摘要:DNA序列分类作为生物信息领域的一项基础任务,其目的是根据结构或功能的相似性来预测DNA序列所属的类别。本文在基于LDA(潜在狄利克雷分配)主题模型提出一种DNA序列主题特征表示方法,将基因序列转换为一组多个主题呈现度的概率向量。基于这种新的特征表示方法,构造了一种k-NN分类器对DNA序列进行分类。实验结果表明,新型特征表示方法提高了表示模型的学习效率,并且较为充分的反映DNA序列间的结构信息,从而有效提高了序列的分类精度。
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