摘要：目的利用本实验室测定的中国地鼠、金黄地鼠和GenBank中田鼠、小鼠、大鼠的线粒体全基因组序列，比较分析五种啮齿类动物的mtDNA蛋白编码基因序列的变异，探讨其分子进化关系。方法将五种动物各自的13个蛋白编码基因分别连接成一个序列，用DNAstar—EditSeq分析软件计算每个序列的碱基长度和组成，计算蛋白编码基因的碱基和氨基酸的差异。以人为外群，基于连接在一起的13个蛋白编码基因的氨基酸序列，用MEGA4．0软件通过最大简约性法（MP）和非加权成对平均数法（UPGMA）构建进化树。结果在五种啮齿动物的13个蛋白基因序列中，A、T、C、G碱基的平均含量为32．4％、29．6％、26．2％和11．9％，中国地鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列与其他物种相比，与金黄地鼠的相应序列差异最小，与大鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列差异较大。分子进化树也显示中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近，与小鼠、大鼠存在的差异相对大。结论五种动物的碱基组成的百分比中显示G的相对缺乏，相互之间的进化关系与传统的分类地位基本吻合。

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