码UV-B光受体蛋白的c DNA序列,进行了生物信息学的分析并构建了原核生物...

草莓叶黄素循环关键酶基因VDE和ZEP的克隆与分析

作者：陈敏氡; 朱海生; 王彬; 温庆放; 林珲 刊期：2016年第11期

叶黄素循环在逆境胁迫中对植物光系统起着重要的保护作用。紫黄质脱环氧化酶(VDE)和玉米黄质环氧化酶(ZEP)是调控叶黄素循环的关键酶。本研究采用RT-PCR和RACE技术率先从草莓中克隆获得VDE和ZEP基因。VDE基因c DNA全长1 842 bp,ORF为1 467 bp,编码489个氨基酸;ZEP基因c DNA全长2 325 bp,ORF为1 980 bp,编码660个氨基酸。生物信息学分析表明草莓V...

岷江百合LiGPAT基因的克隆及生物信息学分析

作者：陈丽静; 颜楠楠; 尹元元; 张丽; 钟鸣; 马慧; 李天来 刊期：2016年第11期

为探索百合的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,本试验选取了抗寒能力极强的岷江百合(Lilium regale)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到了岷江百合的Li GPAT基因的ORF区序列,全长1 212 bp,编码403个氨基酸,分子量约为45.4 k D,Gen Bank登录号为JX524740。通过同源序列比对发现,Li GPAT基因编码的氨基酸与单子叶植物油棕GPAT基因编码的氨基酸的一致性最高,...

International Journal of Horticulture (IJH)

刊期：2016年第11期

蜻蜓凤梨AfDREB2C基因的克隆及乙烯响应特性分析

作者：雷明; 王加宾; 丛汉卿; 李志英; 徐立 刊期：2016年第11期

以重要的热带花卉蜻蜓凤梨(Aechemia fasciata)为材料,基于转录组数据,利用c DNA末端快速扩增(rapid amplification of c DNA ends,RACE)技术克隆了APETALA2/Ethylene Response Element Binding Protein(AP2/EREBP)家族的一个基因,并将其命名为Af DREB2C。Af DREB2C c DNA全长848 bp,有一个594 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码197...