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深度学习在药物设计与发现中的应用

作者：李伟; 杨金才; 黄牛 刊期：2019年第05期

在新药创制的药物设计与发现所采用的多种技术中,深度学习仍处于初级阶段,但近年来以其独有的特点,开始应用于虚拟化合物库的生成,化合物活性、代谢和毒性的预测,以及有机合成反应预测等多个方面。与传统的机器学习方法相比,深度学习的预测能力无明显优势,但其无需人工归纳总结数据特征,而是具有学习能力,自动提取特征。与基于第一性原理的计算...

肠道益生菌A.muciniphila抗代谢性疾病的治疗学展望

作者：彭典; 胡卓伟; 张晓伟 刊期：2019年第05期

Akkermansia muciniphila (A. muciniphila)是2004年从人类粪便样品中分离得到的一种肠道细菌,其降解黏蛋白的特性使其成为维持肠道黏膜屏障的关键微生物。A. muciniphila作为疣微菌门唯一能被培养的肠道菌代表,在宏基因组分析中相对容易被检测到。尽管它被鉴定出来的时间不久,但近年来由于其肠道定殖与多种代谢性疾病的发生发展密切相关,迅速引...

赖氨酸乙酰化的研究进展及应用

作者：杨雨薇; 尚爽; 胡卓伟; 花芳 刊期：2019年第05期

蛋白质乙酰化是指在乙酰基转移酶的作用下,蛋白质的赖氨酸残基添加乙酰基的过程。它是连接乙酰辅酶A代谢与细胞信号转导的重要蛋白质翻译后修饰类型。近年来,质谱鉴定的发展提高了研究者对赖氨酸乙酰化的认识,赖氨酸乙酰化参与基因转录、蛋白降解、细胞代谢、应激反应等多个细胞过程,通过调节蛋白质相互作用、活性、稳定性和定位影响其生物学功...

肌萎缩性侧索硬化症非临床药效学评价体系的探索

作者：彭雨晨; 冯新红; 张泳; 黄龙舰; 赵春阳; 王晓良; 王庆利; 彭英 刊期：2019年第05期

肌萎缩性侧索硬化(amyotrophic lateral sclerosis, ALS)是运动神经元病的最常见类型,其发病机制尚不明确。近年来,对于ALS遗传基础的研究进展促进了各种ALS疾病模型的出现和发展,为ALS相关药物及治疗方法的筛选提供了多种选择。本综述主要介绍肌萎缩性侧索硬化症的相关研究进展,对典型的非临床动物模型药物筛选评价体系进行归纳,包括转基因动物...

中药复杂系统的“多源归一”理论假说

作者：向诚; 李勇; 李琨 刊期：2019年第05期

针对中药复杂系统表现出的一些特殊科学事实,本文提出了一个研究中药复杂系统整体性和多成分相互作用规律的'多源归一'理论假说,包括其概念、特征、结构层次和范围,并提出假说的基本模型——人工神经网络模型,以及检验假说可能的思路、技术方法和部分证据。希望该假说能对中药复杂系统的现代科学认识有所促进,进而对中药作用物质基础、复方配伍...

中药有效组分“配伍艺术”的研究基础--组分配比研究策略

作者：陈聪聪; 秦雪梅; 杜冠华; 周玉枝 刊期：2019年第05期

中药配伍包括药材配伍、有效部位配伍和有效成分配伍3个层次,相比于药材配伍,有效部位、有效成分之间的配伍更易于阐明中药药效物质基础及作用机制,成为中药配伍研究的突破点,为中药精准医疗体系下的精准用药提供了新的方法,势必将成为中药精准化进程的重要推动力。而有效部位、有效成分配伍隶属于中药有效组分配伍的范畴,为进一步探讨中药有效...

质谱技术在酶抑制剂筛选中的研究进展

作者：朱黎; 邹旋; 刘堂荣; 刘若男; 许哲 刊期：2019年第05期

酶是调控人体机能使机体进行正常生命活动的物质,酶抑制剂能特异性调节酶的活性并可能成为药物发现的起点。目前,质谱具有对酶反应进行快速定量分析的优势,使其在酶抑制剂筛选发现新药领域发展迅猛。本文综述了近几年国内外应用质谱以及质谱联用技术(前沿亲和色谱、固定化酶磁珠、超滤、表面等离子体共振、毛细管电泳和微流控芯片)筛选酶抑制剂...

糖尿病的代谢组学研究进展

作者：李信; 马海燕; 李鲁盼; 孙珊珊; 朱丽君; 刘玉峰 刊期：2019年第05期

糖尿病是一种发病率极高的代谢紊乱性疾病。随着糖尿病发病人数的逐年增加,其发病人群也呈现出年轻化趋势。因此,深入开展糖尿病研究工作迫在眉睫。近年来,代谢组学在糖尿病的生物标记物发现、发病机制探索、早期诊断及预后、药物疗效评价等方面的研究中取得了可喜的进展。但限于代谢组学技术的发展局限及糖尿病研究的复杂性,糖尿病的代谢组学研...

