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北京市丰台区2016年-2017年肠道病毒A71型基因特征分析

作者:郑金梅; 尉秀霞; 王兆娥; 余红; 武晶; 封会茹 北京市丰台区疾病预防控制中心; 北京100071
手足口病   肠道病毒a组71型   vp1编码区   序列分析  

摘要:目的分析北京市丰台区2016年-2017年肠道病毒A组71型(EVA71)分离株VP1区的基因特征,为手足口病的防治提供参考。方法用荧光定量RT-PCR法对2016年-2017年丰台区手足口病患者咽拭子标本进行EVA71核酸检测和病毒分离,分离到的毒株进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析。结果2016年-2017年共分离到26株EVA71。核昔酸序列分析发现,26株EVA71的VP1区均有6个散在位点(43、58、164、184、240、249)存在共变异;23株EVA71的VP1区在145位氨基酸均为谷氨酸(Glutamic acid,Glu);6株EVA71的VP1区在293位氨基酸由丙氨酸突变为丝氨酸;核苛酸序列分析结果表明,26株EVA71与C4a亚型代表株核昔酸同源性最高(94.8%~98.3%)与C4亚型代表株处于同一分支,并在C4a进化分支的不同簇中。结论北京市丰台区EVA71分离株为C4亚型C4a进化分支。145位和293位氨基酸位点上氨基酸的改变对病毒的意义尚需进一步研究。

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