首页 期刊 植物遗传资源学报 玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析 【正文】

玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析

作者:郭栋; 杜媚; 周宝元; 高卓晗; 曹哲统; 赵明 中国农业科学院作物科学研究所; 北京100081; 东北农业大学农学院; 哈尔滨150030; 河北北方学院农林科技学院; 张家口075000; 北京化工大学生命科学与技术学院; 北京100029
玉米   cct   生物信息学分析   蛋白结构  

摘要:CCT(CO、COL和TOC1)家族基因广泛参与植物花期的调控过程,对植物的生长与发育起着至关重要的作用。本研究以玉米为材料,共鉴定出57个CCT基因,命名为ZmCCT1~ZmCCT57,利用生物信息学方法开展玉米ZmCCTs基因的结构、氨基酸特点、染色体定位及基因进化分析,还与其他物种的CCT基因家族进行对比分析。结果表明,CCT基因家族在染色体上呈现不均匀分布,其中5号染色体分布最多(11个),3、7、10号等染色体分布最少(均只有3个)。CCT基因家族具有相对保守的结构,即每个基因都包含保守的CCT DNA结构,其他少数基因含有其他DNA结构,CCT蛋白的3 D结构含有1个α螺旋与3个β折叠。根据多物种CCT蛋白的进化树分析依据相似性将其分为8个分支,分析结果显示单子叶植物玉米与谷子、二穗短柄草CCT基因保守性更强,亲缘关系更近。本研究为进一步揭示玉米CCT基因家族的功能机制提供了相应的参考。

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