沙粒病毒进入宿主细胞阻断剂3,5,6,7,4’-五甲氧基黄酮的发现及机制研究

作者：唐克; 张晓雨; 陈勍; 郭颖 刊期：2019年第05期

沙粒病毒是有包膜的RNA病毒,现已知其家族中的8种病毒可致人出血热。除胡宁病毒疫苗外,目前尚无针对其他沙粒病毒的疫苗或特效药物批准上市。本研究是在首次发现黄酮类化合物桔皮素的抗沙粒病毒活性的基础上,从34个桔皮素类似物中发现并确认了3,5,6,7,4’-五甲氧基黄酮的抗拉沙病毒的活性(EC50:5.2μmol·L-1),并初步探讨了其构效关系。研究结果表...

金合欢素的降血脂及抗动脉粥样硬化作用及机制初探

作者：席梅; 邢建国; 王丽; 郑瑞芳; 杜郁; 洪斌 刊期：2019年第05期

本文旨在研究金合欢素对小鼠血脂代谢及动脉粥样硬化的影响并初步探索其作用机制。利用不同浓度的金合欢素处理人肝癌细胞HepG2后,采用RT-qPCR和Western blot方法分别检测LDLR mRNA水平和蛋白表达情况以及SREBP-2的蛋白表达情况。C57BL/6J小鼠给予金合欢素灌胃处理5周,全自动生化分析仪检测血清中总胆固醇(total cholesterol, TC)、低密度脂蛋白...

基于海分枝杆菌感染斑马鱼模型的抗结核药物评价方法研究

作者：杨国威; 彭世泽; 赵建元; 张永欣; 岑山 刊期：2019年第05期

结核病(tuberculosis, TB)是由结核分枝杆菌导致的一种严重感染性疾病。近年来随着耐药结核菌不断出现,发展新型抗结核药物迫在眉睫。本研究利用与结核分枝杆菌高度类似的海分枝杆菌为模式生物,建立了海分枝杆菌-斑马鱼幼鱼感染模型和细菌菌数定量PCR (quantitative PCR, qPCR)分析方法。研究表明,卵黄囊注射海分枝杆菌是一种高效、便捷的感染斑...

外泌体介导乳腺癌MCF-7细胞对多柔比星耐药性的机制

作者：张如月; 李朵璐; 杨哲; 郭金秀; 周玉冰 刊期：2019年第05期

桑叶有效组分对db/db小鼠肠道菌群的调节作用

作者：张立雯; 宿树兰; 戴新新; 魏丹丹; 朱悦; 钱大玮; 段金廒 刊期：2019年第05期

以自发性肥胖的糖尿病模型db/db小鼠为研究对象,在药效评价的基础上,通过16S rDNA测序的方法研究桑叶黄酮、多糖、生物碱对糖尿病小鼠的生物效应及其对肠道菌群的调节作用。动物实验通过了南京中医药大学伦理委员会审查, 10只db/m小鼠作为空白组(control), 40只db/db小鼠随机分为模型组(model)、二甲双胍组(metformin)、桑叶黄酮组(MF)、桑叶多...

基于网络药理学的二至丸对肾脏保护作用的机制研究

作者：庄莉; 翟园园; 姚卫峰; 徐佳; 冯丽; 包贝华; 曹雨诞; 张丽; 丁安伟 刊期：2019年第05期

采用网络药理学方法,基于反向药效团匹配的靶标识别服务平台,预测已有文献报道的二至丸保护肾脏药效成分的靶点,采用分子对接对靶点基因进行筛选分析,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因进行生物学过程及代谢通路分析,采用Cytoscape软件构建二至丸保护肾脏'成分-靶点-通路'网络。通过将上述靶点与疾病靶点数据库TTD和GAD筛选得到的肾损...

基于luciferin-luciferase体系的肼生物发光探针的合成、体外评价及活体成像

作者：徐峰; 海澳; 马雅茹; 仇丽颖; 李敏勇; 杜吕佩 刊期：2019年第05期

本文设计合成了一个用于可视化分析检测肼(N2H4)的生物发光探针(bioluminescent probe for hydrazine,BPH),并完成对其光学响应性能和活体成像的评价。本文所描述的肼生物发光探针(BPH)是通过在光学报告基团萤火虫荧光素(firefly luciferin)的适当修饰位点合理设计引入肼的特异性识别基团(乙酰基)以达到检测肼的目的,并且该探针以高选择性和高灵...